Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen Acınetobacter Baumannıı'de bıyofilm oluşumunun genotip ve fenotip korelasyonu

Genotype and phenotype correlation of biofilm formation among Acinetobacter Baumannii isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 887727
  2. Yazar: GHAITH KAREEM ABDULHASAN ABDULHASAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

Acinetobacter baumannii, çeşitli insan hastalıklarından sorumlu olan önemli bir nozokomiyal patojendir. Son zamanlarda, A.baumannii'deki antibiyotik direncinin katlanarak artması, halk sağlığı alanında önemli bir endişe kaynağı olarak ortaya çıkmıştır. Biyofilm oluşturma kapasitesi, Acinetobacter'in hastane ortamında hayatta kalmasını ve bulaşmasını kolaylaştırmada önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışma, Acinetobacter baumani'yi izole etmek ve teşhis etmek amacıyla Kasım 2021 ile Mayıs 2022 tarihleri arasında Babil / Irak'taki çeşitli hastanelere başvuran, farklı cinsiyet ve yaştaki hastalardan farklı klinik bölgelerden (idrar, kulak iltihabı, boğaz sürüntüsü, kan, cilt lezyonu) 200 örnek alınarak gerçekleştirilmiştir. Bakteriyel izolatların izolasyonu ve tanımlanması MacConkey agar kullanılarak yapılmış ve antibiyotik direnç paterni ve konformasyonel tanımlamaya ek olarak biyokimyasal testler otomatik VITEK-2 sistemi cihazları kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bakteri izolatlarının biyofilm oluşturma kapasitesi mikrotitre plak yöntemi kullanılarak belirlenmiş; ayrıca biyofilmle ilişkili genler geleneksel polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak tespit edilmiştir. 200 klinik örnekten sadece 59'unda A. baumannii için pozitif üreme kültürü elde edilmiştir. Yaşa göre, hastaların minimum yaşı 9 iken maksimum yaşı 78'dir ve yaş ortalaması 35,69±18,05'tir. Kadınların sıklığı 31 (%52,54) olup, erkeklerin sıklığından 28 (%47,46) daha yüksektir. A.baumannii izolatları için pozitif 59 örnek arasında, kulak irini örnekleri 19 (%32,20) ile en yüksek sayıya sahipken, bunu sırasıyla 14 kan örneği(%23,78), 10 idrar örneği(%16,95) ve 9 deri lezyonu örneği(%15,25) izlemiş, boğaz sürüntü örnekleri ise 7 numuneyle(%11,86) en düşük sayıya sahip olmuştur. Tüm A.baumannii izolat kolonileri orta büyüklükte, mukoid olmayan, pigmentsiz ve MacConkey agarda geç laktoz fermantasyonuna sahiptir. Toplam 59 izolattan; 26'sı (%44,1)güçlü, 17'si orta (%28,8) ve 10'u (%16,9) zayıfolmak üzere 53'ü biyofilm üretme yeteneğine sahiptir. Sadece 6 (%10,2) izolat biyofilm üretimi ile ilişkili değildir. Bakteri izolatları arasında cruF geninin sıklığı %76,3 ile en yüksek seviyeye sahipken bunu sırasıyla (%69,5) bap bla PER-1 geni ve (%62,7) bap geni takip etmiştir, OmpA geninin sıklığı ise %44,1 olmuştur. En yüksek antibiyotik direnci trimetoprim-sülfametoksazole (%57,6) karşı iken, bunu gentamisin ve imipenem (%55,9), seftazidim (%52,5), amikasin (%50,8), streptomisin (%47.5), tigesiklin (%44,1), sefepim (%39), karbenisilin (%37,3) ve piperasilin (%25,4) takip etmiştir.

