Kolorektal karsinom için yeni nesil ilaç adayı moleküllerin belirlenmesi, klinik ilaçlar ile etkilerinin karşılaştırılması
Identification of new generation drug candidate molecules for colorectal carcinoma, comparison of effects with clinical drugs
- Tez No: 882543
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA TURAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Onkoloji, Moleküler Tıp, Genel Cerrahi, Oncology, Molecular Medicine, General Surgery
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
- Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu çalışmanın amacı, kolorektal kanser (KRK) için yeni nesil ilaç adayı moleküllerin etkinliğini ve bu moleküllerin mevcut klinik ilaçlarla, özellikle 5-fluorouracil (5-FU) ve bevacizumab ile karşılaştırmalı etkilerini değerlendirmektir. In silico yöntemlerle tanımlanan ve sentezlenen aday maddeler, HCT116 ve L929 hücre hatları üzerinde hücresel değişiklikler, sitotoksisite, apoptoz, hücre siklusu ve sinyal yolları üzerine etkileri açısından incelenmiştir. Gereç ve Yöntem: Hücre kültürleri için RPMI ve DMEM besi yerleri kullanılarak çeşitli hücre hatları kültüre edilmiş, ilaç uygulamaları yapılmış ve MTT analizi ile hücre canlılığı ölçümleri gerçekleştirilmiştir. Flow sitometri analizleri ile hücre döngüsü ve apoptoz etkileri incelenmiş, gen zenginleştirme analizleri için cDNA sentezi ve RT-qPCR uygulamaları yapılmıştır. Bulgular: İncelenen yeni aday maddenin KRK hücre hattında 5-FU ve bevacizumab'a göre benzer veya daha üstün antikanser aktiviteler gösterdiğini ortaya koymuştur. Özellikle SMY370 molekülü, diğer adaylar arasında en etkili olanı olarak belirlenmiş ve hücrelerin büyük çoğunluğunu öldürmüştür. Gen zenginleştirme analizleri, 5-FU ve SMY370'in benzer yolakları etkilediğini ve programlı hücre ölümü, kaspaz aktivasyonu, nekroz ve SMAC/DIABLO-XIAP aracılı apoptoz cevabı regülasyonu gibi süreçleri modüle ettiğini göstermiştir. Sonuç: Bu çalışma, özellikle SMY370 gibi yeni moleküler hedeflerin KRK tedavisinde önemli potansiyele sahip olduğunu ve bu yeni aday moleküllerin klinik kullanım öncesi daha detaylı araştırmalarla değerlendirilmesi gerektiğini belirtmiştir. İlacın etkilediği gen ekspresyonları ve sinyal yolları, ileride yapılacak çalışmalarda bu moleküllerin KRK tedavisinde kullanımının optimize edilmesine yardımcı olabilecek önemli bilgiler sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Aim: The objective of this study was to assess the efficacy of next-generation drug candidate molecules for colorectal cancer (CRC) and to compare their effects with current clinical drugs, specifically 5-fluorouracil (5-FU) and bevacizumab. Identified and synthesized through in silico methods, these candidate compounds were tested on HCT116 and L929 cell lines for cellular alterations, cytotoxicity, apoptosis, cell cycle impact, and signaling pathways. Materials and Methods: In terms of materials and methods, various cell lines were cultured using RPMI and DMEM media, subjected to drug applications, and cell viability was measured through MTT assay. Cell cycle and apoptosis effects were examined via flow cytometry analysis, and cDNA synthesis and RT-qPCR applications were conducted for gene enrichment analyses. Results: The findings indicated that the new candidate compounds displayed similar or superior anti-cancer activities compared to 5-FU and bevacizumab in the CRC cell line. Specifically, the molecule SMY370 was identified as the most effective, inducing death in the majority of cells. Gene enrichment analyses suggested that 5-FU and SMY370 affected similar pathways, modulating processes such as programmed cell death, caspase activation, necrosis, and regulation of apoptosis response mediated by SMAC/DIABLO-XIAP. Conclusion: This study suggests that new molecular targets, particularly SMY370, hold significant potential for CRC therapy and that these new candidate molecules should be subjected to more detailed investigations before clinical use. The gene expression and signaling pathways influenced by the drug provide essential information that may assist in optimizing the use of these molecules for CRC treatment in future studies.
Benzer Tezler
- Küçük hücreli dışı akciğer kanserlerinde immünhistokimyasal ve moleküler yöntem ile ntrk füzyonu
Research of ntrk fusion by immunhistochemical andmolecular methods in non-small cell lung cancers
UBEYDULLAH ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERDA BİR
- Quantum effects in biological systems
Biyolojik sistemlerde kuantum etkileri
GİZEM ÇELEBİ TORABFAM
Doktora
İngilizce
2025
BiyofizikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NUR MUSTAFAOĞLU VAROL
- Obtain anterior/posterior position of the tumor through machine learning
Makine öğrenme yoluyla tümörün anterior/posterior pozisyonunu elde edin
GOLSHAN GHOLAMPOUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM AKDUMAN
- Kolorektal karsinomlarda KRAS, NRAS, BRAF, PIK3CA mutasyonlarının klinikopatolojik bulgularla ilişkisi
The relationship of kras, NRAS, BRAF, PIK3CA mutations and clinicopathological findngs in colorectal carcinoma
ELİF MERCAN DEMİRTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
PatolojiTrakya ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EBRU TAŞTEKİN
- Macrovipera lebetinus zehrinin insan kolorektal karsinom hücreleri üzerinde moleküler ve terapötik etkisinin araştırılması
Investigation of molecular and therapeutic effects of Macrovipera lebetinus venom on human colorectal carcinoma cells
SUDE KOCABIYIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERDAR KARAKURT