Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae izolatlarının antibiyotik direnç profilinin ve virülans faktörlerinin araştırılması

Investigation of antibiotic resistance profile and virulance factors of Klebsiella pneumoniae isolates from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 806923
  2. Yazar: ÖZGE KULAÇ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAŞKAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Amasya Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 117

Özet

Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) hastane kaynaklı enfeksiyonlarda rol oynayan Gram negatif fırsatçı bir patojendir. Beta laktamaz enzimi varlığıyla antibiyotiklere karşı direnç kazanması ve biyofilm oluşturabilmesi nedeniyle K. pneumoniae kaynaklı enfeksiyonların tedavisi zor mortalitesi yüksektir. Bu bilgiler ışığında çalışmamızda etik kurul onayı alındıktan sonra Tokat Devlet hastanesi, Tokat Erbaa Devlet hastanesi ve Samsun Bafra Devlet Hastanesine başvuran ayaktan ve yatan hastalardan elde edilen K. pneumoniae (N=120) izolatlarının çeşitli antibiyotiklere karşı direnç profillerinin disk difüzyon, fenotipik GSBL oluşumun kombine disk yöntemiyle, GSBL genlerinin (blaTEM, blaSHV ve blaCTX-M), tip 1 adezin (fimH) virülans faktörünün, Class 1 integron (intI1) varlığının PZR yöntemiyle, ve biyofilm oluşumları mikrotitrasyon yöntemiyle belirlenmesi amaçlanmıştır. Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemine göre 120 izolatın 47'si (%39,1) meropenem'e, 43'ü (%35,8) imipenem'e, 72'si (%60) seftazidim'e, 48'i (%40) kloramfenikol'e, 107'si (%89,1) levofloksasin'e, 69'u (57,5) aztreonam'a, 71'i (%59,1) fosfomisin'e, 53'ü (%44,1) tobramisin'e, 47'si, (%39,1) gentamisin'e, 83'ü (69,1) amoksasilin klavunata'a, 65'i (54,1) piperasilin tazobaktam'a, 68'i (%56,6) nalidiksik asit'e dirençli olduğu tespit edilmiştir. GSBL oluşumunu fenotipik olarak tespit etmek için yapılan kombine disk yöntemine göre; 120 izolatın 28 tanesi (%23,3) GSBL pozitif olarak belirlenmiştir. Biyofilm oluşumunu belirlemek için yapılan mikrotitrasyon plağı yöntemine göre 120 izolatın 58'i (%48,3) biyofilm pozitiftir. Klinik izolatların blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, int1, fimH gen bölgesi varlığının tespiti için yapılan PZR değerlendirme sonuçları; 120 izolatın 10'u (%8,3) blaTEM, 42'si, (%35) blaSHV, 23' ü (%19,1) blaCTX-M, 70'i (%58,3) intI1, 27'si (%22,5) fimH pozitif şeklindedir. Sonuç olarak; Klebsiella kaynaklı enfeksiyonların tedavisi için antiyotik direnç profilin bilinmesi önemlidir ve biyofilm oluşumunu engellemeye yönelik çalışmaların yapılmasıyla da K. pneumoniae kaynaklı enfeksiyonların önüne geçileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) is a Gram-negative opportunistic pathogen that plays a role in hospital-acquired infections. Infections caused by K. pneumoniae are difficult to treat and have a high mortality because of the presence of beta-lactamase enzyme, resistance to antibiotics and biofilm formation. In the light of this information, in our study, the resistance profiles of K. pneumoniae (N=120) isolates obtained from outpatients and inpatients who applied to Tokat State Hospital, Tokat Erbaa State Hospital and Samsun Bafra State Hospital after obtaining ethics committee approval, showed that resistance profiles against various antibiotics were found to be associated with disc diffusion, phenotypic ESBL formation. It was aimed to determine the ESBL genes (blaTEM, blaSHV and blaCTX-M), type 1 adhesin (fimH) virulence factor, the presence of Class 1 integron (intI1) by PCR method, and biofilm formations by microtitration method. The resistance rates of clinical isolates according to the Kirby-Bauer disc diffusion method according to antibiotics; Of 120 isolates, 47 (39.1%) were treated with meropenem, 43 (35.8%) with ımipenem, 72 (60%) with ceftazidime, 48 (40%) with chloramphenicol, 107 (89.1%) to levofloxacin, 69 (57.5) to aztreonam, 71 (59.1%) to fosfomycin, 53 (44.1%) to tobramycin , 47 (39.1%) to gentamicin, 83 (69.1) to amoxacillin clavunata, 65 (54.1) to piperacillin tazobactam, 68 (56.6%) to It is resistant to nalidixic acid. According to the combined disk method to detect ESBL formation phenotypically; Of 120 isolates, 28 (23.3%) were ESBL positive. Biofilm formation results according to the microtitration plate method to detect biofilm formation; 58 (48.3%) of 120 isolates were biofilm positive. PCR evaluation results for the detection of clinical isolates blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, intI1, fimH gene region; Of 120 isolates, 10 (8.3%) were blaTEM, 42 (35%) blaSHV, 23 (19.1%) blaCTX-M, 70 (58.3%) intI1, 27 (22.5%) is fimH positive. In conclusion, It is important to know the antibiotic resistance profile for the treatment of infections caused by Klebsiella, and by conducting studies to prevent biofilm formation, infections caused by K. pneumoniae will be prevented.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    803438

    2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi

    The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021

    DİDEM ÖZKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

  2. Tez No

    549576

    Karbapenem dirençli klebsiella türleri ile rektal kolonizasyonu olan hastalarda enfeksiyon oluşumuna neden olan faktörlerin retrospektif olarak incelenmesi

    Retrospective investigation of factors that cause infection in patients with rectal colonization with carbapenem resistant klebsiella species

    PINAR ÇAKMAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    UZMAN ÇİĞDEM ARABACI

  3. Tez No

    724476

    Klebsiella pneumoniae izolatlarının antibiyotik duyarlılık profillerinin kapsül genotipleriyle ilişkisinin araştırılması

    Investigation of the relation of antibiotic susceptibility profiles of klebsiella pneumoniae i̇solates with capsule genotypes

    DUYGU DALĞIÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TOĞRUL NAĞIYEV

  4. Tez No

    767263

    Klinik örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarında virülans faktörlerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması ve antibiyotik direnci ile ilişkilerinin incelenmesi

    Investigation of virulence factors by phenotypic and genotypic methods and evaluation of their relationship with antibiotic resistance in klebsiella pneumoniae strains isolated from clinical samples

    İREM SERBEST

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN BAYLAN

  5. Tez No

    658247

    Karbapanemaz dirençli enterobactericeae 'lerin antibiyotik duyarlılıklarının iki farklı panelle (phoenix BD) karşılaştırılması

    Comparison of antibiotic susceptibility of carbapanemase resistant enterobactericeae with TWO different panels (phoenix BD)

    HACER UĞURLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT ARAL

Geri Dön