Pankreas kanser hücre hattında pankreas duktal adenokarsinomda erken teşhis ve tedaviye yönelik prospektif biyobelirteç saptanmas
Prospective biomarker detection for early diagnosis and treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma in pancreatic cancer cell line
- Tez No: 862856
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHVEŞ PODA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Pankreas adenokarsinomu, kansere bağlı ölümlerin önde gelen nedenlerinden biri olup, spesifik prognostik ve tedavi öngördürücü biyobelirteçlere acilen ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışma kapsamında, TNC, COL18A1 ve ULBP1 gelecek vaat eden biyo-belirteçler olarak seçilmiştir. Bu moleküler hedeflerle ilgili çalışmalar, farklı gemcitabine dozlarına (2,5, 5, 15 μM) farklı inkübasyon sürelerine (48,72,96 saat) maruz bırakılan PANC1 hücreleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Hedef gen ifadeleri, qRT-PCR (TNC, ULBP1, COL18A1, ZEB1) ile analiz edilmiştir. Hücre lizatları ve hücre dışı medyumdan alınan örnekler, LUMINEX (TNC, ULBP1, COL18A1) ve ELISA (CA19-9 ve ZEB1) aracılığıyla incelenmiştir. Ayrıca, ULBP1 proteininin, PANC1 hücrelerindeki yerleşimi konfokal mikroskopi ile gösterilmiştir. 72 saatlik inkübasyon için IC50 değeri 5 μM olarak belirlenmiştir. Hücre lizat örneklerinde TNC proteini sadece kontrol grubunda pozitif olarak tespit edilmiştir. Hücre dışı medyumdan elde edilen örnekler, tüm şartlarda (saat: 48, 72, 96 ve doz: 2,5, 5, 15 μM) analiz edilmiş ve kontrol grubu ile karşılaştırılmıştır. ZEB1 ve ULBP1 protein konsantrasyonları kontrol grubuna göre tüm deney koşullarında anlamlı olarak artmıştır (p
Özet (Çeviri)
Pancreatic adenocarcinoma is one of the leading causes of cancer-related deaths and specific prognostic and treatment-predictive biomarkers are urgently needed for decision-making. We selected TNC, COL18A1, and ULBP1 as promising prospective bio-markers. Concerning these targets, PANC1 cells under basal conditions were compared to different gemcitabine exposure conditions (duration: 48,72,96 hours and doses: 2,5, 5, 15 μM). Target gene expressions were analyzed using qRT-PCR (TNC, ULBP1, COL18A1, ZEB1). Cell lysates and cell-free medium samples were compared via LUMINEX (TNC, ULBP1, COL18A1) and ELISA (CA19-9 and ZEB1). ULBP1 protein was demonstrated through confocal microscopy in cultured cells. IC50 value was determined as 5 μM for 72-hour incubation. In the cell lysate samples, TNC protein was detected only at basal conditions. After administration of gemcitabine, cell-free medium samples were also analyzed and compared to basal conditions as controls. As for ZEB1 and ULBP1 the protein concentrations in the cell-free medium were increased under all of the experimental conditions when compared to controls (p
Benzer Tezler
- Pan-aurora kinaz inhibitörü danusertib'in pankreatik karsinoma hücrelerinde kromozomal geçiş kompleks genlerinin mrna ifade düzeylerine etkilerinin araştırılması
The investigation of the effects of pan-aurora kinase inhibitor danuserti̇b on the mrna expression levels of chromosomatransition complex genes in pancreatic carcinoma cells
CENGİZ ÇOLAK
- PANC-1 insan pankreas kanseri hücre hattında biyolojik ve kimyasal olarak sentezlenen gümüş nanopartiküllerin HIF-1 sinyal yolağı üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of effects of silver nanoparticles synthesized biologically and chemically on HIF-1 signal pathway in PANC-1 human pancreatic cancer cell line
ŞEVVAL ÖZKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU
- PANC-1 hücre hattında resveratrol'ün NF-KB ve HTERT ekspresyonuna bağlı telomeraz aktivitesine etkisi
Effect of resveratrol on telomerase activity due to NF-KB and htert expression in PANC-1 cell line
BUŞRA BARA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
OnkolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA ZUHAL EROĞLU
- Pankreas kanserinde Toll-like reseptör 4 (TLR4) yolağının immün check-point VISTA üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of Toll-like receptor 4 (TLR4) pathway on immune check-point VISTA in pancreatic cancer
KÜBRA SENA BAŞ TOPCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
OnkolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU
- Pankreas kanseri hücre hattında otofaji ilişkili VPS34 inhibitörünün Wnt/β-katenin sinyal yolağı üzerinden incelenmesi
Investigation of autophagy-associated VPS34 inhibitor via Wnt/β-catenin signaling pathway in pancreatic cancer cell line
VERA AVCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASİBE VURAL