Geri Dön

Bioactivity characteristics of silver nanoparticles synthesized by Streptomyces sp. BSP1

Streptomyces sp. BSP1 tarafından sentezlenen gümüş nanopartiküllerinin biyoaktivite özellikleri

PDF İndir

  1. Tez No: 761936
  2. Yazar: HEBA MABROUK ELHADAD SHEHATA ZAHRAN HEBA MABROUK ELHADAD SHEHATA ZAHRAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HİLAL AY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Nanobilim ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 52

Özet

Actinobacteria üyeleri, çeşitli biyoaktif metabolitleri üretmelerinden dolayı en üretken mikrobiyal gruplardan biri olarak kabul edilmektedir. Özellikle endofitik aktinobakteriler, indirgeme aktivitesi ile nanopartikül sentezini kolaylaştıran proteinleri, enzimleri ve sekonder metabolitleri yüksek düzeyde salgılamaları ile karakterize edilmektedir. Bu tez çalışmasında, daha önce yapılan bir çalışmada bir baklagil nodülünden izole edilmiş olan Streptomyces sp. BSP1 kullanılarak gümüş nanopartikülleri sentezlenmiştir. Sentezlenen gümüş nanopartikülleri UV-vis spektroskopi, FTIR, XRD, SEM ve EDX analizleri ile doğrulanmıştır. UV-vis spektrum analizinde 439 nm'de maksimum absorbans gözlenmiştir. SEM analizi, sentezlenen nanopartiküllerin düzenli küresel biçimde ve ortalama 7.7-15.3 nm boyutta olduğunu göstermiştir. XRD analizi, sentezlenen gümüş nanopartiküllerinin kristal yapıda olduğunu ortaya çıkarmıştır. Ayrıca, Streptomyces sp. BSP1'in tüm genom dizisi NCBI GenBank'tan indirilerek kapsamlı genom analizi yapılmıştır. Streptomyces sp. BSP1'in genom dizisi RAST sunucusunda (https://rast.nmpdr.org/rast.cgi) annote edilmiş ve genom büyüklüğünün 7.4 Mb, GC içeriğinin %73.1 olduğu tespit edilmiştir. Genomda protein kodlayan 6868, RNA kodlayan 76 dizi bulunmaktadır. Filogenetik açıdan Streptomyces sp. BSP1'in karşılaştırmalı genom analizi TYGS sunucusunda (https://tygs.dsmz.de/) gerçekleştirilmiştir. Streptomyces sp. BSP1'in Streptomyces albidoflavus NRRL B-1271 ile yakın ilişkili olduğu ve bu tür ile en yüksek DNA-DNA hibridizasyon değerinin %65.2 olduğu tespit edilmiş olup bu değer genomik türleri sınırlandırmak için kullanılan %70 değerinden düşüktür. Ayrıca, sekonder metabolit kodlayan biyosentetik gen kümelerini tespit etmek amacıyla kapsamlı bir genom analizi antiSMASH sunucusunda (https://antismash.secondarymetabolites.org/#!/start) gerçekleştirilmiştir. Streptomyces sp. BSP1'in tüm genom dizisi terpen, poliketid sentaz, ribozomal olmayan polipeptid sentetaz, lantipeptid, tiyopeptid ve siderofor kodlayan gen kümeleri içermektedir. Antimikrobiyal aktivite testi, Streptomyces sp. BSP1 tarafından sentezlenen gümüş nanopartiküllerinin Bacillus cereus EMC15 ve Candida albicans ATCC 10231'in gelişimini inhibe ettiğini göstermiştir. Sonuç olarak, Streptomyces sp. BSP1 tarafından sentezlenen gümüş nanopartiküllerinin farmasötik endüstride kullanım alanı olabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

