Investigation of the biochemical and cellular properties of an ALS-linked NEK1 variant
ALS ile ilişkili NEK1 varyantının biyokimyasal ve hücresel özelliklerinin araştırılması
- Tez No: 910371
- Danışmanlar: DOÇ. ALİ RİZA UMUT ŞAHİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amyotrofik lateral skleroz (ALS), çeşitli genlerle ilişkilendirilen ve ölümcül nörodejeneratif bir hastalıktır (ND) ve bu genler içinde son zamanlardaki çalışmalarda dikkat çeken NIMA-ilgili kinaz 1 (NEK1) bulunmaktadır. Mevcut araştırma, kırpılmış NEK1 (tNEK1) adını verdiğimiz en yaygın NEK1 mutantlarından birini ve ALS ilerlemesindeki moleküler temelini anlamayı amaçlamaktadır. Daha net olmak olmak gerekirse Daha spesifik olmak gerekirse, bu çalışma ALS ile ilişkili tNEK1'e ve bunun bir post-translasyonel modifikasyon süreci olan SUMOylasyon ile promyelositik lösemi nükleer cisimcikleri (PML NB'ler) arasındaki bağlantısına odaklanmaktadır Laboratuvarımızın ön bulgularından elde edilen bilgilere dayanarak, bu çalışmada daha da doğrulanan agregasyon eğilimine ek olarak, mutant tNEK1'in, yabanıl tip NEK1 formunu agregatlara çektiğini gösterdik. Bu veriler NEK1 haploins yetmezliğinin (haploinsufficency) olası nedenlerinden birini vurgulamaktadır. Ayrıca, tNEK1'in sitotoksisitesi, hücre canlılığını olumsuz yönde etkiler; bu, agregasyon eğilimli tNEK1'in varlığında hücre ölümünün indüklendiğine işaret eder. Şaşırtıcı bir şekilde, SUMO-pozitif tNEK1 agregatlarına ilişkin gözlemimiz bizi, toksik proteinin PML NB'ler-SUMO aracılı proteazomal bozunma yoluyla parçalanmasına olumsuz bir tepki olan NEK1 hiper-SUMOylasyonunu keşfetmeye yönlendirdi. Bulgu, önceki verilerden ve mevcut sonuçlarımızdan elde edilen birleşik sonuçlarla ayrıntılı olarak doğrulanmıştır. PML'yi indükleyen ilaç IFN'nin tNEK1 kaynaklı ALS'yi tedavi etmek için kullanılma olasılığı daha önce gösterilmiş olsa da, etkinliği bu tez kapsamında daha ayrıntılı olarak incelenmiştir. Sonuç olarak, bu tez, tNEK1'in hücresel temeline ilişkin araştırmamızı ve hücre tabanlı sistemlerdeki potansiyel terapötik müdahalesini kapsamaktadır.
Özet (Çeviri)
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder that is associated with various genes, among which NIMA-related kinase 1 (NEK1) has attracted attention in recent studies. Current research aims to comprehend one of the most common mutants, which we named truncated NEK1 (tNEK1), and its molecular basis in the context of ALS progression. To be more precise, this study focuses on ALS-related tNEK1 and its link between the post-translational modification process SUMOylation and promyelocytic leukemia nuclear bodies (PML NBs). Building upon the insight gained from the preliminary findings of our lab, we illustrated that in addition to its tendency to aggregate, which is further verified in this study, the mutant tNEK1 recruits a wild-type form of NEK1 to the aggregates. This data highlights one of the potential reasons for NEK1 haploinsufficiency. Furthermore, the cytotoxicity of tNEK1 negatively influences cell viability, implying cell death induction in the presence of aggregation-prone tNEK1. Surprisingly, our observation of SUMO-positive tNEK1 aggregates directed us to discover NEK1 hyper-SUMOylation, an adverse response to degrade toxic protein by PML NBs-SUMO mediated proteasomal degradation. The finding is confirmed in detail by the combined results from previous data and our current results. Even though the possibility of using the PML-inducing drug IFN to treat tNEK1-driven ALS was previously demonstrated, its effectiveness was further examined within this thesis. To summarize, this thesis covers our investigation of the cellular basis of tNEK1 and its potential therapeutic intervention in cell-based systems.
Benzer Tezler
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- Kuyruk modelleri ve analizi üzerine bir uygulama
Başlık çevirisi yok
DİDEM ÖZPULAT
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İstatistikEge ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİKRET İKİZ
- Samsun ve çevresinde tarla sarmaşığı (conuolvulus arvensis L.)'na karşı biyolojik savaşa esas olacak fauna tespiti
Investigations on the insect fauna of the field binweed (Conuolvulus arvensis L.) related to its biological control in Samsun Province
YASEMİN UFUK GERMAN
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Bromtimol mavisi, bromkresol moru ve klorfenol kırmızısı indikatörleri katılmış özel besiyerlerinin sütlerde antibiyotik belirtilmesine uygunluğu üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ESENGÜL TUNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN YAYGIN