Investigation of the role of neddylation pathway in the process of hepatocarcinogenesis
Nedilasyon yolağının hepatokarsinogenez sürecindeki rolünün araştırılması
- Tez No: 826761
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÖKHAN KARAKÜLAH, PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoistatistik, Tıbbi Biyoloji, Biology, Biostatistics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Karaciğer kanseri, özellikle geç tanı ve sınırlı tedavi seçenekleri nedeniyle, küresel sağlıkta acil bir sorun olarak karşımıza çıkmaktadır. Hepatosellüler karsinom (HCC), karaciğer kanserinin en yaygın formunu oluşturmaktadır. HCC için etkili ve hedeflenebilir biyobelirteçlerin araştırılması, birlikte moleküler mekanizmalarının kapsamlı bir şekilde anlaşılması, tedavi yöntemlerinin ilerletilmesi için umut vaat etmektedir. Bu sürecin temelinde yer alan mekanizmalardan biri post-translasyonel modifikasyonlardır ve nedilasyon bu örneklerden biridir. Bu çalışmada, nedilasyon yoluyla bütünleşik olan NEDD8 ve NEDD8 aktivasyon enzimi E1 alt birimi 1 (NAE1)'in ifade profillerini bağımsız HCC veri kümelerinde titizlikle analiz ettik. Ardından, bu genlerin klinikopatolojik verilerle ve prognoz göstergeleriyle ilişkilerini belirledik. Özellikle, her iki gen de tümör örneklerinde, normal komşu dokulara göre daha yüksek ifade gösterdi. Daha sonra, NEDD8 ve NAE1'in yüksek ve düşük ifadesine dayanarak hastalarda farklı transkript profillerini belirledik. Bu, anahtar nedilasyonla ilişkili moleküllerin değişen ifade seviyelerine sahip hasta verileri üzerinde yolak ve fonksiyonel zenginleştirme analizleriyle takip edildi. Çalışmamızı sonlandırırken, seçilen moleküller için in vitro doğrulama çalışmaları gerçekleştirildi. Toplu olarak, bulgularımız hepatokarsinojenez sırasında, nedilasyon mekanizmasının merkezinde yer alan NEDD8 ve NAE1'in ifadesinin önemli değişiklikler geçirdiğini ve potansiyel olarak HCC'de olumsuz bir prognozla ilişkilendirilebileceğini öne sürmektedir. Ayrıca, sonuçlarımız NEDD8 ve NAE1'in terapötik olarak hedeflenmesinin, etkili tedaviler geliştirmek için umut vaat eden bir yol olabileceğini güçlendirmektedir.
Özet (Çeviri)
Liver cancer remains a pressing global health challenge and stands as a leading cause of cancer related deaths, primarily due to late diagnoses and limited therapeutic options. Hepatocellular carcinoma (HCC) represents the predominant form of liver cancer. The quest for effective and targetable biomarkers for HCC, coupled with a comprehensive understanding of its molecular mechanisms, holds promise for advancing treatment methodologies. One pivotal mechanism underpinning this process is post-translational modifications, with neddylation being a notable example. In this study, we meticulously analyzed the expression profiles of NEDD8 and the NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1 (NAE1), both integral to the neddylation pathway, across independent HCC datasets. We subsequently discerned their associations with clinicopathological data and prognostic indicators. Notably, both genes exhibited elevated expression in tumor samples compared to their normal adjacent tissues. We then identified differential transcript profiles in patients based on the high and low expression of NEDD8 and NAE1. This was followed by pathway and functional analyses centered on patients with varying expression levels of key neddylation-associated molecules. Concluding our study, in vitro validation experiments were conducted for select molecules. Collectively, our findings posit that during hepatocarcinogenesis, the expression of NEDD8 and NAE1—central to the neddylation mechanism—undergoes significant alterations, potentially correlating with an adverse prognosis in HCC. Moreover, our results bolster the case for therapeutically targeting NEDD8 and NAE1 as a promising avenue for devising effective treatments.
Benzer Tezler
- Investigation of the role of different regions of the Cbl protein in its function
Başlık çevirisi yok
NURETTİN İLTER SEVER
- Investigation of the role of a canditate effector of wheat stripe rust pathogen in plant immunity
Aday sarıpas patojen efektör proteininin bitki immünitesindeki rolünün araştırılması
BAYANTES DAGVADORJ
Doktora
İngilizce
2016
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. MAHİNUR AKKAYA
Prof. Dr. ERDOĞAN EŞREF HAKKI
- Investigation of the role of cGAMP in differentiation of T lymphocytes
T lenfosit farklılaşması üzerine cGAMP`ın rolünün incelenmesi
BEGÜM YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İHSAN GÜRSEL
- Investigation of the role of programmed cell death 10 (PDCD10) protein in multidrug resistance
Programlı hücre ölümü 10 (PDCD10) proteininin çoklu ilaç dirençliliğindeki rolünün incelenmesi
ÇAĞRI URFALI
- Investigation of the role of IroC in asymmetric cell division
IroC genlerinin asimetrik hücre bölünmesi üzerindeki rollerinin araştırılması
DURAN EMRE KANACI
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS