Geri Dön

Tavuk kolerası kökenli Pasteurella multocida izolatlarının fenotipik ve genotipik karakterizasyonu

Phenotypical and genotypical characterization of Pasteurella multocida isolates from fowl cholera

  1. Tez No: 853396
  2. Yazar: SİNAN PİR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ALPER ÇİFTCİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Tavuk kolerası evcil ve/veya yabani kanatlı hayvanları etkileyen, yüksek morbidite ve mortalite ile seyreden septisemik bir hastalık olarak tanımlanmaktadır. Tez çalışmasında Tavuk Kolerası şüphesiyle Samsun Veteriner Kontrol Enstitüsü Müdürlüğü'ne gönderilmiş olan tavuklara ait akciğerlerden izole edilen Pasteurella multocida suşlarının fenotipik ve genotipik karakterizasyonu amaçlandı. Bu kapsamda ilgili bölgelerden gönderilen tavuklardan izole edilmiş olan P. multocida şüpheli 50 adet bakteri identifikasyon ve karakterizasyon için kullanıldı. Bakteriler ticari olarak temin edilen Pasteurella Selektif Agar'a inokulasyon ile canlandırıldı ve 24 adet bakteri Pasteurella selektif besi yerinde leylak renkli koloni oluşturdu. İzolatların genotipik identifikasyonları PCR ile gerçekleştirildi. PCR sonucunda 50 adet izolatın 24'ü P. multocida olarak identifiye edildi. 17 izolat PCR ile serogrup A olarak tanımlanırken, 7 izolat serogruplandırılamadı. P. multocida izolatlarının biyofilm oluşturma durumları in vitro olarak CRA yöntemi ile araştırıldı. İncelenen 24 adet izolatın 14 (% 58,33)'ü CRA'da siyah koloni oluşturdu ve biyofilm oluşturma özelliği yönünden pozitif olarak değerlendirildi. Antibiyotik duyarlılıkları ve çoklu antibiyotik direnci Kirby Bauer Disk Difüzyon Yöntemi ile 9 antibiyotik sınıfından toplam 14 antibiyotik için belirlendi. İncelenen 24 adet izolatın 16 (%66,7), 24 (%100), 8 (%33,3), 18 (%75,0), 9 (%37,5), 22 (%91,7), 19 (%79,1), 11 (%45,8), 9 (%37,5), 16 (%66,7), 3 (%12,5), 9 (%37,5), 19 (%79,2) ve 12 (%50,0)'si sırasıyla ampisilin, penisilin G, enrofloksasin, eritromisin, florfenikol, linkomisin, oksitetrasiklin, tetrasiklin, neomisin, spektinomisin, sulfametoksazol/trimetoprim, sefoperazon, sefotaksim ve seftiofura dirençli bulundu. P. multocida izolatlarının bazı virülens genleri multipleks PCR ile belirlendi. İncelenen 24 adet izolatın 10 (% 41,67), 15 (% 62,5), 12 (% 50,0), 10 (% 41,67) ve 11 (% 45,83)'ü sırasıyla fimA, fur, plpB, pmHAS ve sodA yönünden pozitif bulundu. P. multocida izolatlarının antibiyotik direncinde rol oynayan bazı genler PCR ile araştırıldı. İncelenen 24 adet izolatın 17 (% 70,83), 13 (% 54,17), 12 (% 50,00), 16 (% 66,67) ve 10'u (% 41,67) sırasıyla tetH, bla, aphA1, sul1 ve dfrA için pozitif sonuç verdi. P. multocida izolatlarının filogenetik yakınlıklarının belirlenmesi amacıyla yapılan RAPD-PCR ile genotiplendirme sonucunda izolatların % 22-89 oranında benzerlik gösterdikleri saptandı. Sonuç olarak; biyofilm üreten, antibiyotik dirençli ve en fazla virülens genini içeren suşlar kullanılarak aşı geliştirme çalışmaları yapılabileceği kanaatine varıldı.

