Ras onkogenini hedefleyen ilaç öncüllerinin geliştirilmesi
Development of drug derivatives targeting oncogenic ras protein
- Tez No: 846868
- Danışmanlar: PROF. DR. EMİNE SÜMER ARAS, PROF. DR. GÜLAY BULUT
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada faj sunumu ile tanımlanan ilaç öncülü adaylarının yüzey plazmon rezonans yöntemi kullanılarak Kras doğal tip ve G12D mutant proteinine bağlanma afiniteleri analiz edilmiştir. Kras'a yüksek afinite ile bağlandığı gösterilen peptit yapılarının onkogenik Ras'ın fonksiyonel aktiviteleri üzerindeki olası inhibe edici etkileri incelenmiştir. Bu aşamadaki çalışmalarda BxPC-3 ve AsPC1 pankreas kanseri hücre hatları kullanılmıştır. Hücresel çalışmalar kapsamında belirlenen peptitlerin hücre proliferasyonu-sitotoksisite ve motilite analizi gerçekleştirilmiştir. Bu çalışma kapsamında faj sunumu ile doğal tip ve mutant KrasG12D mutantına bağlandığı belirlenen 12 amino asit uzunluğunda 7 peptit dizisi belirlenmiş olup bu yapıların 3 tanesinin ilgili hedef proteinlerine yüksek afinite ile bağlandığı yüzey plazmon rezonans analizi ile saptanmıştır. Pankreas kanseri hücre hatlarında gerçekleştirilen yara iyileşme deneyinde peptit 3'ün yara iyileşmesini anlamlı düzeyde inhibe ettiği gözlenmiştir. Elde edilen verilerin pankreas kanseri başta olmak üzere KrasG12D mutasyonu taşıyan kanser türleri tedavisinde etkili olabilecek yeni ilaç öncülleri geliştirilmesi, kişiye özgü tedaviye olanak tanınmasına katkı sağlaması, ilişkili yeni bir hücresel sinyal yolağının tanımlanması için katkı sağlayabileceği ön görülmektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, the binding affinities of drug precursor candidates identified by phage display to the Kras wild type and G12D mutant protein were analyzed using the surface plasmon resonance method. The possible inhibitory effects of peptide structures shown to bind to Kras with high affinity on the functional activities of oncogenic Ras were examined. BxPC-3 and AsPC1 pancreatic cancer cell lines were used in studies at this stage. Cell proliferation-cytotoxicity and motility analysis of the identified peptides within the scope of cellular studies was performed. Within the scope of this study, 7 peptide sequences with a length of 12 amino acids that were found to bind to wild type and mutant KrasG12D mutant by phage display. And 3 of these structures were determined to bind to their respective target proteins with high affinity by surface plasmon resonance analysis. In the wound healing experiment performed on pancreatic cancer cell lines, it was observed that peptide 3 significantly inhibited wound healing. It is anticipated that the data obtained may contribute to the development of new drug precursors that may be effective in the treatment of cancer types with KrasG12D mutation, especially pancreatic cancer, to contribute to the possibility of personalized treatment, and to the identification of a new related cellular signaling pathway.
Benzer Tezler
- Targeting bag-1S/C-raf interaction for therapeutic intervention in cancer
Bag-1S/C-raf etkileşiminin kanserde terapötik bir yaklaşım olarak kullanılmak üzere hedeflenmesi
ÖZGE TATLI
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Pankreas epitel hücrelerinin onkojenik transformasyonunda PFKFB2'nin rolü
Role of PFKFB2 in the oncogenic transformation of pancreatic epithelial cells
SELAHATTİN CAN ÖZCAN
Doktora
Türkçe
2018
BiyoteknolojiBursa Uludağ ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDULLAH YALÇIN
- Kras mutant larinks kanseri hücrelerinde timokinonun etki mekanizmasının incelenmesi
Investigation of thymoquinone effect on laryngeal cancer cells with kras mutant
VİLDAN BETÜL YENİGÜN
- Sporadik kolorektal kanser ve prekürsör lezyonlarda RAS arayolunun değerlendirilmesi
The significance of RAS dependent pathways in colorectal carcinoma and its precursors
ELÇİN KADAN
- Küçük hücreli dışı akciğer kanseri tanılı hastalara ait parafin blok kesitlerinde EGFR, KRAS, BRAF, PIK3ca, her2 ve NRAS gen mutasyonlarının araştırılması
Determination of EGFR, KRAS, BRAF, PIK3CA, HER2 and NRAS gene mutations in parafin block sections from patients diagnosed with non-small cell lung cancer
METİN ÇALIŞKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NUR SELVİ
PROF. DR. GÖKAY BOZKURT