Malign melanoma hücre hattı ve malign melanoma kanser kök hücre hattında asetilasyon mekanizmasının karşılaştırmalı incelenmesi
Comparative investigation of acetylation mechanism in malignant melanoma cell line and malignant melanoma cancer stem cell line
- Tez No: 775171
- Danışmanlar: PROF. DR. HÜSEYİN AKTUĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Histoloji ve Embriyoloji, Histology and Embryology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Melanom, metastatik fazda artış gösteren ve kötü prognoz oluşturaran agresif bir tümördür. Sağlıklı kök hücrelerin kendi kendini yenileme, doku onarımı ve diferansiye olmasını düzenleyen epigenetik programların bozulmaktadır. Bozulan epigenetik mekanizma sonucunda hücrelerde küçük bir kanser alt kümeleri olan kanser kök hücreleri (KKH) oluşmaktadır. Melanomda artan tümör, malignitenin oluşumunda ve diğer dokulara yayılımında etkilidir. Malign melanom (MM), mortalitesi yüksek bir kanser türü olduğu için, KKH'nin genetik yapısında oluşturulabilecek değişiklikler hastalığın ilerleyişinde etkili olabilir. Çalışmamızda malign melanom hücre hattı (CHL-1) kullanılmıştır. Bu hücre hattından izole ederek elde ettiğimiz malign melanom kanser kök hücre grubu (CD133+) ve kök hücre olmayan malign melanom hücre grubu (CD133-) kullanılmıştır. Hücreler 4, 6 ve 24. saatlerde fikse edilerek kullanılmıştır. Bu hücre hatlarında, histon asetilasyonu için P300, deasetilasyonu için HDAC9 proteinlerinin ekspresyon seviyeleri bakılmıştır. Hücre içi iskelet yapılarını incelemek için F-aktin proteini incelenmiştir. Hücrelerin migrasyon özelliklerini incelemek için Scratch assay (migrasyon) ve hücre bölünme hızı bakılmıştır. Hücreler 4. 6. ve 24. saatlerde sabitlenmiş ve protein ekspresyonları karşılaştırılmıştır. P300 protein seviyesi artan süre zarfında, CHL-1 ve CD133+ hücre grubunda neredeyse aynı seviyede eksprese olurken (p>0.05). CD133- hücre grubunda artan ekspresyon seviyesi görülmüştür (p>0.05). HDAC9 protein seviyesinde artan süre zarfında, CHL-1 ve CD133+ hücre grubunda istatistiksel bir azalma gözlenmiş olup (p0.05) en fazla artış CHL-1 de gözlenmiştir. Bu çalışmadaki amacımız; malign melanom kanser hücre grubu ve malign melanom kanser kök hücre grubunda, epigenetik açıdan önemli olan histon asetilasyon ve deasetilasyon mekanizmasında kullanılan HDAC9 ve P300 protein seviyelerini belirlemek ve arasında karşılaştırma yapmaktır. Aynı zamanda gruplar, hücre dinamiğinin farklarınının belirlenmesi için F-aktin hucre iskelet elemanı odaklı incelenmiştir.
Özet (Çeviri)
Melanoma is an aggressive tumor that increases in the metastatic phase and has a poor prognosis. Epigenetic programs that regulate the self-renewal, tissue repair and differentiation of healthy stem cells are disrupted. As a result of the disrupted epigenetic mechanism, cancer stem cells (CSC's), a small cancer subset, are formed in the cells. Increasing tumor in melanoma is effective in the formation of malignancy and its spread to other tissues. Since malignant melanoma (MM) is a cancer type with a high mortality, changes in the genetic structure of CSC's may be effective in the progression of the disease. The malignant melanoma cell line (CHL-1) was used in our study. Malignant melanoma cancer stem cell group (CD133+) and non-stem cell malignant melanoma cell group (CD133-), which we isolated from this cell line, were used. Cells were fixed at 4, 6 and 24 hours and used. In these cell lines, expression levels of P300 for histone acetylation and HDAC9 for deacetylation were examined. The F-actin protein was examined to examine the intracellular skeletal structures. Scratch assay (migration) and cell division rate were examined to examine the migration properties of cells. Cells were fixed at 4, 6 and 24 hours and protein expressions were compared. P300 protein level was expressed almost at the same level in the CHL-1 and CD133+ cell group during the increasing time (p>0.05). An increased expression level was observed in the CD133- cell group (p>0.05). During the increased time in HDAC9 protein level, a statistical decrease was observed in the CHL-1 and CD133+ cell group (p0.05), and the highest increase was observed in CHL-1. Our aim in this study; The aim of this study is to determine the HDAC9 and P300 protein levels used in the epigenetically important histone acetylation and deacetylation mechanism in the malignant melanoma cancer cell group and malignant melanoma cancer stem cell group and to make a comparison between them. At the same time, the groups were studied with a focus on the F-actin cytoskeleton element to determine the differences in cell dynamics.
Benzer Tezler
- Kojik asit türevi mannich bazlarının sentezi ve insan melanoma hücrelerine etkisi ile antitirozinaz aktivitelerinin araştırılması
Synthesis of mannich bases of kojic acid and research of their antityrosinase activity and effects on human melanoma cells
GÜLŞAH KARAKAYA
Doktora
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUTLU AYTEMİR
- Bazı tıbbi bitki ve mantar ekstrelerinin insan melanoma hücreleri üzerine etkileri
Effects of some medicinal plant and mushroom extracts on human melanoma cells
FATMA AYDOĞMUŞ ÖZTÜRK
Doktora
Türkçe
2017
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KERİMAN GÜNAYDIN
PROF. DR. ŞULE ARI
- Hatay bölgesinde bazı tıbbi bitkilerin çeşitli kanser hücre hatları üzerinde antikanserojen aktivitelerinin araştırılması
Investigation of anticancerogene activities of some medical plants on various cancer cell lines in Hatay region
EMRAH AY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİZAMİ DURAN
- B16F10 malign melanoma hücrelerinde flavopiridol ve oksaliplatin'in ve bu hücrelerin aktarıldığı C57Bl6 farelerinde flavopiridol'ün apoptoz sinyal yolağına etkileri
The apoptotic effects of flavopiridol combined with oxaliplatin on B16F10 malignant melanoma cells and in vivo effects of alone on B16F10 inoculated C57Bl6 mice
ÖZLEM GÖKÇE
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Tıbbi BiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDULLAH EKMEKÇİ
- SK-MEL-30 hücre hattında NRAS geni Q61K mutasyonuna CRISPR/Cas9 tekniğinin uygulanması
Application of CRISPR/Cas9 technique to the nras gene Q61K mutation in SK-MEL-30 cell line
TUĞÇE DURAN