Özet (Çeviri)

Fowl cholera is defined as a septicemic disease affecting domestic and/or wild poultry with high morbidity and mortality. The aim of the thesis study was the phenotypic and genotypic characterization of Pasteurella multocida isolates isolated from the lungs of chickens sent to the Samsun Veterinary Control Institute for the diagnosis of Fowl cholera. In this context, 50 suspucious P. multocida bacteria isolated from chickens sent from the relevant regions were used for identification and characterization. Bacteria were inoculated on commercially available Pasteurella Selective Agar, and 24 bacteria formed a mauve-coloured bacterial colony on the Pasteurella selective medium. Genotypic identification of the isolates was performed by PCR. As a result of PCR, 24 of 50 isolates were identified as P. multocida. While 17 isolates were identified as serogroup A by PCR, 7 isolates could not be serogrouped. Biofilm formation status of isolates was investigated in vitro by the CRA method. 14 (58.33%) of the 24 isolates examined formed black colonies in CRA and were evaluated as positive for biofilm formation. Antibiotic susceptibilities and multiple antibiotic resistances were determined for 14 antibiotics from 9 antibiotic classes by the Kirby Bauer Disk Diffusion Method. Of the 24 isolates examined, 16 (66.7%), 24 (100%), 8 (33.3%), 18 (75.0%), 9 (37.5%), 22 (91.7%), 19 (79.1%), 11 (45.8%), 9 (37.5%), 16 (66.7%), 3 (12.5%), 9 (37.5%), 19 (79.2%) and 12 (50.0%) were resistant to ampicillin, penicillin G, enrofloxacin, erythromycin, florfenicol, lincomycin, oxyteracycline, tetracycline, neomycin, spectinomycin, sulfamethoxazole/trimethoprim, cefoperazone, cefotaxime and ceftiofur, respectively. Some virulence genes of P. multocida isolates were determined by multiplex PCR. Of the 24 isolates examined, 10 (41.67%), 15 (62.5%), 12 (50.0%), 10 (41.67%) and 11 (45.83%) gave positive results for fimA, fur, plpB, pmHAS and sodA, respectively. Some antibiotic resistance genes of P. multocida isolates were investigated by PCR. Of the 24 isolates examined, 17 (70.83%), 13 (54.17%), 12 (50.00%), 16 (66.67%) and 10 (41.67%) gave positive results for tetH, bla, aphA1, sul1 and dfrA, respectively. As a result of genotyping with RAPD-PCR to determine the phylogenetic relatedness of P. multocida isolates, it was determined that the isolates showed 22-89% similarity. In conclusion; it was concluded that vaccine development studies could be carried out for the strains with biofilm-producer, antibiotic resistant and contain the most virulence genes.

Benzer Tezler

  1. Yumurtacı tavuklarda solunum sistemi lezyonları üzerine patolojik ve mikrobiyolojik incelemeler

    Pathologic and microbiologic investigations on respiratory system lesions of laying hens

    ÖZGÜR ÖZDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Patoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HÜDAVERDİ ERER

  2. Tavuk etlerinde genişlemiş spektrumlu beta-laktam antibiyotiklere dirençli enterik bakterilerin identifikasyonu ve direnç profillerinin tespiti

    Identification of chicken-related enterobacteriaceae resistant to extended spectrum beta-lactam antibiotics and determination of resistance profiles

    BİRSEN SARICI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Aydın Üniversitesi

    Gıda Güvenliği ve Beslenme Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYDAR ÖZPINAR

  3. Tavuk etlerinden gram pozitif kokların izolasyonu ve antibiyotiklere karşı dirençlilikleri'nin belirlenmesi

    The determination of antibiotic resistance of gram positive coccoid's and isolated from chicken meat

    NACİ ERHAN YURDAKUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Gıda MühendisliğiÇukurova Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZERRİN ERGİNKAYA

  4. Broyler damızlık ve ticari broyler sürülerinde tavuk anemi virüsünün ve antikor varlığının araştırılması

    The investigation of chicken anemia virus and its antibody existence in commercial broiler and broiler breeeder flocks

    ŞİNASİ AŞKAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiKırıkkale Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT YILDIRIM

  5. Tavuk eti kaynaklı salmonella ınfantis izolatlarında antibiyotik direncin belirlenmesi

    Determination of antibiotic resistance in salmonella infantis isolates originating from chicken meat

    DENİZ ESAT MARTI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiSelçuk Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. ARİFE EZGİ TELLİ