Geri Dön

Klebsiella pneumoniae, pseudomonas aeruginosa,acinetobacter baumannii suşlarında kolistin sıvı disk elüsyon, kolistin agar test, sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması ve MCR-1 geninin araştırılması

Comparison of colistin broth disc elution, colistin agar test, broth microdilution methods and investigation of the MCR-1 gene in klebsiella pneumoniae, pseudomonas aeruginosa, acinetobacter baumannii strains

PDF İndir

  1. Tez No: 873357
  2. Yazar: BÜŞRA ACAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN, DOÇ. DR. ÜNSAL SAVCI
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 94

Özet

ÖZET Kolistin duyarlılığı tayini için referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon (SMD) yöntemine alternatif olarak kolistin sıvı disk elüsyon (KSDE) ve kolistin agar test (KAT) yöntemleri geliştirilmiştir. Bu çalışmadaki amacımız, Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), ve Acinetobacter baumannii (A. baumannii), suşlarında kolistin duyarlılığını belirlemek için SMD, KSDE ve KAT yöntemlerini karşılaştırmak; kolistin dirençli izolatlarda mcr-1 (mobil kolistin direnci) direnç geninin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile araştırılmasıdır. Çalışmaya 62 K. pneumoniae, 52 P. aeruginosa ve 62 A. baumannii olmak üzere toplam 176 izolat dahil edilmiştir. Kolistin duyarlılığı tespitinde SMD, KSDE ve KAT yöntemleri kullanılmış ve herhangi birinde kolistin dirençli bulunan izolatlardan genetik materyal izolasyonu yapılıp PCR uygulanmıştır. Veriler değerlendirildiğinde K. pneumoniae'da; KSDE yöntemi için kategorik uyum (KU), temel uyum (TU), büyük hata (BH) ve çok büyük hata (ÇBH) oranları sırasıyla %93.5, %91.9, %13.3 ve %0 bulunurken KAT yöntemi için KU ve TU oranları %96, ÇBH %6.2 saptanmış olup BH gözlenmemiştir. Referans yönteme göre P. aeruginosa'da iki yöntemde de KU, TU, BH ve ÇBH oranları kabul edilebilir sınırlarda bulunmuştur. Son olarak A. baumannii'de; KSDE yöntemi için KU %83.8, TU %80.6, BH %11.7 ve ÇBH %36.3 bulunurken KAT yöntemi için KU ve TU %88, BH %2 ve ÇBH %54 bulunmuştur. Herhangi bir yöntemle kolistin dirençli bulunan 58 izolatta mcr-1 geni saptanmamıştır. Kolistin duyarlılık tespiti için KSDE ve KAT yöntemlerinin K. pneumoniae'da ve P. aeruginosa'da SMD yöntemine alternatif olarak kullanılabileceği düşünülürken A. baumannii için bu yöntemlerin kullanılmasının hatalı sonuçlara neden olacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT COMPARISON OF COLISTIN BROTH DISC ELUTION, COLISTIN AGAR TEST, BROTH MICRODILUTION METHODS AND INVESTIGATION OF THE MCR-1 GENE IN KLEBSIELLA PNEUMONIAE, PSEUDOMONAS AERUGINOSA, ACINETOBACTER BAUMANNII STRAINS As an alternative to the broth microdilution (BMD) method, which is the reference method for colistin sensitivity determination, colistin broth disk elution (CBDE) and colistin agar test (CAT) methods have been developed. Our aim in this study is to compare BMD, CBDE and CAT methods to determine colistin sensitivity in Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), and Acinetobacter baumannii (A. baumannii) strains; To investigate the the mcr-1 (mobile colistin resistance) resistance gene in colistin resistant isolates by polymerase chain reaction (PCR) method. A total of 176 isolates, including 62 K. pneumoniae, 52 P. aeruginosa and 62 A. baumannii, were included in the study. BMD, CBDE and KAT methods were used to detect colistin sensitivity, and genetic material was isolated from any of the isolates found to be resistant to colistin and PCR was applied. When the data are evaluated, in K. pneumoniae; for the CBDE method, the categorical agreement (CA), essential agreement (EA), major error (ME) and very major error (VME) rates were 93.5%, 91.9%, 13.3% and 0%, respectively, while the CA and EA rates for the CAT method were 96%, VME was detected in 6.2% and ME was not observed. Compared to the reference method, the rates of CA, EA, ME and VME in P. aeruginosa were found to be within acceptable limits in both methods. Finally, in A. baumannii; for the CBDE method, CA 83.8%, EA 80.6%, ME 11.7% and VME 36.3% were found to be, while for the CAT method CA and EA were found to be 88%, ME 2% and VME 54%. The mcr-1 gene was not detected in 58 isolates found to be resistant to colistin by any method. While it is thought that CBDE and CAT methods can be used as an alternative to the BMD method for colistin sensitivity detection in K. pneumoniae and P. aeruginosa, it is thought that using these methods for A. baumannii will cause erroneous results.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    575551

    Yoğun bakımda yatan hastalarda üriner sistem enfeksiyonlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of urinary tract infections in intensive care patients

    UFUK ÖLKER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET RIZA ŞAHİN

  2. Tez No

    704662

    Çocuk hastalıkları servislerinde nozokomiyal enfeksiyon etkenleri ve direnç dağılımının belirlenmesi

    Determination of nosocomial infection agents and resistance distribution in inpati̇ent wards of the department of pediatrics

    İREM YILMAZ AKPINAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZDEN TÜREL

  3. Tez No

    369793

    Ventilatör ilişkili pnömoni hastalarından izole edilen mikroorganizmaların antimikrobiyal duyarlılıkları

    Antimicrobial susceptibility of microorganisms isolated from ventilator-associated pneumonia patients

    VEYSEL TOKSÖZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. MUSTAFA YILMAZ

  4. Tez No

    523881

    Escherichiae coli, klebsiella pneumoniae, pseudomonas aeruginosa, acinetobacter baumannii ve staphylococcus aureus suşlarında çeşitli aminoglikozidlerin duyarlılıkların araştırılması

    Investigation of various aminoglycosides sensitivites of escherichiae coli, klebsiella pneumoniae, pseudomonas aeruginosa, acinetobacter baumannii and staphylococcus aureus strains

    YASEMİN BİLGİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KADRİYE KART YAŞAR

  5. Tez No

    909153

    Antibiyotiklere dirençli bakteri suşlarında bakteriyofaj izolasyonu

    Bacteriophage isolation from antibiotic-resistant bacterial strains

    KHADIJA NARIMANOVA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL POLAT

Geri Dön