Geri Dön

Sequencing and analysis of axial regulator Yabby-5 like gene on asparagus (Asparagus officinalis)

Kuşkonmaz (Asparagus officinalis) bitkisinde axial regulator Yabby-5 like geninin sekanslanması ve analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 855640
  2. Yazar: SENA NUR ALTUNER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CEMAL ÜN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Bitki Islahı Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 68

Özet

Kuşkonmaz (Asparagus officinalis L.), farklı biyoaktivitelere sahip çok yıllık bir bitkidir ve eski çağlardan beri yaygın olarak ilaç ve gıda olarak kullanılmaktadır. Buna göre, yabani ve kültüre alınmış kuşkonmaz genotiplerindeki değişimlerin bilinmesi hem kültüre alınmış hem de yabani çeşitlerde YABBY5-LIKE geninin ekspresyon düzeyinin belirlenmesine ve karşılaştırmalı bir analizin yapılmasına olanak sağlamaktadır. Bitki transkripsiyon faktörleri, çeşitli abiyotik streslere yanıt olarak gen ekspresyonunu düzenler. Bu çalışmada, İzmir Ödemiş Büyük Menderes Havzasından toplanan 7 kuşkonmaz çeşidi ve 3 yabani A. officinalis L. türünün YABBY-5-like geninin ekspresyon açısından incelenmesi amaçlanmıştır. Bu sebeple yabani ve kültüre alınan çeşitlerde büyüme geninin tespiti ve karşılaştırmalı analizinin yapılması, büyüme ve kalite sağlayan kuşkonmaz genotiplerinin belirlenmesi ve yapılacak çalışmalara bir ilk olarak katkı sağlanması amaçlanmaktadır. Daha önce literatürde hem yabani hem de kültür kuşkonmaz çeşitleri arasında YABBY-5-like gen açısından genetik benzerlik ve mesafeyi değerlendiren bir çalışma olmadığı için bu alanda öncü olacaktır. Tez çalışması sonucunda gelecekte A. officinalis ıslah çalışmalarında temel olarak kullanılabilecek aday SNP'ler, genetik benzerlikler ve uzaklıklar belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Asparagus (Asparagus officinalis L.) is a perennial herb with different bioactivities and has been widely used as medicine and food since ancient times. Accordingly, knowing the changes in wild and cultivated asparagus genotypes makes it possible to determine the expression level of the YABBY5-LIKE gene in both cultured and wild varieties and make a comparative analysis. Plant transcription factors regulate gene expression in response to various abiotic stresses. In this study, it was aimed to examine 7 asparagus cultivars and 3 wild species of Asparagus officinalis L. collected from İzmir Ödemiş Büyük Menderes Basin in terms of YABBY-5-like expression. In this way, it is aimed to determine and make a comparative analysis of the growth gene in wild and cultivated varieties, to determine the asparagus genotypes that provide growth and quality, and to contribute to the studies to be done as a first. Since there is no previous study in the literature evaluating genetic similarity and distance in terms of YABBY-5-like gene between both wild and cultivated varieties of asparagus, it will be a pioneer in this field. As a result of the thesis study, candidates SNPs, genetic similarities and distances that can be used as a basis in future A. officinalis breeding studies were determined.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    414082

    Otozomal resesif geçiş gösteren mikroftalmili bir ailede mikrodizin ve ekzom sekanslama yöntemi ile yeni genlerin araştırılması

    Investigation of new genes in a family with microphthalmia by microarray and exome sequencing methods

    SEZEN GÜNTEKİN ERGÜN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜVEM GÜMÜŞ AKAY

    PROF. DR. FERDA EMRİYE PERÇİN

  2. Tez No

    176779

    Similarity search and analysis of protein sequences and structures: A residue contacts based approach

    Protein dizilerinin ve yapılarının benzerlik araması ve analizi: Amino asit temaslarına dayalı bir yaklaşım

    AHMET SAÇAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAKAN FERHATOSMANOĞLU

    PROF. DR. İ. HAKKI TOROSLU

  3. Tez No

    753284

    Türk buğday çeşitlerinde kuraklık stresi altında mikrorna'ların yeni nesil dizileme teknolojileri ile dizilenmesi ve ifade analizlerinin belirlenmesi

    Sequencing of microrna via next generation sequencing technology in Turkish wheat cultivars under drought stress and determination of their expression analysis

    FERHAT ULU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CENGİZ BALOĞLU

  4. Tez No

    237288

    Türkiye turunçgil alanlarındaki tristeza virüs izolatlarının kılıf protein genlerinin klonlaması, dna diziliminin belirlenmesi ve analizi

    Molecular cloning, sequencing and analysis of the coat protein genes of citrus tristeza virus isolates from different citrus growing regions of Turkey

    GÖZDE ERKIŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    ZiraatSüleyman Demirel Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK

  5. Tez No

    574562

    HCV genotipinin belirlenmesinde 5'ncr Ve Ns5b bölgelerinin yeni Nesil Dizileme (YND-NGS) İle Araştırılması

    HCV Genotyping with 5'NCR and NS5B regions with next generation sequencing (YND-NGS)

    SENİHA AKTAKKA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEMNUNE SELDA ERENSOY

Geri Dön