Investigation of the role of neddylation pathway in the process of hepatocarcinogenesis
Nedilasyon yolağının hepatokarsinogenez sürecindeki rolünün araştırılması
- Tez No: 826761
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÖKHAN KARAKÜLAH, PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoistatistik, Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biostatistics, Biology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Karaciğer kanseri, özellikle geç tanı ve sınırlı tedavi seçenekleri nedeniyle, küresel sağlıkta acil bir sorun olarak karşımıza çıkmaktadır. Hepatosellüler karsinom (HCC), karaciğer kanserinin en yaygın formunu oluşturmaktadır. HCC için etkili ve hedeflenebilir biyobelirteçlerin araştırılması, birlikte moleküler mekanizmalarının kapsamlı bir şekilde anlaşılması, tedavi yöntemlerinin ilerletilmesi için umut vaat etmektedir. Bu sürecin temelinde yer alan mekanizmalardan biri post-translasyonel modifikasyonlardır ve nedilasyon bu örneklerden biridir. Bu çalışmada, nedilasyon yoluyla bütünleşik olan NEDD8 ve NEDD8 aktivasyon enzimi E1 alt birimi 1 (NAE1)'in ifade profillerini bağımsız HCC veri kümelerinde titizlikle analiz ettik. Ardından, bu genlerin klinikopatolojik verilerle ve prognoz göstergeleriyle ilişkilerini belirledik. Özellikle, her iki gen de tümör örneklerinde, normal komşu dokulara göre daha yüksek ifade gösterdi. Daha sonra, NEDD8 ve NAE1'in yüksek ve düşük ifadesine dayanarak hastalarda farklı transkript profillerini belirledik. Bu, anahtar nedilasyonla ilişkili moleküllerin değişen ifade seviyelerine sahip hasta verileri üzerinde yolak ve fonksiyonel zenginleştirme analizleriyle takip edildi. Çalışmamızı sonlandırırken, seçilen moleküller için in vitro doğrulama çalışmaları gerçekleştirildi. Toplu olarak, bulgularımız hepatokarsinojenez sırasında, nedilasyon mekanizmasının merkezinde yer alan NEDD8 ve NAE1'in ifadesinin önemli değişiklikler geçirdiğini ve potansiyel olarak HCC'de olumsuz bir prognozla ilişkilendirilebileceğini öne sürmektedir. Ayrıca, sonuçlarımız NEDD8 ve NAE1'in terapötik olarak hedeflenmesinin, etkili tedaviler geliştirmek için umut vaat eden bir yol olabileceğini güçlendirmektedir.
Özet (Çeviri)
Liver cancer remains a pressing global health challenge and stands as a leading cause of cancerrelated deaths, primarily due to late diagnoses and limited therapeutic options. Hepatocellular carcinoma (HCC) represents the predominant form of liver cancer. The quest for effective and targetable biomarkers for HCC, coupled with a comprehensive understanding of its molecular mechanisms, holds promise for advancing treatment methodologies. One pivotal mechanism underpinning this process is post-translational modifications, with neddylation being a notable example. In this study, we meticulously analyzed the expression profiles of NEDD8 and the NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1 (NAE1), both integral to the neddylation pathway, across independent HCC datasets. We subsequently discerned their associations with clinicopathological data and prognostic indicators. Notably, both genes exhibited elevated expression in tumor samples compared to their normal adjacent tissues. We then identified differential transcript profiles in patients based on the high and low expression of NEDD8 and NAE1. This was followed by pathway and functional analyses centered on patients with varying expression levels of key neddylation-associated molecules. Concluding our study, in vitro validation experiments were conducted for select molecules. Collectively, our findings posit that during hepatocarcinogenesis, the expression of NEDD8 and NAE1—central to the neddylation mechanism—undergoes significant alterations, potentially correlating with an adverse prognosis in HCC. Moreover, our results bolster the case for therapeutically targeting NEDD8 and NAE1 as a promising avenue for devising effective treatments.
Benzer Tezler
- Östrojenin antiosteoporotik etki mekanizmasında perisitlerin rolünün overektomili sıçanlarda araştırılması
Investigation of the role of pericytes in the antiosteoporotic effect mechanism of estrogen in ovarectomised rats
HAMZA HALICI
Doktora
Türkçe
2024
Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELİF ÇADIRCI
- Belirsizlik algısı ve anksiyete ilişkisinde temel psikolojik ihtiyaçların rolünün değer yönelimleri bağlamında incelenmesi
Investigation of the role of basic psychological needs in the relationship between perception of uncertainty and anxiety in the context of value orientations
AYBİKE ÇAVDAR
Doktora
Türkçe
2024
PsikolojiDokuz Eylül ÜniversitesiPsikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ BOYACIOĞLU BAL
- Zekâ oyunlarının kavram yanılgılarını gidermedeki rolünün incelenmesi
Investigation of the role of intelligent games in removing misconceptions
ASLI NUR HODANCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Eğitim ve ÖğretimGiresun ÜniversitesiMatematik Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MİHRİBAN HACISALİHOĞLU KARADENİZ
- Sıçanlarda deneysel gentamisin nefrotoksisitesinde oksidatif stresin rolünün ve olası oksidatif stres üzerine kafeik asit Fenetil Ester'in etkisinin araştırılması
Investigation of the role of oxidative stress in experimental gentamicin b induced nephrotoxixity and effect of caffeic acid phenethyl ester on possible oxidative stress in rats
FADİME ÖZGE AYGÜN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSüleyman Demirel ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FÜSUN ZEYNEP AKÇAM
YRD. DOÇ. DR. ONUR KAYA
- Acil servise epileptik atak olarak başvuran hastalarda serum subfatin düzeyinin rolünün araştırılması
Investigation of the role of serum subfatin levels in patients presenting to the emergency department with epileptic seizures
MUSTAFA TOLGA ÖZDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Acil TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL KAYA