Geri Dön

Sivas yöresinde mandalarda Theileria, Babesia, Anaplasma ve Ehrlichia türlerinin moleküler yöntemlerle araştırılması

Survey of Theileria, Babesia, Anaplasma, and Ehrlichia species in buffaloes in Sivas region by molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 816547
  2. Yazar: ÖMER FARUK ŞAHİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KÜRŞAT ALTAY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Anaplasmosis, babesiosis, ehrlichiosis, manda, theileriosis, Anaplasmosis, babesiosis, buffalo, ehrlichiosis, theileriosis
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 137

Özet

SİVAS YÖRESİNDE MANDALARDA THEILERIA, BABESIA, ANAPLASMA VE EHRLICHIA TÜRLERİNİN MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü (Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Ortak) Veteriner Parazitoloji Anabilim Dalı Doktora Tezi, Temmuz 2023 Danışman: Prof. Dr. Kürşat ALTAY ÖZET Theileria, Babesia, Anaplasma ve Ehrlichia soylarına ait türler, tropik ve subtopik bölgelerde yaygın olup, konaklarında subklinik ya da klinik hastalık tablosu oluşturabilmektedir. Bu konaklar, hastalık sırasında verim kayıpları yaşamakla birlikte hastalığı atlatanlarda, etkenler uzun süre kalarak vektör keneler için enfeksiyon kaynağı oluşturmaktadır. Hastalıkların, omurgalı konaklardaki yaygınlığının belirlenmesi, hastalıkların önlenmesine yönelik koruma ve kontrol programlarının geliştirilmesine temel oluşturmaktadır. Bu çalışmada, Sivas yöresinde mandalarda (Bubalis bubalis) Theileria, Babesia, Anaplasma ve Ehrlichia türlerinin varlığı ve yaygınlığının araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, Sivas yöresinde (merkez, Yıldızeli, Zara, Şarkışla, Ulaş, Suşehri ve Koyulhisar) 364 mandadan kan örneği toplanmış, bu örnekler, total DNA ekstraksiyonu yapıldıktan sonra, Theileria, Babesia, Anaplasma ve Ehrlichia türleri yönünden reverse line blotting (RLB), polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), restriksiyon fragment length polimorfizm (RFLP) yöntemleri ile analiz edilmiştir. Çalışmada belirlenen pozitif örneklerin spesifik genlerinin DNA dizi analizleri yapılmış ve belirlenen türlere ait izolatların filogenetik ilişkilerinin ortaya konulması amaçlanmıştır. Çalışma sonucunda, Sivas yöresinde mandalarda T. orientalis, A. phagocytophilum-like 1 ve A. capra türlerinin varlığı ortaya konulmuştur; T. orientalis, %0,54, A. phagocytophilum-like 1, %1,92 ve A. capra, % 14,28 oranında tespit edilmiştir. Yaş ve cinsiyetin enfeksiyon oranlarını etkilemediği belirlenmiştir (p > 0,05). Theileria orientalis pozitif sonuç elde edilen örneklerin hedeflenen 18S SSU rRNA ve MPSP gen bölgesi nükleotid dizilimleri GenBankasına sunularak; 18S SSU rRNA geni değişken bölgesi için OR140730 ve OR140731, MPSP gen bölgesi için OR187857 ve OR187858 erişim numaraları alınmıştır. Theileria orientalis izolatlarının, MPSP geni filogenetik analizi sonucunda, T. orientalis Tip 3 izolatlarının arasında yer aldığı belirlenmiştir. Anaplasma phagocytophilum-like 1 izolatlarının 16S SSU rRNA geni DNA dizilimleri GenBankasına sunularak; OP828918 - OP828920 erişim numaraları alınmıştır. Anaplasma phagocytophilum-like 1 izolatları arasında DNA dizi analizine göre insersiyon (insertion) mutasyonu ve tek nükleotid polimorfizmi (single nucleotide polymorphism, SNP) saptanmıştır. Anaplasma capra gltA, groEL ve 16S SSU rRNA genleri DNA dizilimleri GenBankasına sunularak; ON783817 – ON783818 – ON783819 (gltA), ON783820 – ON783821 – ON783822 (groEL), ON763215 – ON763216 – ON763217 (16S SSU rRNA) erişim numaraları alınmıştır. Anaplasma capra, gltA ve groEL genlerinde yüksek nükleotid farklılığı görülmüş ve bu genler temelinde A. capra'nın iki farklı grup oluşturduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak bu tez çalışmasında; Türkiye'de mandalarda T. orientalis'in varlığı ilk defa belirlendiği gibi A. phagocytophilum-like 1 ve A. capra'nın varlığı dünyada ilk defa ortaya konulmuştur. Ayrıca, A. capra'nın iki farklı genotipinin bulunduğu belirlenmiştir. Özellikle A. phagocytophlum-like-1 ve A. capra'nın patojenitesi ve vektörlerinin belirlenmesine yönelik çalışmaların yapılmasına ihtiyaç olduğu ortaya çıkmıştır.

