Geri Dön

Enfeksiyon etkeni bacteroides ızolatlarının protein sentezini ınhibe eden antibiyotiklere karşı oluşan direncin fenotipik ve genotipik yönden araştırılması

Phenotypical and genotypical investigation of resistance to antibioticsinhibiting protein synthesis of infectious bacteroides isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 645104
  2. Yazar: BERMAL TEKEŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURVER ÜLGER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Bacteroides fragilis grubu bakteri, tetrasiklin, tigesiklin, klindamisin, kloramfenikol
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Amaç: Kolon mikrobiyotasının önemli bir bölümünü oluşturan Bacteroides fragilis grubu (BFG) bakteriler, anaerop kaynaklı enfeksiyonlar arasında birinci sırada izole edilen bakteri grubunda yer almaktadır. Klinik ipuçlarının çok özel olmaması, tedavinin etken bakterinin türüne göre değişiyor olması, antibiyotiklere direncinin bilinmesini gerekli kılmaktadır. Yapılan bu çalışmada; BFG bakterilerin protein sentezini inhibe eden antibiyotiklere karşı oluşan direnci hem genotipik olarak hem de BFG bakterilerin in-vitro ortamda antibiyotik duyarlılık yöntemleri kullanılarak fenotipik olarak tespit etmek hedeflerimiz arasında yer almıştır. YÖNTEM: Hastanemizin mikrobiyoloji laboratuvarında, klinik örneklerden izole edilmiş ve stoklanmış 2017 ve 2018 yılına ait toplam 83 BFG bakteri çalışmaya alınmıştır. İzolatların protein sentezini inhibe eden antimikrobiyallere karşı oluşan duyarlılık profilinin belirlenmesinde Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) kabul ettiği (CLSI,2007), referans yöntem olarak M11-A7 dökümanında belirtilen agarda dilüsyon metodu ile tespit edilmiştir. Antibiyotik direncine neden olabileceği düşünülen tetX, tetQ, tetX1, tet36, tetM ve ermF direnç genleri ise, özgül primerler kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile araştırılmıştır. BULGULAR: Çoğu batın içi apsesinde olmak ile (n=32) apse, (n=4), kan (n=14), doku (n=14) gibi çeşitli örneklerden izole edilen BFG bakterileri MALDI-TOF MS ile tanımlanmıştır. Tüm türler için MİK50 ve MİK90 değerleri belirlenmiştir; Tetrasiklin ve Klindamisin direncinde rol alan tetX (n=33), tetQ (n=41), tetX1 (n=14), tet36 (n=22), tetM (n=26), ermF (n=47) genleri pozitif olarak bulunmuştur. SONUÇ: Elde ettiğimiz veriler de Klindamisin antibiyotiğine karşı fenotipik direnci olmayan izolatlarda (n=11) ermF sessiz geni, tetrasikline antibiyotiği içinde; tetX (n=1), tetQ (n=3), tetX1 (n= 2), tet36 (n=1), tetM (n=3) sessiz genleri gözlemlenmiştir. Bu durumun ileriki zamanlarda direnç oranlarının artışı ile karşımıza çıkacağını düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

1. ABSTRACT AIM: Bacteroides fragilis group (BFG) bacteria, which constitute an important part of colon microbiota, are most commonly isolated in anaerobic infections. The aim of this study; to determine the susceptibility profile of BFG bacteria, isolated in the microbiology laboratory of Marmara University Pendik Training and Research Hospital, against to tetracycline, tigecycline, clindamycin and chloramphenicol antimicrobials. We also planned to investigate the presence of resistance genes for these antimicrobials in the BFG isolates. METHOD: This study eighty three clinical specimens were examined for isolation of the BFG group bacteria in Medical Microbiology Laboratory between the 2017 betwen 2018. The isolates identification of the sensitivity profiles against antimicrobials inhibiting protein synthesis Clinical and Laboratory Standards Institute accepts (CLSI,2007) referance method by the dilution method in the agar indicated in the M11- A7 document. Additionally, the presence of 6 genes encoding antibiotic resistance was determined by PCR. CONCLUSİONS: The most of in isolated from deep seated abscess (n=32), abscess (n=4), blood (n=14), tissue (n=14) the frequency of isolation of different BFG group bacteria from various clinical specimens The isolated were identified MALDI-TOF MS methods. Antibiotic resistance rates against to, tetracyclin and clindamycin resistance genes; tetX (n=33), tetQ (n=41), tetX1 (n=14), tet36 (n=22), tetM (n=26), ermF (n=47) positive found. RESULT: The analyzed environmental BFG strains were highly resistant to the tested antibiotics. Clindamycin antibiotics not resistance phenotypical isolates is (n=11) ermF; tetracycline in antibiotics tetX (n=1), tetQ (n=3), tetX1 (n= 2), tet36 (n=1), tetM (n=3) silent genes. As a result antibiotic stewardship and infection control is very important in the are of multidrug-resistance and lack of development new antimicrobial agents KEYWORDS: BFG bacteria, clindamycin,tetracyclin, cholarmfenicol,clindamycin

Benzer Tezler

  1. Tez No

    645099

    Bacteroides fragilis grubu bakterilerin agarda dilüsyon ve disk difüzyon duyarlılık metodları kullanılarak antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

    Determination of antibiotic susceptibility of bacteroides fragilis group bacteria using agar dilution and disc diffusion susceptibility methods

    SEMRA EMİNOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURVER ÜLGER

  2. Tez No

    70128

    KOAH akut alevlenmesi ile başvuran hastalarda steril fırça, bronko alveoler lavaj ve balgam örneklerinin mikrobiyolojik değerlendirilesi

    The Microbiology of chronic bronchitis with exacerbation by protected catheter brush, bronchoalveolar lavage and sputum

    LEVENT KART

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Göğüs HastalıklarıErciyes Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RAMAZAN DEMİR

  3. Tez No

    478010

    Erişkin yoğun bakım ünitelerindeki bakteriyemi etkeni olarak saptanan gram pozitif bakterilerin ve direnç genlerinin hızlı tanısında mikroarray ve lizis filtrasyon yöntemlerinin karşılaştırılması

    Comparison of microarray and lysis filtration combined maldi tof ms procedures for the rapid diagnosis of gram positive bacteries and their resistance genes in adult intensive care unit patients

    AYŞE ARSLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ALİ ÖZİNEL

  4. Tez No

    375190

    Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi enfeksiyon hastalıkları kliniğince izlenen yoğun bakım ünitelerinde 2010-2013 yılları arasında gelişen hastane enfeksiyonlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of the nosocomial infections seen between 2010-2013 in the intensive care units which controlled by infectious disease clinic of the Necmettin Erbakan University Meram Medical Faculty

    ARZU ARIBAŞ TARAKÇI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İBRAHİM ERAYMAN

  5. Tez No

    734435

    Başlangıçta ateş odağı saptanamayan 1-12 ay arası infantlarda ateş etiyolojisi

    Etiology of fever without a source in infants between 1-12 months

    DENİZ CAMCI ERTEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUHAMMED ALİ KANIK

Geri Dön