Determination of the genetic structure of Pseudomonas aeruginosa isolated from Ramadi population/Iraq by using RAPD-PCR
Ramadi popülasyonundan/Irak'tan izole edilen Pseudomonas aeruginosa'nın genetik yapısının RAPD-PCR ile belirlenmesi
- Tez No: 781895
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT, DR. ÖĞR. ÜYESİ NAJEEB MOHAMMED HUSSEIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 79
Özet
Ramadi'deki iki Ramadi Eğitim Hastanesindeki hastalardan toplam 100 örnek alınmıştır. Bu örnekler, hastalıklarının kökenlerine bağlı olarak hastalardan toplanmıştır. İzolatlar yaralardan, kulak enfeksiyonlarından ve idrar yolu enfeksiyonlarından elde edilmiştir. Zenginleştirme, seçici besiyeri ve biyokimyasal testler kullanılarak 75 P. aeruginosa karakterize edilmiş ve tanımlanmıştır. 12 P. aeruginosa izolatının genomik DNA'sı bu çeşitli kaynaklardan ekstrakte edilmiş ve bu genomik DNA örneklerinin konsantrasyonu ve saflığının RAPD-PCR analizi için yeterli olduğu belirlenmiştir. İki primer ile amplifikasyon işlemi 27 bant üretmiş ve bunların 24'ü polimorfiktir ve boyutları 250 ile 1500 bç arasında değişmektedir. 12 P. aeruginosa izolatı arasındaki filogenetik bağlantı dendrogramı 24 polimorfik RAPD markerı kullanılarak oluşturulmuştur, farklı P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik mesafe ve küme analizi bir Jaccard benzerlik matrisi kullanılarak tahmin edilmiş ve filogenetik ağaç oluşturmak için UPGMA bilgisayar programı kullanılmıştır. RAPD-PCR bantlama modellerine dayanarak izolatlar iki birincil grup genotipinde kategorize elde edilmiştir. Sonuçlar, RAPD-PCR analizinin P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik varyasyonu saptamak için iyi bir epidemiyolojik tarama yöntemi olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Totally 100 samples were taken from patients at two Ramadi Teaching Hospitals in Ramadi. These samples were collected from patients depending on the origins of their illnesses. The isolates were obtained from wounds, ear infections, and urine infections. The 75 samples of P. aeruginosa were characterized and identified by using enrichment, selective media, and biochemical testing. The genomic DNA of 12 P. aeruginosa isolates were extracted from these various sources and the concentration and purity of these genomic DNA samples were determined to be adequate for RAPD-PCR analysis. The amplification process with the two primers produced 27 bands and 24 of which were polymorphic and ranged in size from 250 to 1500 bp. The phylogenetic connection dendrogram among 12 P. aeruginosa isolates were constructed using 24 polymorphic RAPD markers, the genetic distance, and cluster analysis among different P. aeruginosa isolates were estimated by using a Jaccard matrix of similarity and analyzed by the UPGMA computer program to supply a phylogenetic tree. The results show the RAPD-PCR analysis is a good epidemiological screening method to detect genetic variation among P. aeruginosa isolates.
Benzer Tezler
- Ordu ekolojik koşullarında bazı kuru fasulye (Phaseolus vulgaris L.) çeşit ve genotiplerinin verim, verim öğeleri ile tohum ve teknolojik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of yield and components with seed and technological characteristics of some dry beans (Phaseolus vulgaris L.) varieties and genotypes on in ecological conditions of Ordu
YAŞAR ÖZBEKMEZ
- Besinsel liflere bağlı biyoaktif maddelerin antioksidan kapasitesi ve rejenerasyon davranışının quencher metoduyla belirlenmesi
Determination of antioxidant capacity and regeneration behaviour of bioactive materials bound to dietary fibers with quencher procedure
ECEM EVRİM ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VURAL GÖKMEN
- Çalışanların iş tatminini etkileyen faktörlerin belirlenmesi: Eğitim sektörü örneği
Factors affecting the determination of employee job satisfaction: The case of education sector
SONER YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
İşletmeGaziosmanpaşa Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN KARKACIER
- Bireysel başvuru çerçevesinde ifade özgürlüğü
Freedom of expression within the scope of the individual application
RECEP ÜNAL
- Tüberküloz tanısında cfp-10 ve esat-6 interferon gamma-elispot yanıtının değerlendirilmesi
Evaluation of ifn- γ response to cfp-10 and esat-6 antigens by elispot test in tuberculosis
FATİH ÇELMELİ
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2009
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAkdeniz ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OLCAY YEĞİN