Geri Dön

Üriner sistem enfeksiyonu olan ıraklı hastalardan üropatojenik escherichia coli'de (UPEC) sitotoksik nekrotizan faktör, kolibaktin, sitoletal distansiyon toksinin moleküler analizi

Molecular analysis of citotoxic necrotizing factor, colibactin, cytoletal distension toxin in uropatogenic escheri̇chia coli (UPEC) from iraqi patients with urinary system infection

PDF İndir

  1. Tez No: 794621
  2. Yazar: HIBA NASER ALI ALSAHO
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Bu çalışma, hemolizin aktivitesi olan Üropatojenik Escherichia Coli (UPEC) izolatlarında virülans toksin genlerinin (cnf1, clb ve cdt) dağılımını belirlemeyi amaçladı. Ek olarak, hemolizin aktivitesi ve sitotoksik nekrotizan faktör ile UPEC izolatında düzenleyici küçük RNA, RfaH'nin ekspresyon seviyesinin araştırılması hedeflendi. Farklı yaşlarda idrar yolu enfeksiyonu (İYE) şüphesi olan erkek, kadın ve çocuk hastalardan idrar örnekleri (248) toplandı. Bu örneklerin farklı bakteriyolojik besiyerlerinde kültürlenmesinden sonra, 93 (%37,5) örneğin E. coli ile enfekte olduğu ve 91 (%36,69) örnekte üreme olmadığı, 157 örneğin patojenik bakteri ile enfekte olduğu tespit edildi. Risk faktörü olarak cinsiyete göre kadınlarda (%70,97) erkeklere göre (%29,03) İYE insidansının anlamlı farklılık (16,35, p≤ 0,0001) olduğu bulundu. Yaşa göre ise yetişkinlerin (%75,27) İYE'lere çocuklara (%24,7) göre daha duyarlı oldukları ve anlamlı farklılıklarla (23,75, p≤0.0001) bulundu. UPEC izolatlarının hemolizin üretimi incelendi. Sonuçlar E.coli izolatlarının (%5,1) izolatlarının (H22, H33, H40, H48 ve H53) insan kanlı agar üzerinde hemolizin üretildiğini gösterdi. UPEC izolatları, ampisilin ve amoksisilin/klavulanik aside yüksek direnç (%100) ve siprofloksasine duyarlı (%91) idi. Beş Hemolitin Üreten UPEC izolatında cnf 1, cdtIII ve clbA dâhil olmak üzere virülans genlerinin prevalansı PCR ile tespit edildi. Bu izolatlardan dördü arasında (H22, H40, H48 ve H53) toksin kodlayan genleri (cnf 1 ve clbA) yüksek frekansta (%100) barındırdığı, bir izolatın ( H33) her iki gen için de negatif olduğu, cnf1 ve cnf1 olduğu belirtilmiştir. clbA, beş izolatın hepsinde cdtIII geni yoktu. Ayrıca, hemolizin aktivitesine ve sitotoksik nekrotizan faktöre sahip UPEC izolatlarında düzenleyici küçük RNA, RfaH'nin ekspresyon düzeyi RT-qPCR kullanılarak araştırıldı. Hly ve cnf1 genlerinin ekspresyonu, RfaH geni ile korele edildi; katlama değeri sırasıyla 2,51, 5,89 ve 4,19 idi.

Özet (Çeviri)

This study was aimed at determining the distribution of virulence toxin genes (cnf1, clb, and cdt) in UPEC isolates with hemolysin activity. In addition, investigating the expression level of regulatory small RNA, RfaH, in UPEC isolate with hemolysin activity and cytotoxic necrotizing factor. Urine samples (248) were collected from male, female, and children patients suspected of urinary tract infections (UTIs) at different ages. After culturing these samples on different bacteriological media, it was found that 157 samples were infected with pathogenic bacteria in which 93 (37.5%) samples were infected with E. coli, and 91(36.69 %) samples had no growth. According to the gender as risk factors, it was found UTIs are more incidences in females (70.97%) than males (29.03%) with significant differences (16.35, p≤ 0.0001). However, according to the age it was found adults were more susceptible (75.27%) to UTIs than children (24.7%), with significant differences (23.75, p≤0.0001). The hemolysin production of UPEC isolates was examined, results indicated that (5.1%) isolates (H22, H33, H40, H48, and H53) of E.coli isolates were produced hemolysin on human blood agar. The UPEC isolates were high resistance (100%) to ampicillin and amoxicillin/clavulanic acid, and sensitive (91%) to ciprofloxacin. The prevalence of virulence genes including cnf 1, cdtIII, and clbA in five Hemolytin-Producing UPEC isolates was detected by PCR. It was indicated among four of these isolates (H22, H40, H48, and H53) harbor toxin encoding genes (cnf 1 and clbA) with high frequency (100%), one isolate ( H33) was negative for both genes, cnf1, and clbA, while all five isolates had no cdtIII gene. Moreover, the expression level of regulatory small RNA, RfaH, in UPEC isolates with hemolysin activity and cytotoxic necrotizing factor was investigated by using RT-qPCR. The expression of Hly and cnf1 genes was correlated with the RfaH gene; the folding value was 2.51, 5.89, and 4.19 respectively.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    752713

    Bağdat'ta İYE'den izole edilen Escherichia coli izolatlarının virülans faktörleri, antibiyotik direnci ve biyofilm üretimi arasındaki ilişkinin incelenmesi

    Study the relationship between virulence factors, antibiotic resistance and biofilm production of isolates Escherichia coli isolated from uti in Baghdad

    AHMED AMER NAYYEF AL-HITAWI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ESİN KIRAY

    DOÇ. DR. MUTHANA HAMID

  2. Tez No

    772260

    Serological investigation of peste des petits ruminants in lambs in Iraq-Kirkuk region

    Irak–Kerkük bölgesinde kuzularda küçük ruminant vebası (pestedes petits ruminants ppr)'ın seroprevalansı

    SARWAT KHORSHED RAHEEM

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Sağlık YönetimiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Sağlık Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN KOZAT

  3. Tez No

    621720

    Üriner sistem enfeksiyonu olan bireylerle asemptomatik bakteriürili bireylerde idrarda bakır ve çinko değerlerinin karşılaştırılması

    Comparison of copper and zinc values in urine in individuals with asymptomatic bacteria and individuals with urinary system infection.

    SEVGİ ALAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSakarya Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OĞUZ KARABAY

  4. Tez No

    229826

    Üriner sistem enfeksiyonu olan çocuk hastaların retrospektif değerlendirilmesi

    Analysis of children with urinary tract ınfection

    MESUT ÖKSÜZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OZAN ÖZKAYA

  5. Tez No

    473854

    Komplike üriner sistem enfeksiyonu olan hastalarda total oksidatif status, total antioksidatif status ve thiol disülfit balansın incelenmesi

    Investigation of total oxidative status, total antioxidative status and thiol disulphide balance in complicated urinary tract infection

    FÜRUZAN AZİZOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHarran Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HASAN KARSEN

Geri Dön