Marmara Bölgesi'nde soğan, sarımsak, pırasa üretim alanlarındaki virüslerin tanısı, moleküler karakterizasyonu, bazı soğan ve sarımsak genotiplerinin en yaygın virüse karşı reaksiyonlarının belirlenmesi
Identification and molecular characterisation of viruses inonion, garlic and leek production areas in the MarmaraRegion and determination of the reactions of some onion andgarlic genotypes against the most common viruses
- Tez No: 845529
- Danışmanlar: PROF. DR. GASSAN KÖKLÜ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 129
Özet
Bu çalışmada, Marmara Bölgesi (Bursa, Edirne, Kocaeli, Kırklareli, Sakarya ve Tekirdağ) soğan, sarımsak ve pırasa üretim alanlarında Onion yellow dwarf virus (OYDV), Leek yellow stripe virus (LYSV), Garlic common latent virus (GCLV), Shallot latent virus (SLV) ve Iris yellow spot virus (IYSV) 'un belirlenmesi, elde edilen izolatların genotipik yatkınlık düzeylerinin ve genotiplerin en yaygın virüse karşı reaksiyonlarının ortaya çıkarılması amaçlanmıştır. 778 adet soğan, sarımsak ve pırasa bitkisinden örnekleme yapılmış ve toplanan örnekler OYDV, LYSV, GCLV, SLV ve IYSV'ye karşı ELISA ve RT-PCR yöntemleri ile testlenmiştir. Yapılan test çalışması sonucunda toplanan örneklerin 372 tanesinin (%47.8) enfekteli olduğu belirlenmiştir. Örneklerin 175 tanesinde (%22.49) OYDV, 26 tanesinde (%3.34) GCLV, 79 tanesinde (%10.15) LYSV, 53 tanesinde (%6.81) IYSV, 39 tanesinde (%5.01) SLV ve enfekteli örneklerin 62 tanesinde (%16.6) karışık enfeksiyon tespit edilmiştir. Atatürk Bahçe Kültürleri Merkez Araştırma Enstitüsü'ne ait 6 adet sarımsak ve 15 adet soğan genotipine Bursa'dan alınan OYDV TR-OK64 (OR923732) izolatı inokule edilmiş, JMP Pro 13 programı kullanılarak istatiksel hesaplamalar yapılmıştır. Bunun sonucunda sarımsak genotiplerinin yaprak uzunluğunda %13.49-23.9, yumru baş boyunda %18.38-28.73, yumru baş çapında %21.88-30.81, yumru baş ağırlığında %23.21-29.14; soğan genotiplerinin yaprak uzunluğunda %12.12-41.04, yumru baş ağırlığında %12.96-48.30, yumru çapında %11.57-30.17, yumru baş boyunda %11.81-31.72 oranında azalma meydana gelmiştir. Filogenetik analiz sonucunda GCLV izolatları %85.2-97, IYSV izolatları %90.4- 97.5, LYSV izolatları %84.6-98.1, OYDV izolatları %74.1-99.8 ve SLV izolatları %78.2-91.7 oranlarında NCBI GenBankasına kayıtlı bazı izolatlarla nükleotid dizilimi bakımından benzerlik göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, Onion yellow dwarf virus (OYDV), Leek yellow stripe virus (LYSV), Garlic common latent virus (GCLV), Shallot latent virus (SLV) and Iris yellow spot virus's (IYSV) were investigated in onion, garlic and leekgrowing areas, genotypic susceptibility levels and genotypes reactions to the most common virus were aimed in areas of Marmara Region (Bursa, Edirne, Kocaeli, Kırklareli, Sakarya and Tekirdağ). 778 onion, garlic and leek plants were sampled and the collected samples were tested against OYDV, LYSV, GCLV, SLV and IYSV by ELISA and RT-PCR methods. As a result of the test study, 372 (47.8%) of the collected samples were found to be infected. OYDV was detected in 175 (22.49%), GCLV in 26 (3.34%), LYSV in 79 (10.15%), IYSV in 53 (6.81%), SLV in 39 (5.01%) and mixed infection in 62 (16.6%) of the infected samples. Six garlic and 15 onion genotypes of Atatürk Horticultural Research Institute were inoculated with OYDV TR-OK64 (OR923732) isolate from Bursa and statistical calculations were made using JMP Pro 13 program. As a result, 13.49-23.9% decrease in leaf length, 18.38-28.73% decrease in tuber head length, 21.88-30.81% decrease in tuber head diameter, 23.21-29.14% decrease in tuber head weight of garlic genotypes; 12.12-41.04% decrease in leaf length, 12.96-48.30% decrease in tuber head weight, 11.57-30.17% decrease in tuber diameter, 11.81-31.72% decrease in tuber head length of onion genotypes. As a result of phylogenetic analysis, GCLV isolates 85.2-97%, IYSV isolates 90.4-97.5%, LYSV isolates 84.6-98.1%, OYDV isolates 74.1-99.8% and SLV isolates 78.2-91.7% showed similarity in terms of nucleotide sequence with some isolates registered in NCBI GenBank.
Benzer Tezler
- Güney Marmara bölgesinde allium cinsi bitkilerde potyvirüslerin tanılanması ve karakterizasyonu
Detection and characterization of potyvirus in plants of allium genus in South Marmara region
HASAN TUNA TUZLALI
Doktora
Türkçe
2018
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAVAŞ KORKMAZ
- Fatih ilçesi'nde yaşanan fiziksel ve sosyal köhnemenin suç ve gayrimenkul fiyatları üzerindeki etkisinin belirlenmesi
Determination of the effect of physical and social deterioration in Fatih district on crime and real estate prices
ŞEYMA YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Şehircilik ve Bölge PlanlamaBursa Teknik ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖMER BİLEN
- Güney Marmara ekolojisinde ısıtmasız seralarda sebze yetiştiriciliği için uygun ürün deseninin belirlenmesi
Determination of crop design for vegetable growing under unheated greenhouse in South of Marmara region
İBRAHİM SÖNMEZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatUludağ ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET ÖZGÜR
- Soğan tohumunun hassas ve normal sıravarı ekici düzenle ekimi üzerinde karşılaştırmalı bir araştırma
Başlık çevirisi yok
ERDAL ÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1990
ZiraatEge ÜniversitesiTarımsal Mekanizasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMET ÖNAL
- İstanbul Boğazı sektör Kandilli sorumluluk bölgesinde seyir emniyeti değerlendirmesi
A navigational safety assessment for sector Kandilli responsibility zone of Istanbul Strait
LEVENT ÜLKER
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
DenizcilikOrdu ÜniversitesiDeniz Ulaştırma Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ADİL SÖZER