Karadeniz bölgesi'ndeki gökkuşağı alabalıklarında Aquareovirus Aenfeksiyonlarının varlığının araştırılması
Investigation of the presence of Aquareovirus A infections in rainbow trout in the black sea region
- Tez No: 878724
- Danışmanlar: DOÇ. DR. CÜNEYT TAMER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 48
Özet
Aquareovirus A (AqRV A) Spinareoviridae ailesinde yer alan 11 segmentli çift iplikçikli RNA içeren zarfsız bir virus olup çeşitli somon türleri ve yumuşakçalar arasında düşük veya orta düzeyde hastalıklara neden olduğu bilinmektedir. Dünya çapında tatlı su ve tuzlu su kökenli su hayvanlarından izole edilen daha önce ülkemizde bildirilmemiş olan AqRV A'nın ülkemizdeki varlığı hakkında bir çalışma bulunmamaktadır. Bu amaçla ülkemizde yetiştiriciliği yapılan ve tezgahlarda satılan porsiyon boy ve daha üzeri gökkuşağı alabalıklarında AqRV A enfeksiyonlarının varlığı moleküler olarak araştırıldı. Karadeniz Bölgesinde bulunan 7 ilde (Sinop, Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon, Rize, Artvin) yetiştiriciliği yapılan gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) satılan balıkçı tezgahlarından her ilden 30 gökkuşağı alabalığı olacak şekilde toplamda 210 adet örnekleme yapıldı. Balıkların nekropsisi sonucu karaciğer, dalak, ön böbrek ve kalp alındı. 5 balık organlarından 1 havuz olacak şekilde organlar 1 tüpte toplandı. Toplanan örneklerle yapılan RT-PCR testleri sonucunda pozitif kontrol çalıştı ve 4 havuzda (Trabzon 3, Trabzon 6, Rize 3 ve Rize 5) viral yük saptandı. Pozitiflik rastlanan havuzlar açılarak hepsine tek tek tekrar RNA ekstraksiyonu ve RT-PCR yapıldı. Trabzon'da 7 balık, Rize'de ise 10 balık pozitif olarak tespit edildi. Yapılan filogenetik analiz sonucunda virusların Chum salmon aquareovirus ile yüzde 98,18 benzerlik tespit edildi. Ayrıca nekropsi sonucunda pozitiflik rastlanan iki balık karaciğerinde lezyonlar saptandı. Bu tez çalışması ile Türkiye'de ilk kez gökkuşağı alabalıklarında AqRV A tespiti yapılmıştır
Özet (Çeviri)
Aquareovirus A (AqRV A) is a non-envelope virus containing 11 segmented double-stranded RNA, belonging to the family Spinareoviridae, known to cause low or moderately severe diseases among various salmon species and mollusks. There is no study regarding the presence of AqRV A, isolated from freshwater and saltwater-origin aquatic animals worldwide, which is highly virulent in its hosts and has never been reported in Turkiye before. Therefore, this study aimed to investigate the existence of AqRV A infections in rainbow trout, portion-sized and larger, cultivated and sold in our country. A total of 120 samples were collected, 30 rainbow trout from each of the 7 provinces (Sinop, Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon, Rize, Artvin) in the Black Sea Region where rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) are cultivated. Following the necropsy of the fish, liver, spleen, anterior kidney, and heart were collected. Organs from 5 fish were combined into one pool in a tube. RT-PCR tests were conducted on the collected samples, including a positive control, and viral load was detected in 4 pools (Trabzon 3, Trabzon 6, Rize 3, and Rize 5). Each pool showing positivity underwent individual RNA extraction and nested RT-PCR. Consequently, 7 fish from Trabzon and 10 fish from Rize were identified as positive. The similarity of the viruses was determined to be 98.18% with Chum salmon aquareovirus. The obtained sequences were uploaded to GenBank, obtaining accession numbers. This thesis marks the first detection of Aquareovirus A in rainbow trout in Turkey.
Benzer Tezler
- Gökkuşağı alabalığından (Oncorhynchus mykiss) izoleedilen Lactococcus garvieae izolatlarının antimikrobiyalprofillerinin belirlenmesi
Antimicrobial profiles determination of Lactococcus garvieae strains isolated from diseased rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
İSMAİL KARATAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Su ÜrünleriRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİKRİ BALTA
- Doğu Karadeniz'de yetiştiriciliği yapılan gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss) kromozom farklılıklarının belirlenmesi
Başlık çevirisi yok
MEHMET ULUPINAR
Doktora
Türkçe
1998
Balıkçılık TeknolojisiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM OKUMUŞ
- Doğu Karadeniz Bölgesindeki alabalık kuluçkahanelerinde ve yavru alabalıklarda bazı viral etkenlerin araştırılması
İnvestigation of some viral pathogens in trout hatcheries and juveniles in Eastern Black Sea Region
HÜSEYİN ALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiMehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SİBEL HASIRCIOĞLU
PROF. DR. OYA BULUT
- Gökkuşağı alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) izole edilen Lactococcus spp. izolatlarının API 20 strep testi ile tanımlanması
Identification of Lactococcus spp. strains, isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), by API 20 strep test
MUHAMMED YAĞMUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Su ÜrünleriRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİKRİ BALTA
- Karadeniz bölgesindeki balıklarda viral hemorajik septisemi virüsünün izolasyonu ve patojenitelerinin belirlenmesi
Isolation of viral haemorrhagic septicemiae virus in fish in the black sea region and determination of its pathogenicity
HAKAN IŞIDAN