Mir-34a-5p ile olası hedef genlerinin hl-60 ve nb4 hücre hatlarında fonksiyonel olarak araştırılması
Functional investigation of possible target genes with mir-34a-5p in hl-60 and nb4 cell lines
- Tez No: 783191
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ ÖZTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Akut Miyeloid Lösemi, hematolojik hücresel üretimdeki anormalliklerden kaynaklanan lösemi çeşitlerinden biridir. Hastalığa hedefli yeni biyobelirteçlerin tespiti tanı, tedavi planı ve prognoz takibi için oldukça önem taşımaktadır. Birden fazla geni hedefleyerek kanser gelişiminde kritik rol oynayan miRNA'ların hastalıklara özgü biyobelirteç olarak kullanılabileceği düşünülmektedir. Bu nedenle bu tez projesi kapsamında HL-60 VE NB4 AML hücre hatlarında miR-34a-5p'nin lösemi hücrelerindeki fonksiyonel etkileri araştırılmıştır. miR-34a-5p'nin potansiyel aday hedef genleri olarak in silico analiz ile seçilen MEK1, KLF4, PGK1, PIM1 ve MDM4 genleri seçilmiştir. miR-34a-5p mimik transfeksiyonu yapılan AML hücre hatlarındaki ve kontrol gruplarındaki ifade seviyeleri karşılaştırmalı olarak araştırılmıştır. miR-34a-5p mimik transfeksiyonunun hücreler üzerindeki fonksiyonel etkisi proliferasyon ve apoptoz yöntemleri kullanılarak araştırılmıştır. Ayrıca miR-34a-5p'nin seçilen olası aday hedef genlerin anlatımına etkisi kantitatif gerçek zamanlı PZR (qRT-PCR) ile incelenmiştir. In vitro çalışmadan elde edilen sonuçlarla miR-34a-5p mimik transfeksiyonun HL-60 ve NB4 hücre hatlarında proliferasyonu düşürdüğü ve apoptozu indüklediği görülmüştür. miR-34a-5p mimik transfekte edilen hücreler ve kontrol grubu hücreleri arasında miR-34a-5p'nin aday gen ifade düzeyleri incelendiğinde HL-60 hücrelerinde MEK1, KLF4 ve PGK1 genlerinin ifade seviyelerinde düşüş olduğu; MDM4 ve PGK1 genlerinde ise istatistiki olarak anlamlı bir ifade değişiminin olmadığı tespit edilmiştir NB4 hücrelerinde de MEK1, KLF4 ve PGK1 genlerinin ifade seviyelerinin azaldığı, fakat MDM4 ve PIM1 genlerinin ifadesinin anlamlı şekilde değişmediği gözlemlenmiştir. Seçilen aday onkogenlerin anlatımlarında görülen değişimler, bu genlerin miR-34a-5p'nin AML'deki tümör baskılayıcı mekanizması için önemli adaylar olabileceğini göstermektedir. AML patogenezinde miR-34a-5p tümör baskılayıcı etkisinin araştırılmasını amaçlayan bu çalışma ile hücresel süreçlerde önemli olabilecek yeni hedef genler belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
One of the types of leukemia caused by abnormalities in hematological cellular proliferation is acute myeloid leukemia (AML). Detection of new disease-specific biomarkers is significant for prognosis monitoring, diagnosis, and treatment planning. It is thought that miRNAs, which target several genes and are crucial in the development of cancer, can be used as disease-specific biomarkers. The purpose of this thesis project is to investigate the functional effects of miR-34a-5p in HL-60 and NB4 cell lines as well as to compare the expression levels of MEK1, KLF4, PGK1, PIM1, and MDM4 genes that may be regulated by miR-34a-5p in AML. Using proliferation and apoptotic techniques, the functional impact of miR-34a-5p mimic transfection on cells was investigated. In addition, quantitative real-time PCR (qRT-PCR) was used to evaluate how miR-34a-5p affected the expression of a few potential candidate target genes. According to the in vitro study's findings, miR-34a-5p mimic transfection in HL-60 and NB4 cell lines reduced proliferation and induced on apoptosis. When the candidate miR-34a-5p target gene expression levels were compared between miR-34a-5p mimic transfected cells and control group cells, it was noticed that MEK1, KLF4, and PGK1 gene expression levels in HL-60 cells were decreased; however, MDM4 and PGK1 gene expression levels had no statistically significant change. In NB4 cells, it was shown that the expression of the genes MEK1, KLF4, and PGK1 was reduced, but that of the genes MDM4 and PIM1 did not alter significantly. Changes in the expression of a few chosen potential oncogenes imply that these genes might be significant candidates for miR-34a-5p's in AML. By means of this study, which investigates at the role of miR-34a-5p as a tumor suppressor in the development of AML, additional targets that may be crucial for cellular functions have been discovered.
Benzer Tezler
- Şizofreni ilişkili potansiyel miRNA'ların comt geni ile olası ilişkisinin in vitro model oluşturularak araştırılması
Investigation of the possible association of schizophrenia-associated potential miRNAs with the comt gene by creating an in vitro model
ONUR TONK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURAY ALTINTAŞ
DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR TOKGÜN
- Servikal intraepitelyal neoplazi tanılı hastalarda yüksek riskli HPV persistansı olan ve olmayan gruplarda farklı mikroRNA değerlerinin karşılaştırılması
Comparison of different micrRNA levels in patientsdiagnosed with cervical ntraepithelial neoplasia (CIN)with and without high-risk HPV persistence
AYŞENUR AKKOÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
GenetikPamukkale ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DERYA KILIÇ
- Menenjiyom tümörlerinde bazı spesifik mikroRNA'ların tanısal ve prognostik değerlerinin araştırılması
Investigation of the diagnostic and prognostic values of some specific microRNAs in meningiom tumors
HASAN DAĞLI
- Kendiliğinden düşük ile sonuçlanan kromozomal olarak normal veya sayısal anomaliye sahip trofoblastik dokularda, plasentogenezde aktivatör ve inhibitör etkili miRNA'ların ekspresyon seviyelerinin araştırılması
Investigation of expression levels of activator and inhibitor miRNAs in placentogenesis in trophoblastic tissues with chromosomally normal or numerical anomalies that result in spontaneous abortion
ELVİN KAZANCIOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
GenetikGazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL YİRMİBEŞ KARAOĞUZ
- Prostat kanserli olgularda miRNA ifadelenme düzeylerinin karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of miRNA expression levels in prostate cancer patients
VENHAR GÜRBÜZ
Doktora
Türkçe
2021
GenetikGazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ECE KONAÇ