Geri Dön

PKD1 gen varyantlarının PC1 proteinin yapısı ve fonksiyonu üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesi

Evaluation of the effects of PKD1 gene variants on the structure and function of the PC1 protein

  1. Tez No: 805412
  2. Yazar: BERKAY KIRNAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ, PROF. DR. AFİG BERDELİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Moleküler Tıp, Biotechnology, Genetics, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 74

Özet

Bir Renal Silyopati olan Otozomal Dominant Polikistik Böbrek hastalığı (ODPBH) dünyadaki en yaygın kalıtsal böbrek hastalığıdır. Dünyadaki Prelevansı 1:400/1000 şeklindedir. Sıklıkla yaşamın 60. Yılında son dönem böbrek hastalıklarına (ESRD) yol açmaktadır. Yapılan çalışmalarda Polikistin1 geninde (PKD1) meydana gelen DNA varyantlarının ODPBH hastalıkla ilişkili olduğu bilinmektedir. ODPBH hastalığı ve şüphesi ile gelmiş 232 kişiden alınan periferik kan örnekleri ile, yeni nesil dizileme tekniği ile popülasyonumuzda PKD1 DNA varyantları ortaya konulmuştur. Ayrıca missense DNA varyantlarının PC1 proteini üzerindeki yapısal ve fonksiyonel etkileri farklı in silico yaklaşımlar ile ortaya koyduk. Çalışma sonucunda 232 kişinin 105'inde PKD1'e ait DNA varyantları saptadık. Bu 105 kişide 17 tanesi daha önce saptanmamış 49 farklı DNA varyantına rastlanmıştır. Missense mutasyonların PC1 proteini üzerindeki meydana getirdiği yapısal ve fonksiyonel değişikleri araştırma sonucuna göre Bening olarak kabul edilen mutasyonların aslında bu yaklaşım ile önemli olabileceği ve dikkate alınması gerektiğini belirttik. PC1 proteinin mekanosensör özelliği ile çevresel uyarıları hücre içersine iletmektedir. Özellikle yapısal düzenleme ve sinyal iletiminden sorumlu olan REJ, GCPR, PKD bölgelerinde meydana gelen ve konformasyonel değişiklikler oluşturan varyantların önemli olabileceğini ortaya çıkartık.

Özet (Çeviri)

Autosomal Dominant Polycystic Kidney disease (ADPBD), a Renal Ciliopathy, is the world's most common inherited kidney disease. Its prevalence in the world is 1:400/1000. It often leads to end-stage renal disease (ESRD) in the 60th year of life. Studies show that DNA variants occurring in the Polycystin1 gene (PKD1) are associated with ADPKD disease. PKD1 DNA variants in our population were revealed by the new generation sequencing technique, with peripheral blood samples taken from 232 individuals who came with ADPKD disease and suspected. We also demonstrated missense DNA variants' structural and functional effects on the PC1 protein with different in silico approaches. As a result of the study, we detected DNA variants of PKD1 in 105 of 232 individuals. In these 105 individuals, 49 DNA variants were found, 17 of which had not been detected. According to the results of the research on the structural and functional changes caused by missense mutations on the PC1 protein, we stated that mutations considered as Bening may be significant with this approach and should be considered. PC1 transmits environmental stimuli into the cell with the mechanosensory feature of the protein. We revealed that variants that occur in REJ, GCPR, and PKD regions responsible for structural regulation and signal transduction and producing conformational changes might be necessary.

Benzer Tezler

  1. Otozomal dominant polikistik böbrek hastalığı tanılı olgularda yeni nesil dizileme ile saptanan PKD1 ve PKD2 gen varyantlarının retrospektif araştırılması

    Retrospective investigation of PKD1 and PKD2 gene variants detected by next generation sequencing in patients with autosomal dominant polycystic kidney disease

    KÜBRA BAYSAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Genetikİnönü Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM TEKEDERELİ

  2. Polikistik böbrek hastalığının moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of polycystic kidney disease by molecular methods

    ÖZGE SARICA YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikManisa Celal Bayar Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAY ALTINTAŞ

  3. Çocuklarda böbrek kistlerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of kidney cyst in children

    PINAR GÖNÜLSÜZ KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAdnan Menderes Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERAH SÖNMEZ

  4. Otozomal dominant polikistik böbrek hastalığı olan çocuk hastalarda prognozu etkileyen faktörler

    Factors affecting prognosis in pediatric patients with autosomal dominant polycystic kidney disease

    ALİ KARAKAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYSUN KARABAY BAYAZIT

  5. Sendromik olmayan dudak damak yarıklı bireylerde Wnt sinyal yolağında fonksiyon gören genlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of genes functioning in the Wnt signaling pathway in individuals with non-syndromic cleft lip and palate

    AYŞE TUBA ALTUĞ DEMİRALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK TOYGAR MEMİKOĞLU