Kullanıma hazır izotermal tanı kitlerinin Plum pox virus (PPV) tanısındaki performansları
Performance of ready-to-use isothermal detection kits in Plum pox virus (PPV) detection
- Tez No: 917518
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ ÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sert çekirdeklilerin en önemli hastalıklarından birisi olan Plum pox virus (PPV), 1917 yılında yapılan ilk tespitinden bu yana dünyada bir çok araştırmaya konu olmuştur. Bu çalışmada DOSA Bilgi ve Bilişim Teknolojileri Ltd. Şti. tarafından PPV'nin izotermal koşullar altında tanısı için geliştirilen kolorimetrik ve gerçek zamanlı tanı kitlerinin PPV tespitindeki performansları araştırılmıştır. Yerli olanaklar ile geliştirilen ve bu çalışmaya konu olan izotermal tanı kitleri bünyelerinde özel primer setlerini de içermenin verdiği bir avantaj ile direkt enfekteli bitki RNA'sının reaksiyona alınmasına olanak sağlamaktadır. Ayrıca bu çalışmada kullanılan izotermal tanı kitleri PPV için 65 °C sıcaklık ve 60 dk süre ile başarılı bir amplifikasyona olanak sağlarken, çapraz testlerde kullanılan potansiyel konukçu genomlarında ve ortak enfeksiyon sergileyebilen virüsler ile etkileşim sergilememiştir. Araştırmaya konu edinilen kolorimetrik ve gerçek zamanlı tanı kitlerinin sırasıyla [10-4 ve 10-5 ng/µL] PPV RNA'sı tespit hassasiyeti yakalayarak bu hususta istenen değerlere ulaştığı değerlendirilmektedir. Performansları araştırılan izotermal tanı kitleri Türkiye'de yaygın olarak bulunan PPV-M, D ve T ırkları için başarılı bir amplifikasyona olanak tanımıştır. Bu kitlerin, özellikle düşük laboratuvar donanımına sahip alanlarda ve saha koşullarında uygulanması teşvik edilmelidir. Başarıyla geliştirilen ve optimize edilen bu izotermal tanı platformunun, diğer önemli bitki virüslerinin tespitine uyarlanması, Türkiye ve benzeri tarım bölgelerinde viral hastalıkların kontrolü için stratejik bir avantaj sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Plum pox virus (PPV), one of the most significant diseases affecting stone fruit trees, has been extensively studied worldwide since its initial detection in 1917, with various diagnostic approaches explored. This study investigates the performance of colorimetric and real-time diagnostic kits developed by DOSA Information and Communication Technologies Ltd. for detecting PPV under isothermal conditions. These isothermal diagnostic kits, developed and optimized with domestic resources, stand out as highly practical diagnostic tools, leveraging an advantage of containing proprietary primer sets that enable direct testing of RNA from infected plants, independent of existing isothermal methods. In this study, the isothermal diagnostic kits enabled successful amplification of PPV at 65°C within 60 minutes, without cross-reaction with potential host genomes or other viruses that could co-infect. The colorimetric and real-time diagnostic kits demonstrated detection sensitivities of [10-4 and 10-5 ng/µL] of PPV RNA, respectively, meeting the desired standards for PPV detection. These kits also facilitated effective amplification of PPV-M, D, and T strains, commonly found in Turkey. The application of these kits, especially in field settings and areas with limited laboratory infrastructure, should be encouraged. This successfully developed and optimized isothermal diagnostic platform could also be adapted for the detection of other significant plant viruses, offering a strategic advantage in managing viral diseases in agricultural regions such as Türkiye.
Benzer Tezler
- Yıkama suyu filtre kalıntı malzemesinin harç özelliklerine etkisi
Effects of washwater filter residue material on properties of mortars
ADİL GÖRKEM GEDİK
- Investigation of gasification characteristics of Soma lignite by high pressure TGA
Soma linyitinin gazlaştırma özelliklerinin yüksek basınçlı TGA ile incelenmesi
GÖZDE KARDEŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
İstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Investigating the oxidation and high temperature wear behaviour of hot-dip aluminized and diffusion annealed inconel 718 superalloy
Sıcak daldırma alüminyum kaplama ve difüzyon tavlaması uygulanmış ınconel 718 süperalaşımının oksidasyon ve yüksek sıcaklık aşınma davranışının incelenmesi
AHMET KAVUKCU
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
İstanbul Teknik ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Thermal and mechanical performance of cementitious PCM composites
Çimentolu FDM kompozitlerinin ısıl ve mekanik performansları
ERMAN YİĞİT TUNCEL
