Determination of tRNA-derived fragment content and effects in exosomes released from polarized microglia
Polarize edilmiş mikroglialardan salınan ekzozomlardaki tRNA kökenli fragman içeriğinin ve bunların etkilerinin belirlenmesi
- Tez No: 894402
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞERMİN GENÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Beynin yerleşik makrofajları olan mikroglia, immünolojik yanıtlara tepki vermekten ve merkezi sinir sistemindeki homeostazı korumaktan sorumludur. Mikroglia, nöroinflamasyon ve nörolojik hastalıklarda kritik bir rol oynamaktadır. Mikroglial aktivasyon, metabolik hastalıklar, nörodejeneratif hastalıklar, otoimmün hastalıklar, kanser ve daha birçok durumla ilişkilendirilmiş ve sağlık üzerindeki geniş etkisini göstermiştir. Hücre dışı veziküller (EV'ler), hücreler tarafından hücre dışı ortama salınan küçük, zarla çevrili parçacıklardır. Hücreler arasında çeşitli biyomolekülleri aktararak hücreler arası iletişimde önemli roller oynarlar. Kargolarından biri olan transfer RNA türevi fragmanlar (tRF'ler) son zamanlarda çeşitli biyolojik bağlamlarda gen ekspresyonu ve hücresel fonksiyonun temel düzenleyicileri olarak ortaya çıkmıştır. LPS verilmiş mikroglialardan salınan EV'lerin içeriğinin, özellikle de tRF'lerin anlaşılması, mikroglia ve diğer beyin hücreleri arasındaki iletişim mekanizmalarına dair içgörüler sunabilir. LPS verilmiş mikroglia tarafından salınan hücre dışı veziküllerdeki tRNA türevi parçaların içeriğinin anlaşılması, nöroinflamasyon ve ilişkili patolojilerle ilgili iletişim mekanizmalarına dair içgörüler sunabilir. Bu çalışma, LPS verilmiş mikroglialardan salınan hücre dışı veziküllerdeki tRNA türevi fragman içeriğini inceleyerek, mikroglial davranışı yöneten düzenleyici mekanizmalar ve bunların nöroinflamasyondaki rolleri hakkındaki kavrayışımızı ilerletmeyi amaçlamaktadır. Bu araştırmada, yeni nesil dizileme kullanarak LPS verilmiş mikroglialardan lizat, EVler, ve EV içermeyen süpernatantta tRF profilleri belirlendi. Daha sonra, mikroglialardaki tRF'nin mikroglia hücreler üzerindeki etkileri belirlendi. Bu çalışma, mikroglial davranışı yöneten düzenleyici mekanizmaları ve nöroinflamasyona katılımlarını anlamamızı ilerletmeyi amaçlamaktadır.
Özet (Çeviri)
The resident macrophages of brain, microglia, responsible to react to immunological responses and preserve homeostasis in the central nervous system. Microglia play a critical role in neuroinflammation and neurological diseases. Microglial responses has been linked to conditions like metabolic diseases, neurodegenerative diseases, autoimmune diseases, cancer and many more, demonstrating the broad impact on health. Extracellular vesicles (EVs) are small, membrane-enclosed particles released by cells into the extracellular environment. They play crucial roles in intercellular communication by transferring various biomolecules between cells. One of their cargo, transfer RNA-derived fragments (tRFs) have recently emerged as key regulators of gene expression and cellular function in various biological contexts. Understanding the content of tRFs in extracellular vesicles released by LPS induced microglia could offer insights into the communication mechanisms relevant to neuroinflammation and associated pathologies. By examining the tRF content in extracellular vesicles from LPS induced microglia, this study aims to advance our comprehension of the regulatory mechanisms governing microglial behavior and their involvement in neuroinflammation. In this research, I determined tRFs profiles in three different fragments (lysate, EV, and EV-free supernatant) of LPS induced microglia using next generation sequencing. Then, I determined the effects of tRF from LPS induced microglia on microglia cells. this study aims to advance our comprehension of the regulatory mechanisms governing microglial behavior and their involvement in neuroinflammation.
Benzer Tezler
- Hasta örneklerinde medulloblastom alt gruplarının gen ekspresyon paternlerinin qPCR ile belirlenmesi ve sonuçların metilasyon analizi ile karşılaştırılması
Determination of gene expression patterns of medulloblastoma subgroups in patient samples by qPCR and comparison with methylation analysis
AYŞE HÜMEYRA DUR KARASAYAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
PatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMAGÜL KUŞKU ÇABUK
DOÇ. DR. İBRAHİM KULAÇ
- Machine learning assisted force field development for nucleic acids
Nükleik asitler için makine öğrenimi destekli kuvvet alanı geliştirilmesi
GÖZDE İNİŞ DEMİR
Doktora
İngilizce
2024
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilim ve Mühendislik Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ADEM TEKİN
- Ege ve Akdeniz bölgeleri'nden örneklenen Ceratitis capitata (Akdeniz meyve sineği) populasyonlarında genetik çeşitliliğin ND4, tRNA-His ve ND5 genlerinin kısmi baz dizi analizi yardımı ile belirlenmesi
Determination of genetic variation by partially sequencing the mitochondrial ND4, tRNA-His And ND5 genes i̇n ceratitis capitata (Mediterranean fruit fly) populations collcted from Aegean and Mediterranean regions
ELMAS KARAKOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VATAN TAŞKIN
- Ülkemiz zeytin sineği (Bactrocera oleae) popülasyonlarındaki genetik çeşitliliğin sitokrom oxidaz I, II ve tRNA-Leu genlerinin kısmi baz dizi analizi yardımı ile saptanması
Cytochromeoxidase I, II and THE tRNA-Leu gene parti̇al base sequence analysi̇s i̇s help for preli̇mi̇nary determi̇nati̇on of geneti̇c di̇versi̇ty i̇n populati̇ons of oli̇ve frui̇t fly (Bactrocera oleae) of our country's
CEREN NAZ ETİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
GenetikMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VATAN TAŞKIN
- Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi ( Orthoptera, Ttettıgonııdae ) türlerinde total mitokondriyal genom dizileri ve gen yerleşimlerinin belirlenmesi
Determination of total mitogenom sequences and gene location in Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi ( Orthoptera, Tettigoniida )
UĞUR KARŞI