Geri Dön

Patlıcan türlerarası ıslah generasyonlarında Fusarium oxysporum f. sp. melongenae toleransının ve gen etkileşimlerinin RNA dizileme analizi ile belirlenmesi

Determination of Fusarium oxysporum f. sp. to melongenae tolerance and gene interactions in eggplant inter species breeding generations by RNA sequencing analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 779106
  2. Yazar: MERVE DİLEK KARATAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ALİ ERGÜL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 153

Özet

Fusarium oxysporum melongenae patlıcanda verimliliği etkileyen biyotik faktörlerden birisidir. Bu tez çalışması kültür türünde bulunmayan bu patojen dayanıklılığını; türler arası melezlemelerle sonraki generasyonlara geçirebilmek, bu generasyonlarda meydana gelen transkripsiyonel düzenlemeler hakkında bilgi edinebilmek amacı ile yapılmıştır. Solanum melongena ve Solanum macrocarpon türleri melezlenmiş; sonrasında kendilemeler yapılarak F2 generasyonu elde edilmiştir. Ana – baba - F1 - F2 generasyonlarında patolojik testlemeler yapıldıktan sonra RNA sekanslama ile transkriptom analizi gerçekleştirilmiştir. Elde edilen transkriptler ile generasyonlar boyu, hassas-dayanıklı örnekler arasında karşılaştırmalar yapılmış ortak genler belirlenmiştir. Toplamda 70195 unigen tespit edilmiştir. Gen ontoloji analizi ile katalitik aktivite, hücresel süreç, metabolik süreç gibi biyolojik işlemlerin Fusarium oxysporum melongenae patojenine dayanıklılıkta, örnekler arasında farklı şekillerde düzenlendiği belirlenmiştir. Sonuç olarak bu çalışma ile türler arası melezleme ve sonraki generasyonda bitki yapraklarından karşılaştırılabilir bir transkriptom yanıtı elde edilmiştir. Bu RNA dizileme analizi ile elde edilen verilerin patlıcandaki ıslah çalışmalarına önemli ölçüde katkı sağlayacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Fusarium oxysporum melongenae is one of the biotic factors affecting productivity in eggplant. The aim of this thesis was to transfer this pathogen resistance, which is not found in cultivated species, to the next generations by interspecific crosses and to obtain information about the transcriptional regulations occurring in these generations. Solanum melongena and Solanum macrocarpon species were crossed and then F2 generation was obtained by selfing. After pathological tests were performed in the parent - F1 - F2 generations, transcriptome analysis was performed by RNA sequencing. With the transcripts obtained, comparisons were made between susceptible and resistant samples across generations and common genes were identified. A total of 70195 unigenes were identified. Gene ontology analysis revealed that biological processes such as catalytic activity, cellular process, metabolic process are regulated differently among the samples in resistance to Fusarium oxysporum melongenae pathogen. As a result, a comparable transcriptome response was obtained from plant leaves in interspecific hybridization and subsequent generations. It is thought that the data obtained by this RNA sequencing analysis will contribute significantly to breeding studies in eggplant.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    819063

    Patlıcanda anaç ve hat ıslahı için solanum melongena ile akraba türleri arasında melezleme olanaklarının belirlenmesi

    Determination of hybridation possibilities between solanum melongena and wild relatives for rootstock and li̇ne breeding

    SEVTAP DOKSÖZ BONCUKÇU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAİF GEBOLOĞLU

  2. Tez No

    575790

    Aşılı patlıcan üretiminde genetik kaynakların anaç ıslah programında değerlendirilmesi ve yerli hibrit anaçların geliştirilmesi

    Evaluation of genetic resources in rootstock breeding program for grafted eggplant production and development of new local hybrid rootstocks

    HATİCE ŞEYMA SARIBAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET BALKAYA

  3. Tez No

    629382

    Yarı-yol materyali oluşturulması amacıyla farklı patlıcan türlerinin melezlenebilirliğinin araştırılması

    Investigation of the crossability of different eggplant species for obtaining different breeding populations

    BETÜL MERVE BAYIROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEBAHATTİN ÇÜRÜK

  4. Tez No

    606640

    Patlıcanda Solanum melongena × Solanum torvum melez populasyonlarının oluşturulma olanaklarının araştırılması ve patlıcan anaçlarında androgenesis yoluyla dihaploidizasyon

    Investigation of the possibilities of creating fertile Solanum melongena × Solanum torvum hybrid populations in eggplant and dihaploidization through androgenesis in eggplant rootstocks

    ATİLLA ATA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATIRA TAŞKIN

  5. Tez No

    532331

    Akdeniz ve Ege Bölgesi'nde biber yetiştiriciliği yapılan alanlarda fusarium solgunluk hastalığının yaygınlığı ve etmenin moleküler karakterizasyonu

    Prevalence of fusarium wilt disease and molecular characterization in the fields grown pepper in the Aegean and Mediterranean Regions of Turkey

    GAMZE YÜKSEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HACER HANDAN ALTINOK

Geri Dön