Geri Dön

Detection of antibiotic resistance genes among Enterobacteriaceae isolated from clinical and different sites closed of Iraqi hospitals

Irak hastanelerinin yakınındaki klinik ve farklı bölgelerden izole edilen Enterobacteriaceae'lerde antibiyotik direnç genlerinin tespiti

PDF İndir

  1. Tez No: 781132
  2. Yazar: RASHA ALI HUSSEIN AL-KHAFAJI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA KARAHAN, PROF. DR. LABEEB AHMED KADHİM JEWAD AL-ZUBAIDI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Enterobacteriaceae saf izolatlarını elde etmek, antibiyotiklere duyarlılığı değerlendirmek ve direnç genlerini belirlemek için Bağdat ilindeki birden fazla laboratuvardan 80 klinik izolat ve Dicle Nehri yakınlarından 54 çevresel izolat olmak üzere toplam 134 klinik izolat toplandı. Numuneler, Kasım 2021'den Nisan 2022'ye kadar 6 ay boyunca toplandı ve incelendi. Her izolat, morfolojik ve biyokimyasal sistem doğrulama testleri ve VITEK-2 kullanılarak tanımlandı. Çevresel sonuçlar Escherichia coli %44,44, Klebsiella pneumoniae %31,48, Proteus mirabilis %7,40, Citrobacter freundii %1,85, Citrobacter koseri %1,85, Enterobacter aerogenes %12,96 gösterirken, klinik sonuçlar E. coli %33, K. pneumoniae %28, P. mirabilis %19 olarak bulundu. Antibiyotik duyarlılık testi sonuçları, klinik 47 izolatta Penisilin, Amoksisilin, Sefaleksin, Seftazidim ve Tetrasiklin'e %100 ve sırasıyla Amoksisilin-klavulanik asit %80,85, Cefotaksim %65,95, Cefixime 59,57, Sefoksitin %57,44, Aztreonam %61,7 oranında dirençli olduğunu göstermiştir. Tüm izolatlar Meropenem'e %10,6 ve Impenem'e ise %14,89 oranında duyarlılık göstermiştir. Öte yandan, çevresel 22 izolat için yapılan antibiyotik duyarlılık testi sonuçlarında Penisilin, Amoksisilin, Sefaleksin, Seftazidim ve Tetrasiklin'e %100, Amoksisilin-klavulanik asit %77,27, Cefotaksim %77,2, Cefixime %63,63, Sefoksitin %59,09, Aztreonam'a %54,5 oranında dirençli olduğunu ortaya çıkmıştır. Tüm izolatlar Meropenem'e %18,18 oranında duyarlı iken, bu oran Impenem için %13.6 olarak bulunmuştur. DNA dizisinin PCR ile replikasyonu, Enterobacteriaceae'nin 69 klinik ve çevresel izolatı için gerçekleştirilmiştir. Sonuçlar, çevresel izolatlar için tüm izolatların %40,47 oranında blaTEM ve blaSHV geni içerdiğini göstermiştir. 47 klinik izolatta (blaTEM) gen oranı %85,10 ve blaSHV %82,97 iken, sonuçlar E. coli'nin blaTEM genini 15 (%31,91), K. pneumoniae'nin 14 (%29,78) ve P. mirabilis'in 11 (%23,40) şeklinde içerdiğini göstermiştir. blaSHV E. coli için 14 (%29.78), K. pneumonia 14 (%29.78) ve P. mirabilis 11 (%23.40) olarak tespit edilmiştir. Bulgulara göre, klinik izolatlar çevresel izolatlardan daha büyük bir virülans faktörüne sahiptir. Bunun nedeni, çevresel izolatlardan daha yüksek oranlarda direnç genlerine (blaTEM ve blaSHV) sahip olmalarıdır.

