Geri Dön

Konjenital böbrek ve üriner sistem anomalilerinde genetik etiyolojinin araştırılması

Investigation of the genetic etiology of congenital anomalies of the kidney and urinary tract

PDF İndir

  1. Tez No: 902682
  2. Yazar: DURMUŞ DURMAZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AYÇA DİLRUBA ASLANGER, DOÇ. DR. GÜVEN TOKSOY
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Nefroloji, Genetics, Nephrology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 209

Özet

Konjenital böbrek ve üriner sistem anomalileri (CAKUT), üriner sistem gelişiminde görevli gen ve sinyal yolaklarında meydana gelen bozukluklar sonucu oluşan çeşitli yapısal anomalilerdir. Tüm konjenital anomalilerin %20-30'unu oluşturur ve pediatrik popülasyonda son dönem böbrek yetmezliğinin yaklaşık yarısında altta yatan nedendir. CAKUT olgularındaki tüm ekzom dizileme (TED) çalışmalarında genetik tanı oranı %12-20 arasındadır. Bu çalışmada; TED ile CAKUT'un genetik etiyolojisinin araştırılması, ilişkili aday varyant ve yeni genlerin bulunması amaçlanmıştır. Tez çalışması kapsamında, birden fazla CAKUT olgusunun bulunduğu dokuz aileden toplam 24 kişiye TED analizi yapılmıştır. Ailelerden birinde literatürde CAKUT ile ilişkilendirilmiş 9q32 duplikasyonu, üç ailede sırasıyla TFAP2A, CYP26B1 ve ROBO2 genlerinde heterozigot aday varyantlar saptanmıştır. Geriye kalan beş ailede ise anlamlı bir tespit edilememiştir. Değişken ekspresivite, inkomplet penetrans gibi nedenler sonucunda genetik tanı oranının düşük olduğu CAKUT grubunda, olgu sayısının az olmasına rağmen ailelerin %44'ünde aday varyant saptanmıştır. CAKUT için KIF12'yi aday gen olarak bildiren çalışmalar desteklenmiş, 9q32 duplikasyonun CAKUT ilişkisi güçlenmiştir. TFAP2A'da saptanan novel varyant ve ailedeki değişken ekspresivite bulguları literatüre katkı sağlayacaktır. CYP26B1 geninde heterozigot saptanan novel varyant etkilenmiş olgulardaki klinik bulgular ile uyumlu bulunması sonucunda CYP26B1'nin otozomal dominant kalıtım gösteren bir hastalık olduğu desteklenmiştir. Ayrıca uyumlu aile segregasyonu ve retinoik asit yolaklarının böbrek gelişiminde önemli rol oynaması nedeniyle CYP26B1'deki fonksiyon kaybının CAKUT'a neden olabileceği öne sürülmüştür. Son olarak CAKUT ile ilişkilendirilmiş ROBO2'de heterozigot novel bir varyant bildirilmiştir. TED ile CAKUT ilişkili aday varyant ve yeni genlerin keşfi üriner sistem gelişiminin daha detaylı anlaşılmasını sağlayarak tedavi hedeflerine, bireyselleştirilmiş tıbba, organoid çalışmalarına ve gen-çevre etkileşimlerinin bulunmasına katkı sağlayacaktır.

Özet (Çeviri)

Congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT) are various structural anomalies that arise from disorders in the genes and signaling pathways responsible for urinary system development. They account for 20-30% of all congenital anomalies and are the underlying cause of approximately half of end-stage renal failure in the pediatric population. In exome sequencing (ES) studies conducted on CAKUT cases, the genetic diagnosis rate ranges between 12-20%. This study aims to investigate the genetic etiology of CAKUT using ES and to identify associated candidate variants and new genes. In this thesis study, ES analysis was performed on a total of 24 individuals from nine families where multiple cases of CAKUT were present. In one family, a 9q32 duplication previously associated with CAKUT in the literature was detected, and in three families, heterozygous candidate variants in the TFAP2A, CYP26B1, and ROBO2 genes were identified, respectively. In the remaining five families, no significant findings were detected. Despite the low genetic diagnosis rate due to reasons such as variable expressivity and incomplete penetrance in the CAKUT group, candidate variants were identified in 44% of the families, even with the small number of cases. Studies supporting KIF12 as a candidate gene for CAKUT were reinforced, and the association of the 9q32 duplication with CAKUT was strengthened. The novel variant detected in TFAP2A and the findings of variable expressivity in the family will contribute to the literature. The novel heterozygous variant detected in the CYP26B1 gene was found to be consistent with the clinical findings in the affected cases, supporting that CYP26B1 is a disease with autosomal dominant inheritance. Additionally, it was suggested that loss of function in CYP26B1 could cause CAKUT due to its significant role in kidney development and compatible family segregation. Finally, a novel heterozygous variant in ROBO2, previously associated with CAKUT, was reported. The discovery of CAKUT-associated candidate variants and new genes through ES will contribute to a more detailed understanding of urinary system development, providing insights into therapeutic targets, personalized medicine, organoid studies, and gene-environment interactions.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    489901

    CAKUT'' lu (congenıtal anomalıes of kıdney and urınary tract: Doğumsal böbrek ve üriner sistem anomalileri) çocuklarda sınıflandırma, olası risk faktörleri ve aile ağacının değerlendirilmesi

    Classification of CAKUT'(congenital kidney and urinary tract anomalies) and evaluation of possible risk factors and family tree

    ELİF KÖSEOĞLU YILDIRIM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET NEVZAT NAYIR

  2. Tez No

    339747

    Perinatal otopsilerde üriner sistem anomalileri ve eşlik eden böbrek dışı anomaliler

    Urinary system anomalies in perinatal autopsies and associated extrarenal malformations

    ÖMER ERTEKİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    GenetikHacettepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZUHAL AKÇÖREN

  3. Tez No

    719241

    Böbrek ve üriner sistem konjenital anomalisi (CAKUT) tanısı alan hastalarda BCL-2 geni (RS2279115 ve rs4987856) ve LIF geni (rs929271) polimorfizmlerinin sıklıklarının belirlenmesi

    Determination of the frequency of BCL-2 gene (RS2279115 and rs4987856) and lif gene (RS929271) polymorphisms in patients with congenital anomalies of kidney and urinary tract anomaly (CAKUT)

    TUĞÇE ÖZTEPE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikBaşkent Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YUNUS KASIM TERZİ

  4. Tez No

    820948

    Böbrek ve üriner sistem konjenital anomalili hastaların klinik seyrinin değerlendirilmesi; tek merkez deneyimi

    Evaluation of the clinical course of patients with renal and urinary system congenital anomalies; single center experience

    SEVDE DAŞDELEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FUNDA BAŞTUĞ

  5. Tez No

    631376

    Multikistik displastik böbrek tanılı hastaların klinik gidişi ve etkili faktörleri değerlendirmek

    Clinical outlook and evaluation of effective factors of multicystic dysplastic kidney diagnosis patients

    ÇAĞRI TORUN ÖZEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEBAHAT TÜLPAR

Geri Dön