ÇOMU-ZLAR koleksiyonundaki yarı sucul-sucul amfibi ve sürüngen örneklerinin DNA barkod veri tabanının oluşturulması
Creating a DNA barcode database of semi aquatic-aquatic amphibian and reptile specimens in the ÇOMU-ZLAR collection
- Tez No: 865179
- Danışmanlar: PROF. DR. CEMAL VAROL TOK, PROF. DR. EMRE KESKİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Zooloji, Biyoloji, Zoology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Amfibiler, DNA barkodlama, Sürüngenler, Amphibians, DNA barcoding, Reptiles
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu araştırmada, ÇOMU-ZLAR koleksiyonunda %70 etanol ve %4'lük formalin solüsyonunda muhafaza edilen sucul ve yarı sucul 17 amfibi ve 5 sürüngen türüne ait toplam 251 örneğin DNA barkodlama çalışması yapılmıştır. Mitokondriyal DNA'da bulunan sitokrom oksidaz alt ünite I (COI) bölgeleri, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniği kullanılarak amplifiye edilmiş ve Sanger dizi analizleri gerçekleştirilmiştir. Dizi analizi sonuçları, uluslararası veri bankaları ile karşılaştırılarak bazı türler için Türkiye'den ilk kez elde edilmiş veriler bu veri tabanlarına işlenmiştir. Çalışmada kullanılan örneklerin dokularının bu solüsyonlar içerisinde saklanması sırasında meydana gelen değişimlerin DNA izolasyonu ve dizileme çalışmalarına olan etkileri üzerine değerlendirmeler yapılmıştır. Çalışma sonucunda tamamı Türkiye'deki çeşitli projeler kapsamında 2003-2021 yılları arasında toplanmış ve %70 etanol ve %4 formalin solüsyonu içerisinde saklanmakta olan 2 sınıf (classis), 4 takım (ordo), 9 aileden (familia) toplam 22 türe ait 251 örnekten saklama koşullarından en az etkilenmiş olan 84 örneğe ait DNA barkodları oluşturularak uluslararası veri tabanlarına girişleri yapılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, DNA barcoding of a total of 251 specimens of 17 aquatic and semi-aquatic amphibian and 5 reptile species preserved in 70% ethanol and 4% formalin solution in the ÇOMU-ZLAR collection was performed. Cytochrome oxidase subunit I (COI) regions in mitochondrial DNA were amplified using polymerase chain reaction (PCR) technique and Sanger sequence analysis was performed. Sequence analysis results were compared with international databases and for some species, the data obtained for the first time from Turkey were entered into these databases. Evaluations were made on the effects of the changes that occurred during the storage of the tissues of the samples used in the study in these solutions on DNA isolation and sequencing studies. As a result of the study, DNA barcodes of 84 of the 251 samples belonging to a total of 22 species from 2 classes (classis), 4 orders (ordo), 9 families (familia), all of which were collected between 2003 and 2021 within the scope of various projects in Turkey and stored in 70% ethanol and 4% formalin solution, which were least affected by storage conditions, were created and entered into international databases.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki bazı hemidactylus turcicus (linnaeus, 1758) (squamata: gekkonidae) popülasyonlarının geometrik morfometri analizi
Geometric morphometric analysis of some hemidactylus turcicus (linnaeus, 1758) (squamata: Gekkonidae) populations in Türkiye
CAHİT YILDIZ
Doktora
Türkçe
2026
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEMAL VAROL TOK
- Türkiye'deki oryantiring sporcularının karşılaştığı temel sorunlar üzerine bir araştırma
A research on the basic problems that the orienteers face in Turkey
ADEM ATEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
SporGazi ÜniversitesiBeden Eğitimi ve Spor Öğretimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. METİN KAYA
- İstanbul Bizans mimarisinde kullanılan tuğlanın fiziksel ve mekanik özellikleri
Characteristics of brick used in Byzantine architecture in İstanbul
YEGAN KAHYA
- Hastanelerde ergonomik faktörlerin neden olduğu kas ve iskelet sistemi rahatsızlıklarının tükenmişlik etkileri ve hizmet/bakım kalitesine etkisinin incelenmesi
The research for the effects of musculoskeletal system disorders, caused by ergonomic factors, on burnout syndrome and service/care quality in hospitals
İBRAHİM EYİ
Doktora
Türkçe
2020
Halk Sağlığıİstanbul Aydın Üniversitesiİş Sağlığı ve Güvenliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANU YEŞİM BÜYÜKAKINCI
- Zein or gelatin nanofibers loaded with au nanospheres, SnO2 or black elderberry extract used as active and smart packaging layers for various fish fillets
Altın nanokürecikleri, SnO2 veya kara mürver ekstresi ile yüklenen zein ve jelatin nanoliflerinin farklı balık filetoları için aktif ve akıllı ambalaj katmanı olarak kullanılması
TURGAY ÇETİNKAYA
Doktora
İngilizce
2022
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ ALTAY
DOÇ. DR. ZAFER CEYLAN