Geri Dön

Kanatlı eti ve dışkılarından termofilik campylobacter türlerinin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

İsolation and molecular chatacterization of thermophilic campylobacter species from poultry meat and feces

PDF İndir

  1. Tez No: 852285
  2. Yazar: ONUR TAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ARZU FINDIK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 83

Özet

Bu çalışmada broyler karkas ve dışkılarından termofilik kampilobakterlerin izolasyonu, elde edilen izolatların antimikrobiyal dirençlilik genlerinin ve virülens genlerinin ortaya konulması amaçlandı. Termofilik kampilobakterlerin izolasyonu amacıyla Samsun ilinde bulunan 8 farklı kümesteki 40 günlük broylerlerden 200 adet kloakal svap örneği ve 2 farklı tavuk eti satış mağazasından 60 adet karkas ve et numunesi alındı. 200 adet kloakal svap örneğinin 32 adedinde (%16) termofilik kampilobakter suşu tespit edildi. 60 adet et ve karkas numunesinin 26 tanesinde (%43,33) termofilik kampilobakter tespit edildi.. Tür identifikasyonundan sonra, izolatlarda dnaJ, racR, ciaB, pldA, cadF, virB11 gibi virulens genleri ve blaOXA-61, cmeB, tet(O), aphA-3-1 gibi antibiyotik dirençlilik genlerinin varlığı PCR ile araştırıldı. PCR sonucunda kloakal izolatlarda dnaJ, racR, ciaB, pldA, cadF ve virB11 genlerinin bulunma yüzdeleri sırasıyla; %82,22, %20, %13,33, %17,77, %20 ve %0 olarak tespit edildi. Aynı genlerin tavuk etlerinden elde edilen izolatlarda bulunma yüzdeleri aynı sırayla; %62.07, %34.48, %27.59, %27.59, %17.24 ve %0 olarak tespit edildi. Kloakal izolatlarda tet(O), blaOXA-61, aphA-3-1 ve cmeB genlerinin bulunma yüzdeleri sırasıyla; %22,22, %0, %17,78 ve %37,78 olarak tespit edilirken aynı genlerin tavuk etlerinden elde edilen izolatlarda bulunma yüzdeleri sırasıyla; %10.35, %0, %3.45, %34.48 olarak tespit edildi. Ayrıca izolatların genotiplendirilmesi amacıyla RAPD-PCR kullanıldı. RAPD-PCR analizi sonucunda %70 benzerlik oranı baz alındığında tavuk eti ve karkas izolatlarında 8 adet benzersiz tip ve CAB, CAJ olmak üzere 2 adet küme, kloakal izolatlarda ise 1 adet benzersiz tip CLC ve CLA, CLB, CLD, CLE olmak üzere 4 adet küme tespit edildi. Sonuç olarak bu çalışmada kloakal örneklerde termofilik kampilobakter varlığı çok yüksek düzeyde saptanamazken, et örneklerinde daha yüksek seviyede saptanmıştır. Bunun sebebi, bağırsak içeriğinin ete temas ettirilmesi ve çapraz kontaminasyon gibi kesim sırasında ve sonrasında yapılan hatalardan kaynaklanıyor olabilir. Ayrıca çoklu antibiyotik direnç geninin suşlar arasında nispeten yüksek oranda bulunması, dünya çapında önemli sağlık problemlerinden olan antimikrobiyal direnç sorununa işaret ediyor olabilir.

Özet (Çeviri)

This study aimed to isolate thermophilic campylobacter from broiler carcasses and feces and to reveal the antimicrobial resistance genes and virulence genes of the isolates obtained. For the isolation of thermophilic campylobacters, 200 cloacal swab samples were taken from 40-day-old broilers in 8 different chicken coops in Samsun province and 60 carcass and meat samples were taken from 2 different chicken meat sales stores. Thermophilic campylobacter strain was detected in 32 of 200 cloacal swab samples (16%). Thermophilic campylobacter was detected in 26 of 60 meat and carcass samples (43.33%). After species identification, virulence genes such as dnaJ, racR, ciaB, pldA, cadF, virB11 and blaOXA-61, cmeB, tet(O) were detected in the isolates. The presence of antibiotic resistance genes such as , aphA-3-1 was investigated by PCR. As a result of PCR, the percentages of dnaJ, racR, ciaB, pldA, cadF and virB11 genes in cloacal isolates are respectively; It was determined as 82.22%, 20%, 13.33%, 17.77%, 20% and 0%. The percentages of the same genes in isolates obtained from chicken meat are in the same order; It was determined as 62.07%, 34.48%, 27.59%, 27.59%, 17.24% and 0%. The percentages of presence of tet(O), blaOXA-61, aphA-3-1 and cmeB genes in cloacal isolates are respectively; While they were detected as 22.22%, 0%, 17.78% and 37.78%, the percentages of the same genes in isolates obtained from chicken meat were respectively; It was determined as 10.35%, 0%, 3.45%, 34.48%. Additionally, RAPD-PCR was used to genotype the isolates. Based on the 70% similarity rate as a result of RAPD-PCR analysis, there are 8 unique types and 2 clusters including CAB, CAJ in chicken meat and carcass isolates, and 1 unique type CLC and 4 clusters including CLA, CLB, CLD, CLE in cloacal isolates. cluster detected. As a result, in this study, while the presence of thermophilic campylobacter was not detected at a very high level in cloacal samples, it was detected at a higher level in meat samples. This may be due to errors made during and after slaughter, such as contact of intestinal contents with meat and cross-contamination. In addition, the relatively high prevalence of multiple antibiotic resistance genes among strains may indicate the problem of antimicrobial resistance, which is one of the important health problems worldwide.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    650558

    Türkiye piliç eti ve ürünleri dış ticareti ve pazarlama yapısının ekonomik analizi

    An economic analysis of broiler meat and products marketing structure and foreign trade of Turkey

    SEYİT CAN GÜLOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    EkonomiAnkara Üniversitesi

    Hayvan Sağlığı Ekonomisi ve İşletmeciliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ENGİN SAKARYA

  2. Tez No

    318036

    Kanatlı eti (hindi eti ve tavuk eti) ve kırmızı et karışımı ile elde edilen köftelerin kalite özelliklerinin belirlenmesi

    Determined the quality specifications of meatballs obtained from poultry meat and red meat mixture

    PINAR ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Gıda MühendisliğiNamık Kemal Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL YILMAZ

  3. Tez No

    195328

    İleri işlem görmüş kanatlı eti ürünlerinden nugget üretim hattındaki mikrobiyal kontaminasyon kaynaklarının belirlenmesi

    Determination of microbiological contamination sources during further processed poultry product nugget production

    PELİN FATMA AKYUVA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiUludağ Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ŞAHSENE ANAR

  4. Tez No

    849841

    Kanatlı etlerinde salmonella typhimurium ve salmonella enteriditis varlığı ve antibiyotik dirençliliğinin araştırılması

    Investigation of presence and antibiotic resistance of salmonella typhimurium and salmonella enteriditis in poultry meat

    BUKET ALTIN GASER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERGÜN ÖMER GÖKSOY

  5. Tez No

    48707

    İstanbul piyasasında satışa sunulan çeşitli kanatlı eti ve ürünlerinde Camylobacter Jejuni'nin varlığı üzerine araştırmalar

    Investing on the presence of Campylobacter Jejuni in the various poultry meat and products marketing in Istanbul

    DAVOD GHALEHKEFA DİZGAH

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    PROF.DR. ÖZER ERGÜN

Geri Dön