Geri Dön

Molecular evaluation of summer squash (Cucurbita pepo L.) germplasm for zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) resistance

Yazlık kabak (Cucurbita pepo L.) germplazmının kabak sarı mozaik virüsü (ZYMV) dayanıklılığı açısından moleküler olarak değerlendirilmesi

  1. Tez No: 772128
  2. Yazar: GİZEM GİRGİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZGE KARAKAŞ METİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomoleküler Bilimler Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 70

Özet

Yaz Kabağı (Cucurbita pepo L.) kolay yetişebilen bir çok açıdan özellikle ticari olarak değerli bir bitkidir. Fakat kabağı enfekte eden Kabak Sarı Mozaik Virüsü (ZYMV) sebebiyle önemli derecede ürün kaybı yaşanmaktadır. Çünkü virüs bulaşan kabak da çeşitli semptomlar gözlenir bunlardan biri bitkinin bodur kalması, meyvesinde ve yapraklarında dengeli olmayan yüzey rengi, yumrulu bölgeler ortaya çıkar. Öyleki bu ürün kaybı %95 kadar ulaşılabilir. (ZYMV) Kabak Sarı Mozaik Virüsü, yaprak biti vektörü sayesinde bitkiye taşınır. Yaprak biti vektörlerini denetim altına almak için uygulanan kimyasallar enfeksiyonu engellemekte yetersizdir. Virüsü kontrol edebilmek için seçilen diğer yöntem klasik ıslah. Bu yötemle virüse karşı dayanıklı bitkilerin elit genotiplerini belirlenir, fakat klasik ıslah yöntemi zaman isteyen bir yöntemdir. Klasik ıslah'ın yerini (MAS) markırlar yardımıyla seleksiyon almıştır bunun sebebi tanımlanması gereken karakterlerin ilişkisi olan genleri rahatça ayırt edebilen moleküler markırların kullanılmasına dayanan önemli yöntemdir. Bu çalışma çerçevesinde polimeraz zincir reaksiyona dayalı SSR basit dizi tekrarları markırları önemli özelliklerinden dolayı öncelik tanınmıştır. SSR belirteçleri, maliyet, hız en önemlisi güvenirlik gibi üstünlüklere sahiptir. Bu çalışmada 20 bağlantı grubunun içinden 60 SSR belirteci (Gong et al., 2008) seçilmiştir. Seçilen belirteçler hastalığa karşı dayanıklı bireylerin, hassas bireylerden ayırmak için olanak sağlayacaktır. Çalışmada Trakya Tarımsal Araştırma Enstitüsünde Cucurbita pepo L. genotipine sahip anaç bireyler ve dayanıklı hatlarla çaprazlanan F2 bireyleri elde edilmiştir. Seçilen SSR kullanılarak elimizdeki bireyler ZYMV dayanıklılık açısından genotiplerindeki polimorfizmler değerlendirildi. Polimorfik belirteçler CMTp131, CMTp142, CMTm66, CMTp190 olarak tespit edildi. Bu belirteçlerin, Kabak Sarı Mozaik Virüsü ( ZYMV) direnci sağlayan genlerle ilişkili olabileceği belirlendi. Elde ettiğimiz verilerle belirlediğimiz yazlık kabak (Cucurbita pepo L.) genotipleri potansiyel olarak ıslah programları için kullanabilirlik göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Summer Squash (Cucurbita pepo L.) is an easily grown commercially valuable plant in many respects. However, due to the Zucchini Yellow Mosaic Virus, which infects the pumpkin, there is a significant loss of product. Because various symptoms are observed in the infected zucchini, one of which is the stunting of the plant, unbalanced surface color on the fruit and leaves, and tuberous areas. So that this product loss can be reached up to 95%. ZYMV is carried to the plant by the aphid vector. Chemicals applied to check aphid vectors are insufficient to prevent infection. The other method chosen to control the virus is classical breeding. Therefore this method, elite genotypes of virus-resistant plants are determined, but the classical breeding method is time-consuming. Classical breeding (MAS) has been replaced by selection with the help of markers because it is a crucial method based on the application of molecular markers that can easily distinguish the genes related to the characters to be defined. In this study, SSR simple sequence repeat markers based on polymerase chain reaction were given priority because of their important properties. SSR markers have advantages such as cost, speed, and most importantly, reliability. In this study, 60 SSR markers (Gong et al., 2008) were selected from 20 linkage groups. Selected markers will allow distinguish resistant individuals from susceptible individuals. In the frame of this proposal parental individuals with Cucurbita pepo L. genotype and F2 individuals crossed with resistant lines were obtained in Thrace Agricultural Research Institute. By using the selected SSR, polymorphisms in the genotypes of the individuals were evaluated in terms of ZYMV resistance. Polymorphic markers were detected as CMTp131, CMTp142, CMTm66, and CMTp190. It was determined that these markers may be related to the genes that provide the ZYMV resistance genotype. Cucurbita pepo L. genotypes that are determined with the data we have obtained can potentially be used for breeding programs.

Benzer Tezler

  1. Bazı yazlık ekmeklik buğday çeşitlerinde genetik farklılığın ssr markörleriyle belirlenmesi

    Determination of genetic diversity of summer bread wheat varieties using ssr markers

    MERVE DİLEK GEBOLOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET ALP FURAN

  2. Bingöl ve Malatya illerinde elma seleksiyonu ve yörenin kırsal kalkınması üzerine etkilerinin belirlenmesi

    Apple selection Bingöl and Malatya provincies and determining effects of the region on rural development

    ALİ RECEP NAZLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYZİN KÜDEN

  3. Erzurum ve yöresinde 2010-2020 yılları arasında gastrointestinal şikâyeti olan 0-17 yaş olguların epidemiyolojik yönden değerlendirilmesi

    Epidemiological evaluation of 0-17 years old cases with gastrointestinal complaints between 2010-2020 in Erzurum and its region

    BAHAR ÇİMEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN AKTAŞ

  4. Meriç deltasının genotoksik potansiyelinin umu test sistemi ile Salmonella typhimurium TA1535/pSK1002, NM2009 ve NM3009 suşları kullanılarak araştırılması

    Investigation of genotoxic potential of Meriç delta with the umu test system by using Salmonella typhimurium TA1535/pSK1002, NM2009 and NM3009 strains

    SİNEM KAMBUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MÜBECCEL DURUSOY

  5. PAH tanı oranları uygulaması ile Bolkar dağları Alpin gölleri'nde antropojenik etkilerin belirlenmesi

    Determination of anthropogenic effects in Alpine lakes of Bolkar mountains by application of PAH diagnostic ratios

    İMRAN EREN ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Deniz Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gemi ve Deniz Teknoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEVİL DENİZ YAKAN DÜNDAR