Geri Dön

Kuraklık stresi uygulanmış patlıcan hatlarında hareketli genetik elementlerin tespiti

Determination of mobile genetic elements in drought stress applied eggplant lines

PDF İndir

  1. Tez No: 888292
  2. Yazar: MELİKE ŞAHİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAHRAMAN GÜRCAN, DOÇ. DR. FATİH HANCI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Ziraat, Biology, Biotechnology, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Gevher Nesibe Genom ve Kök Hücre Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Bu araştırmada, patlıcan bitkisinde kuraklık stresine maruz bırakılmış 9 adet tolerant, 5 adet hassas genotipe ait DNA örnekleri, IRAP (WLTR 2105; Sukkula, Stowaway, Nikita 57; LTR 6149, LTR 6150, Nikita E 2647; Bare 1) ve REMAP (Nikita 2647 + UBC900; Sukkula + UBC900; Stowaway + UBC 900; Stowaway + UBC 842; Stowaway + UBC 811; Sukkula + UBC811; Nikita 2647 + UBC842) markörleri ile stres öncesi ve stres sonrası karşılaştırılarak hareketli genetik elementler araştırılmıştır. Araştırma sonucunda genel olarak IRAP markörleriyle elde edilen toplam allel sayısının tolerant ve hassas genotiplerde stres sonrası artış gösterdiği belirlenmiştir. Her bir markör için ayrı ayrı incelendiğinde ise kuraklığa tolerant bitkilerde, stres sonrası allel sayısı değişim yüzdesinde herhangi bir homojen tepki gözlenmemiştir. Oysa hassas genotiplerde Sukkula dışındaki tüm markörlerde allel sayıları artmıştır. Kuraklığa tolerant grupta, allel ortalaması stres öncesi 6,46 allel/genotip iken, stres sonrası 6,60 allel/genotip (%2,29 artış) olarak tespit edilmiştir. Hassas grupta ise, allel ortalaması stres öncesi 9,00 allel/genotip iken, stres sonrası 11,48 allel/genotip (%27,56 artış) olarak tespit edilmiştir. REMAP markörlerinde ise genel olarak allel sayıları değişimi bakımından daha stabil bir durum ortaya çıkmıştır. Stowaway + UBC842, Stowaway + UBC 811, ve Sukkula + UBC811 kombinasyonlarında en yüksek stabilite tespit edilirken, diğer kombinasyonlarda hassas ve tolerant bireylerin artış/azalış eğilimleri birbirileri ile aynı yönde olmuştur. Sukkula + UBC 900 kombinasyonunda ortaya çıkan yaklaşık 450 bç ve yaklaşık 2700 bç büyüklüğündeki alleller, Sukkula + UBC 811 kombinasyonunda elde edilen yaklaşık 750 bç ve Stowaway + UBC 900 kombinasyonunda elde edilen yaklaşık 1300 bç büyüklüğündeki alleller, kuraklığa hassas ve tolerant genotipler arasında, frekans değerleri göz önünde tutulduğunda anlamlı tepkiler vermiştir. Bu sonuçların, patlıcan bitkisinde kuraklıkla ilgili yapılacak genetik tabanlı çalışmalarda yol gösterici olabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, DNA samples from 9 drought-tolerant and 5 drought-sensitive eggplant genotypes were analyzed for mobile genetic elements using IRAP (WLTR 2105; Sukkula, Stowaway, Nikita 57; LTR 6149, LTR 6150, Nikita E 2647; Bare 1) and REMAP (Nikita 2647 + UBC900; Sukkula + UBC900; Stowaway + UBC 900; Stowaway + UBC 842; Stowaway + UBC 811; Sukkula + UBC811; Nikita 2647 + UBC842) markers, comparing pre-stress and post-stress conditions. The results indicated that the total number of alleles detected using IRAP markers increased in both tolerant and sensitive genotypes after stress exposure. However, when examined individually for each marker, there was no uniform response in the percentage change of allele numbers among drought-tolerant plants after stress. In contrast, in sensitive genotypes, allele numbers increased for all markers except Sukkula. In the drought-tolerant group, the average number of alleles per genotype was 6.46 before stress and 6.60 after stress (a 2.29% increase). In the sensitive group, the average number of alleles per genotype was 9.00 before stress and 11.48 after stress (a 27.56% increase). Regarding REMAP markers, the allele number changes were generally more stable. The highest stability was observed in the combinations Stowaway + UBC842, Stowaway + UBC 811, and Sukkula + UBC811, while other combinations showed similar trends of increase/decrease in allele numbers for both sensitive and tolerant individuals. Alleles of approximately 450 bp and approximately 2700 bp in the Sukkula + UBC 900 combination, approximately 750 bp in the Sukkula + UBC 811 combination, and approximately 1300 bp in the Stowaway + UBC 900 combination exhibited significant responses between drought-sensitive and drought-tolerant genotypes, considering their frequency values. These findings are expected to provide guidance for genetic studies related to drought in eggplant.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    120925

    Kontrollü nemlendirme uygulamasının sebze tohumlarında tohum gücünü arttırma amacıyla kullanımı

    Use of controlled hydration treatment in order to enhance vigour of vegetable seeds

    GAMZE OKÇU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM DEMİR

  2. Tez No

    568950

    Kuraklık stresi uygulanmış mercimek (Lens Culinaris Medik.) bitkisinin RNA dizileme yöntemi ile transkripsiyonel analizi

    Transcriptional analysis of lentil (Lens culinaris Medik.) plant exposed to drought stress by RNA sequencing method

    HANDE MORGİL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜL CEVAHİR ÖZ

    PROF. DR. İBRAHİM HALİL KAVAKLI

  3. Tez No

    430099

    Ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.)'da kuraklık stresi dayanıklılığı ile ilişkili dna markörlerin belirlenmesi

    Determination of dna based molecular markers associated with drought tolerans in wheat (Triticum aestivum L.)

    EMİNE AÇAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER

  4. Tez No

    653959

    In vitro ortamda kuraklık stresine maruz bırakılan Morus nigra L. (karadut)'da melatoninin etkisinin biyokimyasal ve fizyolojik cevaplarla değerlendirilmesi

    Evaluation by biochemical and physiological responses of melatonin effect in Morus nigra L. (black mulberry) exposed to drought stress at in vitro medium

    DUYGU ÖZELÇİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Biyolojiİnönü Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMEL YİĞİT

  5. Tez No

    687159

    Bazı turunçgil anaçlarında kuraklık ile ilişkili bazı hareketli genetik elementlerin (Transpozon) aktivitelerinin karşılaştırılması

    Comparison of the activities of some mobile genetic elements (Transposon) associated with drought in some citrus rootstocks

    MUHAMMET MUSTAFA SEZER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ KAÇAR

Geri Dön