Klinik bacteroides fragilis grubu ı̇zolatlarda enterotoksin ve antibiyotik direnç genlerinin prevalansı ve moleküler tiplendirme
Prevalence of enterotoxin and antibiotic resistance genes and molecular typing of clinical bacteroides fragilis group isolates
- Tez No: 829878
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLŞEN HAZIROLAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Bacteroides fragilis grubu (BFG) izolatları ile gelişen enfeksiyonların tedavisinde kullanılan antibiyotiklere dünya çapında artan direnç oranları bildirilmektedir. Direnç profilleri ülkeler, bölgeler ve hatta hastaneler arasında değiştiği için sürveyans önem arz etmektedir. Bu çalışmada hastanemizde BFG izolatlarında antibiyotik direnç prevalansının, direncin genetik mekanizmalarının belirlenmesi ve bu izolatların moleküler epidemiyolojisinin saptanması amaçlanmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri agar dilüsyon yöntemiyle, direnç genleri tespiti gerçek zamanlı PZR yöntemiyle, moleküler tiplendirme AP-PCR yöntemiyle yapılmıştır. BFG izolatlarının ampisilin, sefoksitin, piperasilin/tazobaktam, imipenem, meropenem, klindamisin, metronidazol ve tigesikline karşı direnç oranları sırasıyla %97.8, %28.3, %11.6, %7.9, %5.1, %47.8, %0 ve %4.3'tür. Tüm izolatlar içinde cepA, cfxA, cfiA, ermF, ermG, ermB, nim, linA, mefA, msrSA, tetQ, tetX, tetX1 ve bft geni sırasıyla %42.8, %44.9, %8.7, %44.2, %10.9, %2.2, %0.7, %29, %17.4, %7.2, %76.1, %8, %37.7 ve %16.7 oranlarında saptanmıştır. Klindamisin direnç genlerinin (ermF, ermG, ermB, mefA, msrSA, linA) BFG izolatlarında yaygın olduğu belirlenmiştir. Karbapenem direnç geni (cfiA) taşıyan 12 B. fragilis izolatının beşinde upstream bölgesinde IS [IS1187(n=3), ISBf6(n=1), IS612B(n=1)] saptanmıştır. Bu izolatlarda yüksek imipenemaz aktivitesi olduğu gözlenmiştir. Metronidazole azalmış duyarlılık saptanan bir izolatta nimE geni saptanmıştır. AP-PCR ile 101 farklı genotip saptanmış, BFG'de yüksek düzeyde genetik farklılık olduğu gözlenmiştir. Bu çalışmada, BFG izolatlarının antibiyotiklere direnç durumları ve direnç gelişiminde önemli role sahip direnç genlerine ait veri sağlanmıştır.
Özet (Çeviri)
Increasing rates of resistance to antibiotics used in the treatment of infections caused by Bacteroides fragilis group (BFG) isolates are reported worldwide. Surveillance is important as resistance profiles vary among countries, regions, and even hospitals. In this study, it was aimed to determine the prevalence of antibiotic resistance, and genetic mechanisms of resistance in BFG isolates, and to determine the molecular epidemiology of these isolates in our hospital. Antibiotic susceptibility tests were performed using the agar dilution method, resistance genes were determined using the real-time PCR method and molecular typing was performed using the AP-PCR method. The resistance rates of BFG isolates against ampicillin, cefoxitin, piperacillin/tazobactam, imipenem, meropenem, clindamycin, metronidazole, and tigecycline were 97.8%, 28.3%, 11.6%, 7.9%, 5.1%, 47.8%, 0%, and 4.3%, respectively. Among all isolates, cepA, cfxA, cfiA, ermF, ermG, ermB, nim, linA, mefA, msrSA, tetQ, tetX, tetX1 and bft genes were 42.8%, 44.9%, 8.7%, 44.2%, 10.9%, 2.2%, 0.7%, 29%, 17.4%, 7.2%, 76.1%, 8%, 37.7% and 16.7%, respectively. Clindamycin resistance genes (ermF, ermG, ermB, mefA, msrSA, linA) were determined to be common in BFG isolates. ISs [IS1187(n=3), ISBf6(n=1), IS612B(n=1)] were detected in the upstream region of five out of 12 B. fragilis isolates carrying the carbapenem resistance gene (cfiA). High imipenemase activity was observed in these isolates. The nimE gene was detected in one isolate with decreased susceptibility to metronidazole. A total of 101 different genotypes were detected by AP-PCR, indicating high genetic diversity within BFG. In this study, data related to the antibiotic resistance of BFG isolates and the resistance genes that play an important role in the development of resistance are provided.
Benzer Tezler
- Bacteroides fragilis grubu bakterilerde antibiyotiklere direncin araştırılması
Investigation on antimicrobial resistance of bacteroides fragilis grup bacteria
ACHILLE AIME KANGABA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜZEYYEN MAMAL TORUN
- Enfeksiyon etkeni bacteroides ızolatlarının protein sentezini ınhibe eden antibiyotiklere karşı oluşan direncin fenotipik ve genotipik yönden araştırılması
Phenotypical and genotypical investigation of resistance to antibioticsinhibiting protein synthesis of infectious bacteroides isolates
BERMAL TEKEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURVER ÜLGER
- Patojen Bacteroides fragilis grubu bakterilerin karbapenemlere direncinin fenotipik ve genotipik yönden araştırılması
Phenotypic and genotypic investigation of the resistance of pathogenic Bacteroides fragilis group bacteria to carbapenems
ALEYNA ÖZKAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURVER ÜLGER
- Bacteroides fragilis grubu bakterilerin agarda dilüsyon ve disk difüzyon duyarlılık metodları kullanılarak antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
Determination of antibiotic susceptibility of bacteroides fragilis group bacteria using agar dilution and disc diffusion susceptibility methods
SEMRA EMİNOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURVER ÜLGER
- Bacteroides fragilis grubu bakterilerde karbapenem ve 5-nitroimidazol direncinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle arastırılması
Investigation of carbapenem and 5-nitroimidazole resistance among bacteroides fragilis group bacteria by phenotypic and genotypic methods
ÖZLEM UZUNKAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURVER ÜLGER