Geri Dön

Mirna expression profiles in cockayne syndrome B-deficient fibroblasts in response to oxidative stress

Oksidatif strese yanıt olarak Cockayne Sendromu B eksikliği olan fibroblastlarda miRNA ekspresyon profilleri

  1. Tez No: 854212
  2. Yazar: İLAYDA DARILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MELTEM MÜFTÜOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 69

Özet

Cockayne sendromu (CS) nadir görülen otozomal resesif bir hastalıktır. CS, kaşektik cücelik, erken yaşlanma, ışığa duyarlılık, işitme kaybı ve nörolojik fonksiyon bozukluğu ile karakterize bir hastalıktır. CS vakalarının %80'ine CSB genindeki mutasyonlar neden olur. CSB, transkripsiyona kenetlenmiş nükleotid eksizyon onarımı, baz eksizyon onarımı, kromatinin tekrar modellenmesinde ve transkripsiyonda görev alır. MiRNA'lar, genleri transkripsiyon sonrası düzenleyen küçük, kodlamayan RNA'lardır. Bu yüksek lisans tez çalışmasında, menadion kaynaklı oksidatif stres öncesi ve sonrasında CSB eksikliği olan primer fibroblastlarda miRNA'ların normal primer fibroblastlara kıyasla diferansiyel ekspresyonu belirlendi. MiR-379-5p'nin, CSB yeterliliği olan kontrol fibroblast hücrelerine kıyasla menadion tedavisi olan ve olmayan CSB eksikliği olan fibroblast hücrelerinde farklı şekilde eksprese edildiğini gösterdik. MiR-379-5p'nin miR-379-5p mimik transfeksiyonu yoluyla HeLa hücrelerine aşırı ekspresyonu, CSB ekspresyon seviyelerini 2.05 kat azalttı. Hesaplamalı analiz, miR-379-5p'nin CSB'nin 3UTR'sinde iki varsayılan bölgeyi hedeflediğini ve bu bağlanma bölgelerinin yüksek oranda korunmuş olarak bulunduğunu göstermektedir. Ancak ikili lusiferaz raportör tahlili, miR-379-5p'nin bu bölgelere bağlanmasının HeLa hücrelerindeki lusiferaz aktivitelerini baskılamadığını dolayısıyla CSB ekspresyonunu etkilemediğini gösterdi. Sonuç olarak, bu çalışma, miR-379-5p'nin CSB'nin doğrudan negatif düzenleyicisi olmayabileceğini öne sürüyor.

Özet (Çeviri)

Cockayne syndrome (CS) is a rare autosomal recessive disorder characterized by cachectic dwarfism, premature aging, photosensitivity, hearing loss, and neurological dysfunction. Eighty percent of CS cases are caused by mutations in the CSB gene. CSB participates in transcription-coupled nucleotide excision repair, base excision repair, chromatin remodeling, and transcription. MiRNAs are small non-coding RNAs that regulate the genes post-transcriptionally. In this MSc thesis study, we identified the differential expression of miRNAs in CSB-deficient primary fibroblasts compared to normal primary fibroblasts before and after menadione-induced oxidative stress. We showed that miR-379-5p was differentially expressed in the CSB-deficient fibroblast cells with and without menadione treatment compared to CSB-proficient control fibroblast cells. Overexpression of miR-379-5p into HeLa cells via miR-379-5p mimic transfection, reduced the CSB expression levels by 2.05-fold. Computational analysis suggests that miR-379-5p targets two putative sites on the 3UTR of CSB, and these binding sites were found as highly conserved. However, the dual luciferase reporter assay showed that binding of miR-379-5p to these sites did not suppress the luciferase activities in HeLa cells, thus not affecting the CSB expression. In conclusion, this study suggests that miR-379-5p may not be a direct negative regulator of CSB.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    411910

    Beyin antioksidan enzimlerinin tip1 diyabet ile değişimi: resveratrol'ün etkileri

    Changes in brain antioxidant enzymes with type 1 diabetes: effects of resveratrol

    DİLAN KONAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyolojiKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÖKHAN SADİ

  2. Tez No

    412486

    Anakardik asidin TNF-α ile indüklenmiş insan safen ven greft endotel kültüründe ICAM-1, vcam-1 ve NF-KB üzerine etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effect of anacardic acid on icam-1, vcam-1 and NF-KB in human saphenous vein graft endothelial culture induced with TNF-α

    BURAK ÖNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİBEL ÖZYAZGAN

  3. Tez No

    412708

    Beslenmenin hipotalamik kontrolünde irisin hormonunun etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of irisin hormone on the hypothalamic control of feeding

    SUAT TEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Fizyolojiİnönü Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SÜLEYMAN SANDAL

  4. Tez No

    412722

    Lokal ileri ve metastatik küçük hücreli dışı akciğer karsinomlu hastalarda tedavi öncesi ve sonrası serum mirna ekspresyon düzeylerinin tedavi yanıtı ve sağkalım üzerine olan etkisinin araşırılması

    Investigation of pretreatment and posttreatment serum micro-RNA expression levels 's effect on response of therapy and survival in patients with locally advanced and metastatic non-small cell lung cancer

    NAİL ÖZHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    OnkolojiPamukkale Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. GAMZE GÖKÖZ DOĞU

  5. Tez No

    412725

    Çocukluk çağı hematolojik malignitelerinde mikrorna'ların prognostik etkisi

    Prognostic effect of micrornas in hematological malignancies of childhood

    FUNDA AKPINAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıPamukkale Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AZİZ POLAT

Geri Dön