Geri Dön

Sendromik epilepsi hastalarında moleküler genetik analiz sonuçlarının değerlendirilmesi

Başlık çevirisi mevcut değil.

PDF İndir

  1. Tez No: 791516
  2. Yazar: HAMZA POLAT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BİLGEN BİLGE GEÇKİNLİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Ekzom dizileme, Epilepsi, Genetik, Genetik analiz, Moleküler analiz, Moleküler genetik, Exome sequencing, Epilepsy, Genetics, Genetic analysis, Moleküler analysis, Molecular genetic
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Epilepsi gelişiminde çoğunlukla kompleks kalıtım rol oynamaktadır. Kompleks kalıtımda genler ile çevresel faktörlerin etkileşimi görülmektedir. Çalışmamızda sendromik bulguları olan epilepsi tanılı hastaların klinik özellikleri, kullanılan CES (Klinik Ekzom Dizileme) yönteminin avantaj-dezavantajları ile tanısal amaçlı kullanılabilirliğinin ortaya konması, elde edilen moleküler veriler ile klinik özellikler arasındaki bağlantının değerlendirilmesi ve moleküler etiyolojisi belirlenmiş olan olgular ile ailelerine hastalık ve varyant ile ilgili genetik danışmanın verilmesi hedeflenmiştir. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya epilepsi tanısı almış, sendromik görünüm ve mental retardasyon gibi klinik bulguları olan 70 erkek, 76 kadın toplamda 146 hasta dahil edildi. Hastaların klinik bulguları, aile öyküleri, görüntüleme ve laboratuvar sonuçları kaydedildi. Dahil edilme ve dışlanma kriterleri göz önünde bulundurulduktan sonra, hastaların periferik kanlarından DNA izolasyonu yapıldı. Çalışmada 4496 gen içeren CES kiti kullanılarak, Yeni Nesil Dizileme (YND) yöntemi ile güncel veritabanları kullanılarak, sendromik epilepsi ile ilişkilendirilmiş genler analiz edilmiştir. Bulgular: Çalışma kapsamında 38 (%27) hastada klinik önemi bilinen 17 (%12) patojenik(P), 16 (%11) olası patojenik (LP) ve 6 adet (%3) VUS (Klinik Önemi Belirsiz Varyant) olarak sınıflandırılabilecek varyant saptandı. Varyantlardan 8 (%5) tanesi ensefalopati ile ilişkilendirilmiş genlerde, 6 (%3) tanesi nörokütanöz hastalıklar ile ilişkilendirilmiş genlerde, 4 (%2) tanesi metabolik yolaklar ile ilişkili genlerde ve diğer 21 (%14) varyant ise nadir sendromik epilepsi nedeni olabilecek genlerdeydi. 108 (%73) hastada klinik önemi bilinen bir varyant saptanmamıştır. Çalışmamızda saptanan 38 varyanttan P, LP veya VUS olarak sınıflandırılabilecek 18 (%12) tanımlı olmayan varyant literatüre kazandırılmıştır. Sonuç: Çalışmamız sonucunda 38 sendromik epilepsi tanılı hastada, genetik etiyoloji aydınlatılmış ve genotip-fenotip korelasyonu tartışılmıştır. Tüm bu bulgular YND uygulamalarının, epilepsi oluşumunda rol alan genetik mekanizmaların aydınlantılmasındaki önemini ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Objective: Complex inheritance mostly plays a role in the development of epilepsy. In complex inheritance, the interaction of genes and environmental factors is seen. In our study, it was aimed to reveal clinical features of syndromic epilepsy patients, advantages-disadvantages of the CES (Clinical Exome Sequencing) , and diagnostic availability, to evaluate the relationship between the obtained molecular data and clinical features, and to provide genetic counseling to the families with the case whose molecular etiology was solved and the disease and variant. Materials and Methods: A total of 146 patients, 70 men and 76 women, who were diagnosed with epilepsy and had additional clinical findings such as syndromic appearance and mental retardation, were included in the study. Clinical findings, family histories, imaging and laboratory results of the patients were recorded. After considering the inclusion and exclusion criteria, DNA isolation was performed from the peripheral blood of the patients. Genes associated with syndromic epilepsy were analyzed using the CES kit containing 4496 genes, using current databases with Next Generation Sequencing (NGS) method. Results: In our study, 17 (12%) pathogenic variants (P) with known clinical significance, 16 (11%) potentially pathogenic (LP) and 6 (3%) VUS (Variant Unknown Significance) variants were detected in 38(%27) individuals. Of the variants, 8 (5%) were in genes associated with encephalopathies, 6 (3%) were in genes associated with neurocutaneous diseases, 4 (2%) were in genes associated with metabolic pathways, and 21(%14) variants are in genes that may cause rare syndromic epilepsy. No variant with known clinical significance was detected in 108(%73) patients. In our study, 18 variants that can be classified as P, LP or VUS were not reported in databases and were brought to the literature. Conclusion: Genetic etiology was clarified and genotype-phenotype correlation was discussed in 38 patients with syndromic epilepsy. All these findings revealed the importance of NGS applications in elucidating the genetic mechanisms involved in the formation of epilepsy.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    193271

    Ankara ilindeki üç ilköğretim okulu öğrencilerinin epilepsiye yaklaşımı ve hastalık hakkındaki bilgi düzeyleri

    Knowledge of epilepsy and attitudes towards the condition among three elementary schools students in Ankara

    İKBAL OK BOZKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Çocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE SERDAROĞLU

  2. Tez No

    672074

    İdiyopatik jeneralize epilepsi tanısı alan olguların yeni nesil dizileme yöntemi ile genetik etiyolojisinin araştırılması

    The investigation of the genetic etiology in idiopathic generalized epileptic disorders by next generation sequencing technique

    ENGİN ATLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikTrakya Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKAN GÜRKAN

  3. Tez No

    1014519

    Türkiye'de mitokondriyal aminoaçil tRNA sentetaz hastalıklarının klinik ve genomik özelliklerinin değerlendirilmesi

    Clinical and genomic characterization of mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetase disorders in Türkiye

    ÖZLEM YAYICI KÖKEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Tıbbi BiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE ESRA MANGUOĞLU

  4. Tez No

    567355

    Erken başlangıçlı Epileptik Ensefalopati hastalarında hedefli gen paneli analizlerinin tanısal değerinin saptanması

    Determination of diagnostic value of targeted gene panel analysis in patients with early onset Epileptic Encephalopathy

    GÜLÜŞAN UZUNER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DENİZ SÜNNETÇİ AKKOYUNLU

  5. Tez No

    288984

    Zeka geriliğine neden olan delesyon ve duplikasyonların tam genom mikroarray metoduyla belirlenmesi

    Detection of deletions and duplications that cause mental retardation by whole genome microarray method

    DENİZ SÜNNETÇİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GenetikKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NACİ ÇİNE

    DOÇ. DR. BÜLENT KARA

Geri Dön