Özet (Çeviri)

For the purpose of obtaining pure isolates of the Enterobacteriaceae and for the evaluation of sensitivity to antibiotics and identification of resistance genes, a total of 134 clinical isolates were collected, 80 clinical isolates from multiple laboratories in Baghdad and 54 environmental isolates from nearby Tigris River. Samples were collected and studied during 6 months for the period from November 2021 to April 2022. Each isolate was identified using morphological, biochemical, and VITEK-2 System confirmatory tests. Where the environmental results showed Eschericha coli was a rate 44.44%, Klebsiella pneumoniae 31.48%, Proteus mirabilis 7.40%, Citrobacter freundii 1.85%, Citrobacter koseri 1.85%, Enterobacter aerogenes 12.96%. While the clinical results showed E. coli 33%, K. pneumoniae 28%, P. mirabilis 19%. The Antibiotic susceptibility test results indicated that all clinical 47 bacteria were unsusceptible to Penicillin, Amoxicillin, Cephalexin, Ceftazidime and Tetracycline by 100%, Amoxicillin–clavulanic acid 80.85%, Cefotaxime 65.95%, Cefixime 59.57, Cefoxitin 57.44%, Aztreonam 61.7%. While all isolates were sensitive to Meropenem 10.6% and Impenem 14.89%. On the other hand, the Antibiotic susceptibility test results for environmental 22 bacteria revealed unsusceptible to Penicillin, amoxicillin, Cephalexin, Ceftazidime, and Tetracycline by 100% Amoxicillin-clavulanic acid 77.27%, Cefotaxime 77.2%, Cefixime 63.63%, Cefoxitin 59.09%, Aztreonam 54.5% while all isolates were sensitive to Meropenem was rate 18.18% and Impenem 13.6%. Replication of the DNA sequence by PCR was performed for 69 clinical and environmental isolates of Enterobacteriaceae. The results showed that for the environmental isolates, all isolates contained the gene blaTEM and the blaSHV at a rate of 40.47%. While the 47 clinical isolates, all isolates contained the gene blaTEM was rate 85.10% and blaSHV 82.97%. The results showed that E. coli contained the blaTEM gene by 15 (31.91 %), K. pneumoniae 14 (29.78%), and P. mirabilis 11 (23.40 %). blaSHV E. coli 14 (29.78%), K. pneumonia 14 (29.78%) and P. mirabilis 11 (23.40%). Based on the findings, clinical isolates had a greater virulence factor than environmental isolates. This is so because they have resistance genes (blaTEM and the blaSHV) at higher rates than environmental isolates

Benzer Tezler

  1. Tez No

    346659

    Çoklu dirençli Escherıchıa colı izolatlarında CTX-M, SHV ve TEM tiplerindeki beta-laktamaz direnç genlerinin moleküler yöntemlerle saptanması

    Molecular detection of CTX-M, SHV and TEM types of betalactamase resistance genes in multiple resistant Escherichia coli isolates

    MÜNEVVER GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL BAL

  2. Tez No

    406927

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen gram negatif enterik bakterilerde karbapenemaz varlığının ve tiplerinin araştırılması

    Prevalance and genetic evaluation of carbapenemase production among gram-negative enteric bacteria isolated from various human clinical specimens

    HÜSEYİN HAYDAR KUTLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EBRU US

  3. Tez No

    478920

    Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen enterobacter ve proteus suşlarında integron taşıyıcılığının belirlenmesi

    Determination of integron carriage in enterobacter and proteus strains that isolated from intensive care units

    BÜŞRA KIR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiGiresun Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞAHİN DİREKEL

  4. Tez No

    496765

    Kan kültürlerinden izole edilen karbapenem dirençli enterobacterıaceae suşlarında karbapenem direnç genleri ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    HARUN REŞİD SU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZGE TURHAN

  5. Tez No

    157977

    Hastane infeksiyonu etkeni olan Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında plazmid kökenli AmpC beta-laktamaz varlığının araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    AYŞE İSTANBULLU TOSUN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. KEMAL ALTAŞ

Geri Dön