The members of the phylum Actinobacteria are considered one of the most prolific microbial groups because of their high potential for synthesis of various bioactive metabolites. Especially endophytic actinobacteria are characterized by high secretion of proteins, enzymes and secondary metabolites that promote nanoparticle synthesis by reducing activity. In this thesis study, Streptomyces sp. BSP1 strain isolated from a legume nodule in a previous study was used to synthesize silver nanoparticles. The synthesized silver nanoparticles were confirmed by UV-vis spectroscopy, FTIR, XRD, SEM and EDX analyses. The UV-vis spectrum analysis exhibited maximum absorbance peak at 439 nm. The SEM analysis showed that the nanoparticles have regular spherical shapes and their average size ranges between 7.7 nm and 15.3 nm. The XRD analysis revealed that the synthesized silver nanoparticles have crystalline structure. In addition, the whole genome sequence of Streptomyces sp. BSP1 was downloaded from the NCBI GenBank to conduct a comprehensive genome analysis. The genome sequence of Streptomyces sp. BSP1 was annotated on the RAST server (https://rast.nmpdr.org/rast.cgi) and found to be about 7.4 Mb with 73.1% GC content. The number of protein coding sequences and RNAs were determined as 6868 and 76, respectively. From a phylogenetical point of view, the comparative genome analysis of Streptomyces sp. BSP1 performed on the TYGS (https://tygs.dsmz.de/) revealed that Streptomyces sp. BSP1 was closely related to Streptomyces albidoflavus NRRL B-1271 by sharing the highest digital DNA- DNA hybridization value of 65.2%, which is lower than the threshold value of 70% to delineate genomic species. Moreover, a comprehensive genome analysis was performed on the antiSMASH server (https://antismash.secondarymetabolites.org/#!/start) to reveal the biosynthetic gene clusters for secondary metabolites. The genome of Streptomyces sp. BSP1 has gene clusters encoding for terpenes, polyketide synthases, non-ribosomal peptide synthetases, lanthipeptides, thiopeptides and siderophores. The antimicrobial activity analysis showed that the silver nanoparticles synthesized by Streptomyces sp. BSP1 inhibited the growth of Bacillus cereus EMC15 and Candida albicans ATCC 10231. Consequently, it is considered that the silver nanoparticles synthesized by Streptomyces sp. BSP1 may have applications in pharmaceutical industry.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    591214

    Biyolojik yollar ile sentezlenen organik/inorganik nanopartiküllerin biyoaktivitelerinin belirlenmesi ve tedavi amaçlı kullanımları

    Determination of bioactivities of organic/inorganic nanoparticles synthesized by biological pathway their therapeuti̇c uses

    HAMIDEH HAMMAMCHI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLÜFER CİHANGİR

    PROF. DR. REYHAN NESLİHAN GÜRSOY

  2. Tez No

    736336

    Thermal oxidation of titanium-based cold spray coatings for biological and wear-related applications

    Biyolojik ve aşınmaya yönelik uygulamalar için soğuk dinamik gaz püskürtme tekniği ile üretilmiş titanyum bazlı kaplamaların termal oksidasyonu

    DOĞUKAN ÇETİNER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ÇİMENOĞLU

    PROF. DR. ERDEM ATAR

  3. Tez No

    654294

    Ticari saflıkta titanyum üzerinde antibakteriyel bazlı biyoaktif ve biyouyumlu yüzeylerin üretilmesi ve özelliklerininaraştırılması

    Manufacturing and research the characteristics of antibacterial-based bioactive and bio-compatible surfaces on commercial pure titanium

    AHMET ARSLANTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Makine MühendisliğiGiresun Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SALİH DURDU

  4. Tez No

    389459

    Biyomedikal uygulamalar için ASTM F75 kobalt-krom alaşımının yüzey modifikasyonu

    Surface modification of ASTM F75 cobalt-chromium alloy for biomedical applications

    DOĞUKAN ÇETİNER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ÇİMENOĞLU

    DOÇ. DR. ERDEM ATAR

  5. Tez No

    421116

    45S5 bileşimine sahip ve bakır katkılı biyoaktif camlardan üç boyutlu kompozit yapı iskelesi üretimi ve karakterizasyonu

    Fabrication and characterization of three dimensional composite scaffolds from 45S5 and copper doped bioactive glasses

    NURAY YERLİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SADRİYE OSKAY

Geri Dön