Özet (Çeviri)

Acinetobacter baumannii is an important nosocomial pathogen responsible for various human diseases. Recently, the exponential increase of antibiotic resistance in A. baumannii has emerged as a major public health concern. The capacity to form biofilms plays an important role in facilitating the survival and transmission of Acinetobacter in the hospital setting. This study was conducted to isolate and diagnose Acinetobacter baumani by collecting 200 samples from different clinical sites (urine, ear infection, throat swab, blood, skin lesion) from patients of different gender and age admitted to various hospitals in Babylon/Iraq between November 2021 and May 2022. Bacterial isolates were isolated and identified using MacConkey agar and biochemical tests in addition to antibiotic resistance pattern and conformational identification were performed using automated VITEK-2 system devices. The biofilm-forming capacity of bacterial isolates was determined using the microtiter plate method; biofilm-associated genes were also detected using conventional polymerase chain reaction (PCR). Only 59 out of 200 clinical samples yielded positive cultures for A. baumannii. According to age, the minimum age of the patients was 9 years, and the maximum age was 78 years, with a mean age of 35.69±18.05 years. The frequency of females was 31 (52.54%), which was 28 (47.46%) higher than the frequency of males. Among the 59 samples positive for A. baumannii isolates, ear pus samples had the highest number with 19 (32.20%), followed by blood samples with 14 (23.78%), urine samples with 10 (16.95%) and skin lesion samples with 9 (15.25%), while throat swab samples had the lowest number with 7 (11.86%). All A. baumannii isolate colonies were medium-sized, non-mucoid, non-pigmented and had late lactose fermentation on MacConkey agar. Of the 59 isolates, 53 were capable of producing biofilms. These were classified as strong 26 (44.1%), moderate 17 (28.8%) and weak 10 (16.9%), with only 6 (10.2%) isolates not associated with biofilm production. Among the bacterial isolates, the frequency of cruF gene was the highest with 76.3%, followed by bap bla PER-1 gene with 69.5% and bap gene with 62.7%, while the frequency of OmpA gene was 44.1%. The highest antibiotic resistance was to trimethoprim-sulfamethoxazole (57.6%), followed by gentamicin and imipenem (55.9%), ceftazidime (52.5%), amikacin (50.8%), streptomycin (47.5%), tigecycline (44.1%), cefepime (39%), carbenicillin (37.3%) and piperacillin (25.4%). The lowest level of resistance was determined as ticarcillin (23.7%).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    308120

    Acinetobacter baumannii izolatlarında biyofilm üretimi ve kolistin duyarlılıklarının biyofilm formasyonunda araştırılması

    Investigation of biofilm formation in acinetobacter baumannii isolates and their colistin susceptibilties in biofilm formation

    FİKRİYE MİLLETLİ SEZGİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN

  2. Tez No

    802565

    Eravasiklinin tek başına ve çeşitli antibiyotiklerle kombinasyon halinde acinetobacter baumannii suşlarına karşı in vitro antimikrobiyal etkinliklerinin araştırılması

    Eravasiklinin tek başina ve çeşitli antibiyotiklerle kombinasyon halinde acinetobacter baumannii suşlarina karşi in vitro antimikrobiyal etkinliklerinin araştirilmasi

    MERVE ATAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERNA ÖZBEK ÇELİK

  3. Tez No

    301241

    Kan ve solunum yolu örneklerinden izole edilenacınetobacter baumannıı suşlarının fenotipik vegenotipik yöntemlerle karşılaştırılması

    Comparison of acinetobacter baumannii strains isolated from blood and respiratory tract samples with phenotypic and genotypic methods

    PINAR BEKDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN

  4. Tez No

    873222

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen acinetobacter spp. suşlarında quorum sensing ve antibiyotik direnç genleri̇ni̇n araştırılması

    Investigation of quorum sensing and antibiotic resistance genes in acinetobacter spp. strains isolated from various clinical samples

    SAİT RAMAZAN GÜLBAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. METİN DOĞAN

  5. Tez No

    452564

    Acinetobacter baumannii izolatlarında virülans faktörleri ve antimikrobiyal direnç profilleri ile ilişkisi

    The relationship between the virulence factors of acinetobacter baumannii isolates and the antimicrobial resistance profiles

    NİLÜFER UĞUR ÖZLÜK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiBülent Ecevit Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CANAN KÜLAH

Geri Dön