Geri Dön

Akciğer kanseri ile ilişkili miRNA ekspresyon profillerinin belirlenmesi

Determination of miRNA expression profiles related to lung cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 885726
  2. Yazar: DİLEK ÇEKER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY, DOÇ. DR. ABDULLAH KARADAĞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Onkoloji, Genetics, Molecular Medicine, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 215

Özet

Kanser, hem dünya genelinde hem de ülkemizde ölüm oranlarında ikinci sırayı alarak büyük bir halk sağlığı sorunu haline gelmiştir. Teknolojik ilerlemelerin artmasıyla birlikte kanser teşhisleri de hızla artmaktadır. Erken evre kanser teşhisi, tedavi başarısını etkileyen önemli bir faktördür ve bu amaçla çeşitli kanser tarama programları geliştirilmiştir. Çeşitli yöntemler arasında biyokimyasal, genetik, histolojik ve görüntüleme tabanlı testler bulunmaktadır. Kanser, heterojen bir hastalık olduğundan alt tiplerin doğru belirlenmesi, moleküler anormalliklerin ve biyobelirteçlerin anlaşılmasını gerektirir. Bu bağlamda, çalışmamızda Akciğer kanserinin %85'ini oluşturan KHDAK alt tipine yönelik miRNA profilleri, yeni nesil dizileme (NGS) teknolojisi kullanılarak incelenmiştir. Aynı hastadan elde edilen KHDAK tümör, reaktif stroma, normal akciğer dokusu ve lenf dokusu örneklerinin small RNA profilleri arasındaki farklılıklar ve bu miRNA'ların kana yansımaları NGS ve biyoinformatik analizlerle değerlendirilmiş, akciğer kanseri ile ilişkilendirilmiş miRNA yapıları tespit edilmiştir. Elde edilen yeni miRNA profilleri klinik, evreleme, farklılaşma, histoloji, yaş, cinsiyet gibi faktörlerle ilişkilendirilmiş ve mevcut sınıflandırma protokolleri ile karşılaştırılmıştır. Yapılan informatik analizler sonucunda 51 hastanın 255 örneğinde çeşitli miRNA'lar tanımlanmış, tümör ve kan örneklerinde ortak bulunan miRNA'lar belirlenmiştir. Farklı ifade düzeyine sahip miRNA'lar üzerine yapılan analizler ise anlamlı ifade farklılıklarını ortaya koymuştur. Bu çalışma, Akciğer Kanseri'nin bir alt tipi olan KHDAK'ın T, N, R, M dokularının ve kanların detaylı miRNA dizilemesini gerçekleştiren ve NGS teknolojisinden yararlanan bir çalışma olarak öncüdür. Bu nedenle, hastalıkla ilişkili miRNA profillerini belirlemek için yapılan ilk büyük çaplı çalışmadır. .Informatik analizler ile elde edilen bu yeni miRNA profilleri, kanserin erken evrelerinin tespiti için özgül biyobelirteçlerin geliştirilmesine yardımcı olabilir ve tedavi takibi için de önemli bir panel sunabilir. Bu şekilde, hedeflenen miRNA'lar kanser tedavisine olumlu etkiler sağlayabilir.

Özet (Çeviri)

Cancer, ranking as the second leading cause of death both globally and in our country, has emerged as a significant public health concern. With the surge in technological advancements, cancer diagnoses are rapidly increasing. Early-stage cancer diagnosis stands as a crucial factor influencing treatment success, leading to the development of various cancer screening programs. Among these, a range of methods including biochemical, genetic, histological, and imaging-based tests have been devised. Given the heterogeneous nature of cancer, accurate identification of subtypes requires an understanding of molecular abnormalities and biomarkers, vital for predicting treatment efficacy and clinical prognosis. In this context, our study focuses on miRNA profiles specific to the KHDAK subtype, accounting for 85% of Lung cancer cases, utilizing Next-Generation Sequencing (NGS) technology. First, alterations in small RNA profiles among KHDAK tumor samples, reactive stromal tissue, normal lung tissue, and lymph tissue, along with their bloodstream reflections, have been assessed through bioinformatics-supported analysis. miRNA structures associated with lung cancer have been identified. Subsequently, the novel miRNA profiles have been correlated with clinical parameters such as staging, differentiation (grade), histology, smoking habits, age, gender, and compared against existing classification protocols. As a result of comprehensive bioinformatics analyses, diverse miRNAs have been identified in 255 patient samples, with miRNAs shared between tumor tissues and blood samples. Analyses focusing on miRNAs with different expression levels in both blood and tissue have revealed significant expression variations. This study pioneers the detailed miRNA sequencing of T, N, R, M tissues and blood of KHDAK, a subtype of Lung cancer, utilizing NGS technology, thus representing the first large-scale effort to delineate disease-related miRNA profiles. The novel miRNA profiles identified may facilitate the development of specific biomarkers for early-stage cancer detection and enhance treatment monitoring. Consequently, these targeted miRNAs could positively impact lung cancer management.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    390235

    Mesane kanserinde Toll-benzeri reseptörlerin ekspresyon profillerinin belirlenmesi

    Determination of expression profiles of Toll-like receptors in bladder carcinoma

    SEDA SABAH ÖZCAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. VİLDAN CANER

  2. Tez No

    818583

    Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study

    Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma

    DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaSüleyman Demirel Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU

  3. Tez No

    513333

    Investigation of the localization pattern and the role of anti apoptotic BAG-1 in healthy and tumor tissues from patients with breast carcinoma

    Meme kanserli hastalardan alınan sağlıklı ve tümörlü dokularda anti-apoptotik BAG-1 proteininin rolü ve lokalizasyonunun incelenmesi

    JALE YILDIZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    375114

    DNA metiltransferaz ve metil bağlayan bölge proteinlerini hedefleyen miRNA gen polimorfizmlerinin akciğer kanseri ile ilişkisinin belirlenmesi

    Determination of association between polymorphisms of miRNA genes targeting dna methyltransferases and methyl binding proteins with lung cancer

    CANSU ÖZBAYER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İRFAN DEĞİRMENCİ

  5. Tez No

    567637

    Küçük hücreli dışı akciğer kanseri tanısında miRNA türlerinin prediktif önemi

    The predictive importance of miRNA species in the diagnosis of non-small cell lung cancer

    DURMUŞ LEVENT GÜLER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    OnkolojiPamukkale Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN DEĞİRMENCİOĞLU

Geri Dön