Özet (Çeviri)

SURVEY OF THEILERIA, BABESIA, ANAPLASMA, AND EHRLICHIA SPECIES IN BUFFALOES IN SIVAS REGION BY MOLECULAR METHODS Sivas Cumhuriyet University, Graduate School of Health Science (Partner with Sivas Cumhuriyet University) Department of Veterinary Parasitology PhD Thesis, July 2023 Supervisor: Prof. Dr. Kürşat ALTAY ABSTRACT Theileria, Babesia, Anaplasma and Ehrlichia species are common in tropical and subtopic climatic zones around the world and can cause subclinical or clinical disease in hosts. Although these hosts experience yield losses during the disease, the disease agents remain for a long time in the hosts that survive the disease, creating a source for vector ticks. Determining the prevalence of diseases in vertebrate hosts will contribute to the creation of protection and control programs for the prevention of diseases. In this study, it was aimed to investigate the presence and prevalence of Theileria, Babesia, Anaplasma and Ehrlichia species in buffaloes in the Sivas region. For this aim, blood samples were collected from 364 buffaloes in the Sivas region (centre, Yıldızeli, Zara, Sarkisla, Ulaş, Suşehri and Koyulhisar), and these samples were analyzed by reverse line blotting (RLB), polymerase chain reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (RFLP) methods for Theileria, Babesia, Anaplasma and Ehrlichia species after total DNA extraction. DNA sequence analyzes of the specific genes of the positive samples determined in the study were made and it was aimed to reveal the phylogenetic relationships of the species by using these sequence sequences. In the study, the presence of T. orientalis, A. phagocytophilum-like 1 and A. capra species was determined in buffaloes in Sivas region. Theileria orientalis, A. phagocytophilum-like 1 and A. capra were detected in 0.54%, 1.92% and 14.28%, respectively. It was determined that age and gender did not affect infection rates (p > 0.05). 18S SSU rRNA gene variable region and MPSP gene region nucleotide sequences of T. orientalis positive samples were submitted to GenBank; Accession numbers OR140730 and OR140731 for the 18S SSU rRNA gene variable region, OR187857 and OR187858 for the MPSP gene region were obtained. As a result of the MPSP gene phylogenetic analysis, T. orientalis isolates were found to be among the T. orientalis Type 3 isolates. 16S SSU rRNA gene DNA sequences of A. phagocytophilum-like 1 isolates were submitted to GenBank; Accession numbers OP828918 – OP828920 have been obtained. According to DNA sequence analysis, insertion mutation and single nucleotide polymorphism (SNP) were detected among A. phagocytophilum-like 1 isolates. Anaplasma capra gltA, groEL and 16S SSU rRNA genes DNA sequences were submitted to GenBank; Accession numbers ON783817 – ON783818 – ON783819 (gltA), ON783820 – ON783821 – ON783822 (groEL), ON763215 – ON763216 – ON763217 (16S SSU rRNA) have been obtained. High nucleotide differences were found in A. capra, gltA and groEL genes, and it was determined that A. capra formed two different groups on the basis of these genes. As a result, in this thesis study; The presence of T. orientalis in buffaloes in Turkey was determined for the first time, and the presence of A. phagocytophilum-like 1 and A. capra was demonstrated for the first time in the world. In addition, it was determined that there are two different genotypes of A. capra. In particular, it has emerged that there is a need for studies to determine the pathogenicity and vectors of A. phagocytophilum-like-1 and A. capra.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    86400

    Sivas yöresinde yaşayan insanlarda yaş ve kan basıncı ile eritrositer parametreler ve vücut ağırlığı arasındaki ilişki

    The Relationship between arterial blood pressure and age with erythrocyte parameters and weight of people living in Sivas

    BAHATTİN ESENDİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    FizyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. UĞUR TARIK TURAÇLAR

  2. Tez No

    90023

    Sivas yöresinde eksternal otit vakalarının etyolojik açıdan değerlendirilmesi ve tedavisi

    Başlık çevirisi yok

    GÖKALP DİZDAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Kulak Burun ve BoğazCumhuriyet Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SUPHİ MÜDERRİS

  3. Tez No

    90031

    Sivas yöresinde prematür doğan 5-8 yaş grubundaki çocukların oküler bulguları

    Başlık çevirisi yok

    ÖZKAN ERGÜR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Göz HastalıklarıCumhuriyet Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CENAP GÜLER

  4. Tez No

    90049

    Sivas yöresinde çocukluk çağında hiperkalsiüri prevalansı, idrar yolu enfeksiyonları ve enürezis olgularında görülme sıklığı

    Başlık çevirisi yok

    GAMZE ALTAY BERÇEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıCumhuriyet Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAYRİ BOZKURT TOKSOY

  5. Tez No

    293411

    İzole Anti-HBc pozitifliği bulunan kan donörlerinde HBV DNA'nın araştırılması

    Research of HBV DNA in blood donors where isolated anti-HBc positivenes is found

    FAHRİYE KÖTEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. A. YASEMİN ÖZTOP

Geri Dön