PANC-1 hücre hattında ibandronat sodyumun antiproliferatif ve apoptotik etkilerinin epigenetik mekanizmalar hedeflenerek incelenmesi
Investigation of the antiproliferative and apoptotic effects of ibandronate sodium on PANC-1 cell line by targeting epigenetic mechanism
- Tez No: 809193
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE TANSU KOPARAL, PROF. DR. BERRİN TÜYLÜ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pankreas kanseri kanserle ilişkili ölümlerin arasında ilk dörtte yer alan, tedavisi güç olan bir kanser türüdür. Pankreas kanserlerinin çoğunda mutant KRAS mutasyonları tespit edilmiştir. KRAS'ın plazma zarının iç yüzeyine yerleşmesi işlevleri için gereklidir. Bu da farnezilasyon olarak bilinen bir dizi translasyon sonrası modifikasyon ile başarılır. Mevalonat yolağı farnezilasyon için çeşitli metabolitler sağlamaktadır. İbandronat sodyum (İBAN), mevalonat yolağında anahtar rol oynayan farnezil pirofosfat sentaz (FPPS)'ı inhibe etmektedir. Bu tez çalışmasında İBAN'ın pankreas kanseri hücre hattı olan PANC-1 üzerindeki sitotoksik ve apoptotik etkileri, epigenetik mekanizmalardan DNA metilasyonu hedeflenerek ortaya konmuştur. İBAN'ın PANC-1 hücre hattında konsantrasyon ve zamana bağlı olarak güçlü sitotoksik etkiler yarattığı MTT testiyle belirlenmiştir. İBAN'ın apoptotik etkileri ise RT-qPCR ve western blot yöntemleriyle gösterilmiştir. Sonuçlar İBAN'ın FPPS'i inhibe ettiğini ve RAS proteinlerinin işlevi için gerekli olan farnezilasyonu engellediğini göstermiştir. İBAN'ın zaman ve konsantrasyon bağımlı olarak PANC-1 hücre hattında bir epigenetik düzenleyici olan DNA metiltransferaz1 (DNMT1) ifadesini anlamlı derecede azalttığı; fas, kaspaz-3 ve kaspaz-8 protein miktarını kontrol grubuna oranla anlamlı derecede artırarak apoptozu başlattığı gösterilmiştir. Elde edilen sonuçlar, İBAN'ın tek başına ya da diğer ajanlarla kombine şekilde pankreas kanseri tedavisinde kullanılabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Pancreatic Cancer ranks as fourth common type of cancer which ends up with cancer-related deaths and it is also a complicated type to treat. Mutant KRAS mutations have been idenfied in most pancreatic cancers. Localization of KRAS to the inner surface of the plasma membrane is essential for its functions. This is achieved through a series of post-translational modifications known as farnesylation. The mevalonate pathway provides a variety of metabolites for farnesylation. Ibandronate sodium (IBAN) inhibits farnesyl pyrophosphate synthase, which plays a key role in the mevalonate pathway. This thesis revealed, the cytotoxic and apoptotic effects of ibandronate sodium, a nitrogen-containing bisphosphonate, on the pancreatic cancer cell line PANC-1 by targeting DNA methylation from epigenetic mechanisms. It was determined by MTT test that ibandronate sodium caused strong cytotoxic effects on PANC-1 cell line depending on concentration and time. The apoptotic effects of ibandronate were demonstrated by RT-qPCR and western blot methods. It was demonstrated that it inhibits farnesylation which is necessary for the function of RAS proteins. Ibandronate significantly decreased DNMT1 gene expression on PANC-1 cell line in a time and concentration dependent. It was also significantly initiated apoptosis compared to the control group by increasing the amount of fas, caspase-3 and caspase-8 proteins levels. All these evidences indicate that ibandronate can be used alone or in combination with other agents in the treatment of pancreatic cancer.
Benzer Tezler
- PANC-1 hücre hattında resveratrol'ün NF-KB ve HTERT ekspresyonuna bağlı telomeraz aktivitesine etkisi
Effect of resveratrol on telomerase activity due to NF-KB and htert expression in PANC-1 cell line
BUŞRA BARA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
OnkolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA ZUHAL EROĞLU
- PANC-1 insan pankreas kanseri hücre hattında biyolojik ve kimyasal olarak sentezlenen gümüş nanopartiküllerin HIF-1 sinyal yolağı üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of effects of silver nanoparticles synthesized biologically and chemically on HIF-1 signal pathway in PANC-1 human pancreatic cancer cell line
ŞEVVAL ÖZKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU
- Melatonin uygulanan insan PANC-1 hücre hattında mirna ekspresyon analizinin yapılması
Mirna expression analysis in human PANC-1 cell line applied with melatonin
BÜŞRA AKYOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Tıbbi BiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DUYGU SARI AK
- Pankreas adenokarsinom hücre hattında etken flavonoid bileşenlerin kemopreventif ve gemsitabin'e karşı gelişen direnç üzerindeki etkilerinin araştırılması
Study on chemopreventive and on gemcitabine-based chemoresistance effects of flavonoid containing mixture in pancreatic adenocarcinoma cell lin
ÇAĞATAY AYDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA YILMAZ AYDOĞAN
- Pankreatik kanser hücre hattında Diaposinin'in apoptoz indükleyici etkisinin gösterilmesi
Apopitotic effect of Diapocynin on pancreatic cancer cell line
MEHMET KİRAZLAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Fizyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KOYU