Çoklu ilaç dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarına karşı litik bakteriyofajın izolasyonu, karakterizasyonu ve fajın n-asetil sistein ile biyofilm üzerindeki etkisi
Isolation and characterization of a lytic bacteriophage against multidrug resistant Pseudomonas aeruginosa isolates and its effect on n-acetyl cysteine and biofilm
- Tez No: 879420
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Amaç: Kistik fibrozis (KF) hastalarında baskın enfeksiyon kaynağı olan Pseudomonas aeruginosa izolatlarına karşı etkili litik bakteriyofaj izole etmek ve bu fajın N-asetil sistein (NAC) ile birlikte P. aeruginosa biyofilm oluşumu üzerindeki etkisini değerlendirmek. Yöntem: Bu çalışmada, bakteriyofajlar geleneksel kültür yöntemleri kullanılarak izole edilmiştir. Biyolojik karakterizasyon kapsamında fajın litik spektrumu, pH stabilitesi, termal stabilitesi, enfeksiyon çokluğu, tek adımda büyüme ve patlama boyutu belirlenmiştir. Genomik karakterizasyon, faj DNA ekstraksiyonu, restriksiyon fragman uzunluğu polimorfizmi (RFLP) ve faj genom analizini kapsamıştır. KF P. aeruginosa izolatlarının in vitro biyofilm oluşumu, kristal viyole boyama ile mikrotitre plak testi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bulgular: MLPa10 fajı, KF hastalarından izole edilen P. aeruginosa, özellikle P. aeruginosa 1Pa ve P. aeruginosa 316Pa, indikatör konak olarak kullanılarak kanalizasyon suyundan izole edilmiştir. KF hastalarından izole edilen klinik P. aeruginosa izolatlarının %94,11'ine karşı bakteriyofaj MLPa10, güçlü litik aktivite göstermiştir. Fajın latent ve patlama süreleri sırasıyla 30 ve 40 dakika, patlama boyutu ise 89 PFU/enfekte hücre olarak ölçülmüştür. MLPa10 fajı, pH 6 ve pH 8'de ve 1 saat boyunca 40, 50, 60°C'de stabil kalmıştır. Bu fajın genom analizi, taksonomik olarak Caudoviricetes sınıfından litik bir faj olarak olduğunu çıkarmıştır. Faj genomunda, hiçbir virülans faktör veya antimikrobiyal direnç geni tespit edilmemiştir. Çalışma, MLPa10 fajının KF P. aeruginosa izolatlarının %76,9'unda olgun biyofilmleri etkili bir şekilde azalttığını ve aynı zamanda olguların %65,38'inde biyofilm oluşumunu engellediğini göstermiştir. Ek olarak, NAC tek başına da biyofilmlere karşı etkinlik göstermiştir. Bununla birlikte, MLPa10 fajı NAC ile birleştirildiğinde daha düşük etkinlik göstermiştir. Sonuç: MLPa10 fajının kapsamlı karakterizasyonu, KF P. aeruginosa enfeksiyonlarına karşı terapötik bir ajan olarak kullanılma potansiyelinin altını çizmektedir.
Özet (Çeviri)
Objective: To isolate lytic bacteriophage effective against Pseudomonas aeruginosa isolates, the main source of infection in cystic fibrosis (CF) patients, and to evaluate the effect of this phage together with N-acetyl cysteine (NAC) on P. aeruginosa biofilm formation. Method: In this study, bacteriophages were isolated using traditional culture methods. Biological characterization included determination of lytic spectrum, pH stability, thermal stability, multiplicity of infection, one-step growth and burst size. Genomic characterization included phage DNA extraction, restriction fragment length polymorphism (RFLP) and phage genome analysis. In vitro biofilm formation of CF P. aeruginosa isolates was performed using microtiter plate assay with crystal violet staining. Results: MLPa10 phage was isolated from sewage water using P. aeruginosa isolated from CF patients, specifically P. aeruginosa 1Pa and P. aeruginosa 316Pa, as indicator hosts. The bacteriophage MLPa10 showed strong lytic activity against 94.11% of clinical P. aeruginosa isolates from CF patients. The latent and burst periods of the phage were 30 and 40 minutes, respectively, and the burst size was measured as 89 PFU/infected cell. MLPa10 phage was stable at pH 6 and pH 8 and at 40, 50, 60°C for 1 hour. Genome analysis of this phage revealed it to be taxonomically a lytic phage of the class Caudoviricetes. No virulence factors or antimicrobial resistance genes were detected in the phage genome. The study showed that MLPa10 phage effectively reduced mature biofilms in 76.9% of CF P. aeruginosa isolates and also inhibited biofilm formation in 65.38% of cases. In addition, NAC alone also showed efficacy against biofilms. However, the MLPa10 phage showed lower efficacy when combined with NAC. Conclusion: The extensive characterization of MLPa10 phage underlines its potential as a therapeutic agent against CF P. aeruginosa infections.
Benzer Tezler
- Yara enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli bakterilere karşı fotodinamik ajanların antibakteriyel etkinliği
The antibacterial activity of photodynamic agents against multidrug resistant bacteria causing wound infection
AYŞE AKBIYIK
Doktora
Türkçe
2017
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN TAŞLI
YRD. DOÇ. DR. NERMİN TOPALOĞLU AVŞAR
- Studying the effect of green synthesized iron nanoparticles on multi drug resistant bacteria isolated from wound
Yeşı̇l sentez yolu ile sentezlenmiş demı̇r nanopartı̇küllerı̇nı̇n yaradan ı̇zole edı̇len çoklu ı̇laca dirençli bakterı̇ler üzerı̇ndekı̇ etkı̇sı̇nı̇n araştırılması
ADHAM JAWAD KADHIM AL-KHASHMANI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA CAN KARAHAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ SUHA MAHER ABED
- Hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden izole edilen çoklu ilaç dirençli acinetobacter ve pseudomonas izolatlarında metallobetalaktamaz (MBL) varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of the phenotypic and genotypic methods of the metallobetalactamase presence in multidrug resistance acinetobacter and pseudomonas isolates from an intensive care unit infections in our hospital
CENNET RAĞBETLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
- Klinik Pseudomonas aeruginosa izolatlarında β-laktamaz direnç genlerinin taranması ve yeni bir metallo-β-laktamazın (VIM-38) karakterizasyonu
Screening of β-lactamase resistance genes clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa and characterization of a new metallo-β-lactamase (VIM-38)
AZER ÖZAD DÜZGÜN
Doktora
Türkçe
2015
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEMAL SANDALLI
- Harran Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnç, indüklenebilir betalaktamaz ve metallo betalaktamaz oranlarının belirlenmesi
Determinaton rates of antibiotic resistance, inducible betalactamase and metallo betalactamase in pseudomonas aeruginosa strains isolated in Mikrobiyology Laboratory of Research and Application Hospital Harran Universty
HADİCE ÖZÇINAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiHarran ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR