Yerel Bacillus thuringiensis suşlarında sip gen ve proteinlerinin araştırılması
Investigation of sip genes and proteins in local Basillus thuringiensis strains
- Tez No: 824354
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMİH YILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Bacillus thuringiensis, sip geni, Sip proteini, Bacillus thuringiensis, sip gene, Sip protein
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
B. thuringiensis (Bt), Bacillus cereus (Bc) grubunun bir üyesi olup Gram (+), insektisidal protein üretebilen sporlu bir toprak bakterisidir. Zararlı böceklere karşı mücadele amacı ile ürettikleri insektisidal kristal proteinler (Cry), vejetatif insektisidal proteinler (Vip), salgılanmış insektisidal proteinler (Sip), ve sitolitik proteinler (Cyt) ile birlikte sporları özellikle de tarımda kullanılan başarılı biyoinsektisitlerin ana maddesini oluşturmaktadır. Bunlardan elde edilen farklı formülasyonlar böceklere çeşitli şekillerde uygulanmakta ve etkili sonuçlar alınmaktadır. Bu özelliği nedeniyle günümüzde en etkili ve başarılı şekilde kullanım alanı olan biyo-insektisit kaynağıdır. Bugüne kadar 78 Cry proteini, 3 Cyt proteini, 4 Vip proteini ve 2 Sip proteini kullanılarak Lepidopter, Coleopter, Dipter, Nematod, Himenopter gibi takımlardaki çok sayıda böcek türü üzerinde spesifik aktivite gösteren ürün elde edilmiştir. Bu çalışma daha önceki çalışmalarımızda izole edilerek tanımlanmış olan 116 yerel Bt suşunun sip genleri taşıyıp taşımadığının ve ilgili proteini üretip üretmediğinin belirlenmesi amacı ile yürütülmüştür. 116 adet bakteri suşunda sipa ve sip-s primeri ile yapılan PCR çalışmasında 33 bakteri suşunda sip geni tespit edilmiştir. Diğer primerler kullanılarak yapılan PCR çalışmalarından sip geni ile ilgili bant görüntüsü alınamamıştır. Sip geni bulunduran suşlardan protein izolasyonu yapılarak SDS-PAGE analizi sonucunda kaydedilen görüntülerde 40-41 kDA büyüklüğünde sip geni içeren bakteri suşları belirlenmiştir. Böylece özellikle Coleopter zararlılarına yönelik biyoaktivite çalışmaları, muhtemel toksisitesi ve kullanılabilirliği konusunda önemli bilgiler elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
B. thuringiensis (Bt) is a member of the Bacillus cereus (Bc) group and is a Gram (+) spore soil bacterium capable of producing insecticidal proteins. Insecticidal crystalline proteins (Cry), vegetative insecticidal proteins (Vip), secreted insecticidal proteins (Sip), and cytolytic proteins (Cyt) and their spores are the main ingredients of successful bioinsecticides used especially in agriculture. They are applied in various ways through different formulations obtained from them and effective results are obtained. Due to this feature, it is the most effective and successfully used bioinsecticide source today. To date, 78 Cry proteins, 3 Cyt proteins, 4 Vip proteins and 2 Sip proteins have been used to obtain products with specific activity on many insect species in orders such as Lepidoptera, Coleoptera, Diptera, Nematodes and Hymenoptera. This study was carried out to determine whether 116 local Bt strains, which were isolated and identified in our previous studies, carry sip genes and produce corresponding proteins. In 116 bacterial strains, sip gene was detected in 33 of them in PCR studies with sip-a and sip-s primers. No band image related to the sip gene was obtained from PCR studies with other primers. Protein isolation was performed from the strains containing sip gene and the images recorded as a result of SDS-PAGE analysis revealed bacterial strains containing 40-41 kDa Sip proteins. Thus, valuable information was obtained on bioactivity studies, possible toxicity and their usability especially against Coleopteran species.
Benzer Tezler
- Biocontrol studies on fall webworm (Hyphantria cunea Drury) by using the spore-cry toxins of the Bacillus thuringiensis strains from Turkey
Amerikan beyaz kelebeğinin (Hyphantria cunea Drury) biyokontrolü amacıyla Türkiye'den izole edilen Bacillus thuringiensis (Bt) suşlarının spor-cry toksinlerinin kullanımı üzerine araştırımalar
ESRAA MAHDI SALEH AL-OBAIDI
Doktora
İngilizce
2022
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarım Bilimleri ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ İRFAN İLBAŞ
PROF. DR. SEMİH YILMAZ
- Kahramanmaraş ili sınırları içerisindeki değişik habitatlardan izole edilen Bacillus thuringiensis suşlarının karakterizasyonu ve tarımsal zararlılar üzerindeki etkinliklerinin araştırılması
Characterization and toxicity of Bacillus thuringiensis strains isolated from different locations in Kahramanmaraş district
SUNAY TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
- β-ekzotoksin geni (thuE) taşıyan yerel Bacillus thuringiensis suşlarının belirlenmesi
Determinaton of native Bacillus thuringiensis strains carrying β-exotoxin gene (thuE)
MEHMET ERDEM ÖZER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMİH YILMAZ
- Malacosoma neustria orjinli Bacillus thuringiensis'e ait cry2Ab geninin karakterizasyonu, ekspresyonu ve insektisidal aktivitesinin araştırılması
Characterization, expression and investigation of the insecticidal activities of cry2Ab gene which belongs to Bacillus thuringiensis bacteria origin malacosoma neustria
EMİNE ERYÜZLÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İSMAİL DEMİR
- Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)'ya bazı Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki ırklarının etkinliği üzerine araştırmalar
Research on the efficiency of some Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki strains on Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)
ELİF ŞULE ÇATALBUDAK