Development of therapeutic strategies against Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF)
Kırım-Kongo kanamalı ateşine (KKKA) karşı tedavi stratejilerinin geliştirilmesi
- Tez No: 893293
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ URARTU ÖZGÜR ŞAFAK ŞEKER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA), insanlarda oldukça ölümcül ve zoonotik bir arboviral enfeksiyondur. CCHF virüsünün neden olduğu bu hastalık, %40'a kadar ulaşan ölüm oranıyla şiddetli kanamalı salgınlara yol açmaktadır. KKKA, Hyalomma türüne ait keneler aracılığıyla bulaşması nedeniyle bir arboviral hastalık olarak sınıflandırılır. İnsan enfeksiyonu, enfekte kenelerin ısırması veya enfekte hayvanların ya da hastaların vücut sıvılarına maruz kalma yoluyla gerçekleşir. Türkiye'de ilk bildirilen vakadan bu yana 2002 yılında, toplamda 9.700 vaka kaydedilmiştir. Hastalık Türkiye'de endemik olup, ülkeyi Avrupa bölgesinde KKKA'dan en çok etkilenen ülkelerden biri konumuna getirmiştir. Şu anda KKKA'ya karşı etkili bir koruyucu önlem, aşı veya spesifik antiviral tedavi bulunmamaktadır. Bu etkili karşı önlemlerin yokluğu, önemli bir halk sağlığı tehdidi ve ciddi bir sosyolojik sorun teşkil etmektedir. Bu çalışmanın amacı, CCHF'ye karşı virüs spesifik ve konakçıya güvenli stratejiler geliştirmek, virüs enfeksiyonunu doğrudan inhibe etmek ve/veya hastalığın sonrasındaki tedavisini gerçekleştirmektir. Bu amaç doğrultusunda, CRISPR/Cas13b genom düzenleme aracı kullanılacaktır. CRISPR-Cas13b gibi RNA düzenleme sistemleri, gen ekspresyonunu DNA dizilimini değiştirmeden kontrol etme avantajı sunar ve RNA düzeyinde geçici modifikasyonlar uygulayabilir, bu da onları RNA virüsleriyle mücadelede umut verici araçlar haline getirir. Virüs genom segmentlerinden S segmenti, viral genomu korumak ve organize etmek için nükleokapsid proteinini kodlar, ve L segmenti ise, viral çoğalma ve transkripsiyon süreçleri için gerekli olan RNA polimerazı kodlar. Bu iki segment CRISPR/Cas aracı ile etkisiz hale getirilecektir. Son olarak, CRISPR/Cas13b sistemi aracılığıyla HEK293 hücrelerinde CCHFV replikasyonunun inhibisyonunu göstermek için, gen aktarım ajanı olarak rekombinant adeno-ilişkili virüs (rAAV) kullanılacaktır. Önerilen hipotez doğrulanırsa, proje ülkede önemli bir etki yaratacak ve elde edilen bilgi birikimi ile anlamlı bir katkı sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
Crimean-Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) is a highly fatal and zoonotic arboviral infection in humans. It is caused by the CCHF virus, which precipitates severe hemorrhagic outbreaks with a mortality rate reaching up to 40%. CCHF is classified as an arboviral disease due to its transmission through tick vectors of the Hyalomma species, which are arthropods. Human infection occurs either via bites from infected ticks or through exposure to the bodily fluids of infected animals or patients. Since the initial reported case in Turkey in 2002, a total of 9,700 cases have been documented. The disease is endemic in Turkey, positioning it as one of the most affected countries by CCHF within the European region. Currently, there is no effective protective measure, such as a vaccine or specific antiviral treatment, for CCHF. This lack of effective countermeasures constitutes a significant public health threat and a serious sociological issue. The aim of this study is to develop virus-specific and host-safe strategies against CCHF to directly inhibit virus infection and/or subsequent treatment of the disease. For this purpose, the CRISPR/Cas13b genome editing tool will be utilized. RNA editing systems, such as CRISPR-Cas13b, offer the advantage of controlling gene expression without altering the underlying DNA sequence and can exert transient modifications at the RNA level, making them promising tools in combating RNA viruses. The two virus genome segments, the S segment, which encodes the nucleocapsid protein to protect and organize the viral genome, and the L segment, which encodes RNA polymerase for replication and transcription processes necessary for viral propagation, will be rendered ineffective using the CRISPR/Cas tool. Finally, to demonstrate the inhibition of CCHFV replication in HEK293 cells via the CRISPR/Cas13b system, recombinant adeno-associated virus (rAAV) will be used as the gene delivery agent. If the proposed hypothesis is confirmed, the project will significantly impact the country with the know-how generated.
Benzer Tezler
- Meme kanserinin metastazında sfingozin 1-fosfat ve reseptörlerinin rolü
Role of sphingosine 1 -phosphate and its receptors in breast cancer metastasis
İBRAHİM UĞUR ÇALIŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Tıbbi BiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DİDEM TURGUT COŞAN
- Lipotoxic endoplasmic reticulum stress-associated inflammation: Molecular mechanisms and modification by a bioactive lipokine
Lipotoksik endoplazmik retikulum stresine bağlı inflamasyon: Bir biyoaktif lipokine tarafından gerçekleştirilen moleküler mekanizmalar ve modifikasyonlar
ŞEYMA DEMİRSOY
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EBRU ERBAY
- Developing advanced non-invasive nano-formulations and drug-conjugation strategies against glioblastoma via complete antibody and antibody Fab fragments
Glioblastoma karşı gelişmiş invaziv olmayan nano-formülasyonlar ve ilaç-konjugasyon stratejilerinin geliştirilmesi: Tam antikor ve antikor Fab kısımlarının kullanımı
NİLÜFER ÇAKIR
Doktora
İngilizce
2024
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NUR MUSTAFAOĞLU VAROL
- Targeting bag-1S/C-raf interaction for therapeutic intervention in cancer
Bag-1S/C-raf etkileşiminin kanserde terapötik bir yaklaşım olarak kullanılmak üzere hedeflenmesi
ÖZGE TATLI
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Aronia prunifolia nero ekstraktının antiviral potansiyelinin araştırılması
Investigaton of antiviral potential of Aronia prunifolia nero extract
GİZEM GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NALBANTSOY