Determination of the genetic structure of Pseudomonas aeruginosa isolated from Ramadi population/Iraq by using RAPD-PCR
Ramadi popülasyonundan/Irak'tan izole edilen Pseudomonas aeruginosa'nın genetik yapısının RAPD-PCR ile belirlenmesi
- Tez No: 781895
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT, DR. ÖĞR. ÜYESİ NAJEEB MOHAMMED HUSSEIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 79
Özet
Ramadi'deki iki Ramadi Eğitim Hastanesindeki hastalardan toplam 100 örnek alınmıştır. Bu örnekler, hastalıklarının kökenlerine bağlı olarak hastalardan toplanmıştır. İzolatlar yaralardan, kulak enfeksiyonlarından ve idrar yolu enfeksiyonlarından elde edilmiştir. Zenginleştirme, seçici besiyeri ve biyokimyasal testler kullanılarak 75 P. aeruginosa karakterize edilmiş ve tanımlanmıştır. 12 P. aeruginosa izolatının genomik DNA'sı bu çeşitli kaynaklardan ekstrakte edilmiş ve bu genomik DNA örneklerinin konsantrasyonu ve saflığının RAPD-PCR analizi için yeterli olduğu belirlenmiştir. İki primer ile amplifikasyon işlemi 27 bant üretmiş ve bunların 24'ü polimorfiktir ve boyutları 250 ile 1500 bç arasında değişmektedir. 12 P. aeruginosa izolatı arasındaki filogenetik bağlantı dendrogramı 24 polimorfik RAPD markerı kullanılarak oluşturulmuştur, farklı P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik mesafe ve küme analizi bir Jaccard benzerlik matrisi kullanılarak tahmin edilmiş ve filogenetik ağaç oluşturmak için UPGMA bilgisayar programı kullanılmıştır. RAPD-PCR bantlama modellerine dayanarak izolatlar iki birincil grup genotipinde kategorize elde edilmiştir. Sonuçlar, RAPD-PCR analizinin P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik varyasyonu saptamak için iyi bir epidemiyolojik tarama yöntemi olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Totally 100 samples were taken from patients at two Ramadi Teaching Hospitals in Ramadi. These samples were collected from patients depending on the origins of their illnesses. The isolates were obtained from wounds, ear infections, and urine infections. The 75 samples of P. aeruginosa were characterized and identified by using enrichment, selective media, and biochemical testing. The genomic DNA of 12 P. aeruginosa isolates were extracted from these various sources and the concentration and purity of these genomic DNA samples were determined to be adequate for RAPD-PCR analysis. The amplification process with the two primers produced 27 bands and 24 of which were polymorphic and ranged in size from 250 to 1500 bp. The phylogenetic connection dendrogram among 12 P. aeruginosa isolates were constructed using 24 polymorphic RAPD markers, the genetic distance, and cluster analysis among different P. aeruginosa isolates were estimated by using a Jaccard matrix of similarity and analyzed by the UPGMA computer program to supply a phylogenetic tree. The results show the RAPD-PCR analysis is a good epidemiological screening method to detect genetic variation among P. aeruginosa isolates.
Benzer Tezler
- Suda çözünebilen tetra ve okta sübstitüye galyum ftalosiyanin bileşiklerinin DNA etkileşimlerinin belirlenmesi ve antimikrobiyal uygulamaları
Determination of DNA interactions and antimicrobial applications of water soluble tetra and octa substituted gallium phthalocyanine compounds
HASAN EMRE YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EFKAN BAĞDA
- Tarçın kabuğu (Cinnamomum verum) sulu özütü kullanılarak yeşil sentez ile gümüş nanopartiküllerinin üretimi karakterizasyonu ve antibakteriyel aktivitesinin belirlenmesi
Fabrication, characterization and determination of antibacterial activity of silver nanoparticles by green synthesis using cinnamon bark (Cinnamomum verum) aqueous extract
SEMA GENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiKilis 7 Aralık ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE AYSUN MERCİMEK TAKCI
- Bakır (Cu) nanoçiçeklerinin yeşil sentez yöntemi kullanılarak sentezlenmesi, karakterizasyonu, fotokatalitik, antimikrobiyal ve antioksidan aktivitesinin belirlenmesi
Synthesis and characterization of copper (Cu) nanoflowers using green synthesis method, determination of photocatalytic, antimicrobial and antioxidant activity
ONUR CAN GÜVEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiNevşehir Hacı Bektaş Veli ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSA KAR
- Küre Dağları Milli Parkının vejetasyon ekolojisi ve iklim değişikliği senaryolarına göre değerlendirilmesi (Doğu kayını örneği)
Vegetation ecology of Küre Mountains National Park and assessment of climate change scenarios (Fagus orientalis sample)
MUHAMMET ÖZTEKİNCİ
- Türkiye'de dağılım gösteren mezgit balığının (Merlangius merlangus Linnaeus, 1758) popülasyon genetiği yapısının moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determination of population genetic structure of whiting (Merlangius merlangus Linnaeus, 1758) distributed in Turkey by the using molecular methods
ÜMİT GÜR
Doktora
Türkçe
2023
Balıkçılık TeknolojisiOrdu ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YILMAZ ÇİFTCİ