Geri Dön

Antigenic peptide discovery and multi epitope vaccine design of Trichomonas vaginalis pathogen using in silico bioinformatics

Siliko biyoinformatikte kullanılan Trıchomonas vagınalıs patojeninin antijenik peptit keşfi ve çoklu epıtop aşısı tasarımı

  1. Tez No: 837273
  2. Yazar: IKRAM ESSEBBAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AHMET EFE KÖSEOĞLU, PROF. DR. ELİF SİBEL ASLAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Biruni Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

Trichomoniasis, dünya çapında en yaygın viral olmayan cinsel yolla bulaşan enfeksiyon (STI), trikomonas vaginalis protozoanın neden olduğu, bu hastalıklar için onaylanmış ve etkili ilaca karşı farklı bir direnç mekanizması geliştirdi. Bu nedenle, insanı bu patojene karşı önleyebilecek ve aşılayabilecek potansiyel bir aşı geliştirmek için saat gerekir. Biyoinformatik ve immünoinformatik yaklaşımları kullanarak, aşı tasarımını oluşturmak için farklı B hücresi ve T hücresi epitoplarının tahmin edildiği, en antijenik, alerjik olmayan ve toksik olmayan epitopları seçmek için epitopların tüm fiziko-kimyasal parametreleri analiz edildi, Epitoplara ek olarak, bağışıklığı arttırmak için adjuvan ve aşı adayını oluşturmak için EAAAK, AAY ve GPGPG gibi bağlayıcılar birleştirildi Silico'da umut verici sonuçlar gösteren gelişmiş aşı yapısı ve in vitro ve in vivo test edilecekse iyi sonuçlar gösterecektir.

Özet (Çeviri)

Trichomoniasis is the most common non-viral sexually transmitted infection (STI) worldwide, caused by trichomonas vaginalis protozoan, this latter, developed a different resistance mechanisms against the only approved and effective drug for this diseases. Therefore, it is need of the hour to develop a potential vaccine that can prevent and immunize the human being against this pathogen. Using bioinformatics and immunoinformatics approaches, different B cell and T cell epitopes were predicted to construct the vaccine design, all the physico-chemical parameters of the epitopes were analysed in order to select the most antigenic, non allergenic and non toxic epitopes, In addition to the epitopes, adjuvant in order to increase the immunity and linkers such as EAAAK, AAY and GPGPG were combined to construct the vaccine candidate The developed vaccine construct showing promising results in-silico and it will also show good results if it would be tested in-vitro and in-vivo.

Benzer Tezler

  1. Koyunlarda viral hastalık maedi-visna'ya karşı aşı geliştirilmesinde antijenik epitopların keşfi

    Discovery of antigenic epitopes in vaccine development against viral disease maedi-visna in sheep

    ECEM SU KOÇKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEMAL ÜN

  2. Structural and thermodynamic analyses of peptide-based nanomaterials via molecular dynamics simulations

    Peptit bazlı nanomalzemelerin moleküler dinamik simulasyonlar aracılığı ile yapısal ve termodinamik özelliklerinin analizi

    ÖZGE ŞENSOY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyofizikKoç Üniversitesi

    Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET SAYAR

  3. Expression, purification, and characterization of recombinant human IL-2

    Rekombinant insan IL-2'nin ekspresyonu, saflaştırılması ve karakterizasyonu

    BUSE AKGÜN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Nörotoksin analizi için immünassay geliştirilmesi

    Development of immunoassay for neurotoxin analysis

    MERYEM IŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NACİ ÇİNE

    DOÇ. DR. SELMA ÖZTÜRK

  5. Structural analysis of arthritogenic peptide and HLA-B2705 interactions for the immune pathogenesis of ankylosing spondylitis with molecular simulations

    Ankilozan spondilitin immün patogenezi için moleküler simülasyonlarla artritojenik peptid ve HLA-B2705 etkileşimlerinin yapısal analizi

    SENA KIVRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyoistatistikAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Biyoistatistik ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜNSELİ BAYRAM AKÇAPINAR