Geri Dön

Purification and modeling of linear gradient elution chromatography of tagI endonuclease

TagI endonükleazının lineer gradyen kromatografi yöntemiyle saflaştırılması ve modellenmesi

  1. Tez No: 82886
  2. Yazar: MEHMET GÜRCAN DÜZENLİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. KUTLU ÜLGEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya Mühendisliği, Chemical Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Biyokimya, Enzim saflaştırması, Matematiksel modelleme, Proteinler, Biochemistry, Enzyme purification, Mathematical modelling, Proteins
  7. Yıl: 1999
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET Biyokimya alanında yapılan çalışmaların büyük bir bölümü protein ve enzimlerin saflaştırılması ve analizi üzerinedir. Değerli proteinlerin kromatografik yöntemlerle saflaştmlmasının önemi son yıllarda daha da anlaşılmıştır. Bu çalışmada ilk olarak, Tagî endonükleazmın saflaştırılması işlemi HPLC yöntemiyle, iyon deştirici kolonlar kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla katyon değiştirici kolonda hareketli faz olarak sodyum asetat (pH: 5.0) ve fosfat (pH:7.0), anyon değiştirici kolonlarda ise L-Histidine (pH:6.0) ve Tris (pH:8.0) kullanılmıştır. Deneysel sonuçlar, anyon değiştirici kullanılarak elde edilen enzim miktarının katyon değiştirici kullanılarak elde edilenin üç katı olduğunu göstermiştir. Kolona enjekt edilen miktarın optimum değeri 3 mi olarak bulunmuştur; zira daha az miktarda enjeksiyon, seyrelmeden kaynaklanan aktivite kaybına sebep olmuş, daha fazla miktardaki enjeksiyonun ise kolonun aşın yüklenmesine sebep olduğu bildirilmiştir. İkinci aşamada ise, birinci bölümde elde edilen deneysel profiller, baza modellerin sayısal olarak çözülmesiyle elde edilmiştir. Bu modellerden Denge teorisi en iyi yaklaşımı verirken; Hız ve Raf teorileri, Tagl endonükleazı hakkındaki fiziksel/kimyasal özelliklerin yeterince bilinmemesinden dolayı genellikle başarısız olmuştur. Ayrıca bazı deneysel ve matematiksel parametrelerin hesaplanan profiller üzerindeki etkisi incelenmiştir.

Özet (Çeviri)

IV ABSTRACT Most of the research in biochemistry science is devoted to the purification and analysis of the proteins and enzymes. The importance of chromatographic methods for the purification of high-value proteins has been increasingly recognized over the past decade. In the present work, first, the purification of Taql endonuclease was performed with HPLC using cation exchange column with the buffers Na Acetate (pH: 5.0) and phosphate (pH: 7.0), and anion exchange column with the buffers L-Histidine (pH: 6.0) and Tris (pH: 8.0). The experimental results showed that the enzyme recovery with the anion exchange column was three fold the amount obtained with the cation exchange column. 3 ml injections was found to be optimum since less amounts caused lost of activity because of dilution, and more amounts have been reported to cause overloading of the column. In the second part of this study, some models were solved numerically in order to predict the experimental chromatograms which had been obtained in the first part. Among the all models, Equilibrium theory resulted in the closest fits whereas Rate and Plate theories were generally unsuccessful because of the lack of physical/chemical data for the Taql endonuclease. The effects of some experimental and mathematical parameters on calculated chromatograms were also investigated.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    503750

    İnvaziv duktal karsinom tanısı almış meme dokusu örneklerine ait n-bağlı glikozilasyon yapılarının glikomiks yaklaşımı ile analizi ve biyobelirteç potansiyellerinin araştırılması

    Analysis of n-linked glycosylation patterns from invasive ductal carcinoma recognized breast tissue specimens by glycomics approach and investigation of their biomarker potentials

    MEHMET EMRAH YAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YÜCEL KADIOĞLU

  2. Tez No

    676815

    Variant pathogenicity prediction tool based on protein-protein interactions and the effects of variants on 3-dimensional protein structure:a model for monogenic autoinflammatory disorders

    Protein protein etkileşimlerini ve varyantların 3 boyutlu protein yapısındaki etkilerini esas alan varyant patojenite tahmini

    ABDULLAH ALPER BÜLBÜL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Biyoistatistikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI

  3. Tez No

    381898

    Zorlanmış salınımlı dikey akışta gözenekli ortamın ısı geçişine etkisinin deneysel incelenmesi

    Experimental investigations on the effect of porous media on heat transfer from vertical forced oscillated fluid flow

    ESRA KEŞAF

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    ÖĞR. GÖR. ERSİN SAYAR

  4. Tez No

    2181

    Kuvvetli atıkların yukarı akışlı havasız filtrelerde arıtım kinetiği

    Kinetics of strong waste treatment by anqerobic upflow filters

    M.ATALAY TİMUR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    DOÇ. DR. DERİN ORHON

  5. Tez No

    437887

    Zymomonas mobilis ile levansukraz enziminin üretimi ve saflaştırılması

    Production and purification of levansucrase enzyme by Zymomonas mobilis

    ÖZLEM ERDAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Gıda MühendisliğiEge Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET YEKTA GÖKSUNGUR

Geri Dön