Melatonin uygulanan insan PANC-1 hücre hattında mirna ekspresyon analizinin yapılması
Mirna expression analysis in human PANC-1 cell line applied with melatonin
- Tez No: 887330
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ DUYGU SARI AK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
- Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 57
Özet
Amaç: Bu çalışmanın amacı; pankreas kanseri hücre hattı (PANC-1) kullanılarak, PANC-1 hücrelerinde melatonin hormonunun toksik dozunun belirlenmesi, pankreas kanserinin moleküler mekanizma yolaklarında etkisinin olduğuna dair çalışmalar yapılan miRNA'ların (has-miR-27a, has-miR-203, has-miR-148a, has-miR-196a) melatonin ile kombinasyonu sonucunda PANC-1 hücrelerinde ekspresyon seviyelerinin nasıl değişkenlik göstereceğinin araştırılması sonucunda pankreas kanserine yönelik yeni tedavi yaklaşımlarına katkı sağlamaktır. Gereç ve Yöntem: Araştırmamızda, ilk olarak pankreas kanseri hücre hattı (PANC-1) hücre kültürü ortamında çoğaltılmıştır. Çoğaltılan hücrelere melatonin eklenerek MTT testi analizi ile melatoninin PANC-1 hücre hattındaki toksik dozu belirlenmiştir. Belirlenen toksik dozlarda melatonin PANC-1 hücrelerine uygulanmıştır ve melatonin uygulanan PANC-1 hücrelerinden ve melatonin uygulanmayan PANC-1 hücrelerinden total RNA izolasyonu yapılmıştır. Sonrasında RNA örnekleri kullanılarak cDNA sentezi yapılmıştır. Araştırılmak istenen miRNA'lar (has-miR-27a, has-miR-203, has-miR-148a, has-miR-196a) melatonin uygulanmış PANC-1 hücreleri ile melatonin uygulanmamış PANC-1 hücreleri ile karşılaştırmalı olarak qRT-PCR/qPCR yöntemi ile analizi yapılmıştır. Sonuçlar istatiksel analiz yapılarak değerlendirilmiştir. Bulgular: Bu tez çalışmasında, in vitro yapılan deneyler neticesinde PANC-1 hücre hattında melatonin hormonunun inhibe edici dozları bulundu, melatonin uygulanan PANC-1 hücrelerinde miR-27a, miR-148, miR-203 ve miR-196a miRNA'larının ekspresyon analizi sonucunda PANC-1 hücrelerinde melatoninin miRNA'lar üzerinde modülatör etkisi olduğu görüldü. Sonuç: Melatoninin PANC-1 hücre hattında miR-27a, miR-148, miR-203 ve miR-196a miRNA'ları ile birlikte regülatör etkisi olduğu ve pankreas kanserini etkileyen sinyal yolaklarındaki bozuklukları iyileştirmeye yönelik etkileri olduğu düşünülmektedir. Buna yönelik ileri çalışmalara ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study is to determine the toxic dose of melatonin hormone in PANC-1 cells using pancreatic cancer cell line (PANC-1), and to investigate how the expression levels of miRNAs (has-miR-27a, has-miR-203, has-miR-148a, has-miR-196a), which have been studied to have an effect on the molecular mechanism pathways of pancreatic cancer, will change in PANC-1 cells as a result of the combination with melatonin, thus contributing to new treatment approaches for pancreatic cancer. Materials and Methods: In our study, firstly, pancreatic cancer cell line (PANC- 1) was propagated in cell culture medium. Melatonin was added to the propagated cells and the toxic dose of melatonin in PANC-1 cell line was determined by MTT test analysis. Melatonin was applied to PANC-1 cells at determined toxic doses and total RNA was isolated from melatonin-applied PANC-1 cells and from PANC-1 cells that were not treated with melatonin. Then, cDNA synthesis was performed using RNA samples. The miRNAs that were intended to be investigated (has-miR-27a, has-miR-203, has-miR-148a, has-miR- 196a) were analyzed comparatively with melatonin-applied PANC-1 cells and PANC-1 cells that were not treated with melatonin using qPCR method. The results were evaluated by statistical analysis. Results: In this thesis study, as a result of in vitro experiments, inhibitory doses of melatonin hormone were found in the PANC-1 cell line, and as a result of the expression analysis of miR-27a, miR-148, miR-203 and miR-196a miRNAs in melatonin-applied PANC-1 cells, it was seen that melatonin had a modulatory effect on miRNAs in PANC-1 cells. Conclusion: It is thought that melatonin has a regulatory effect together with miR-27a, miR-148, miR-203 and miR-196a miRNAs in PANC-1 cell line and has effects on improving the disorders in signaling pathways affecting pancreatic cancer. Further studies are needed in this regard.
Benzer Tezler
- Melatonin uygulanan fasulye genotiplerinde kuraklık ve tuz stresleri altında sabath gen ailesinin karakterizasyonu ve genom çaplı analizi
Genome wide analysis and characterization of sabath gene family in phaseolus vulgaris genotypes subject to melatonin under drought and salinity stresses
AHMED SİDAR AYGÖREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiErzurum Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRE İLHAN
- Kronik cep telefonu radyasyonu ve koruma amaçlı uygulanan melatonin' in uterusa etkisi
Chronic mobile phone radiation and the effect of melatonin which is applied for protection, on uterus tissue
CANSU ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiGazi ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇİĞDEM ELMAS
- Deneysel beyin hasarında hipokampal hücrelerde apopitoz, kalsiyum sinyali ve kaspaz üzerine Melatonin'in etkileri
Melatonin reduces oxidative stress, apoptosis and ca2+ entry in hippocampus of experimental traumatic brain injury
VEHBİ YÜRÜKER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
NöroşirürjiSüleyman Demirel ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
YRD. DOÇ. DR. NİLGÜN ŞENOL
PROF. DR. MUSTAFA NAZIROĞLU
- Ratlarda abamektin'in neden olduğu kardiyotoksisite üzerine melatonin'in koruyucu rolü
The protective role of melatonin on cardiotoxicity caused by abamectin in rats
ALİ AKTAŞ