Geri Dön

Manda orijinli enterococcus faecium izolatlarının genotip, antibiyotip ve bazı virulens genleri açısından incelenmesi

Examination of antibiotype, genotype, and some virulencegenes for buffalo origin enterococcus faecium isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 923563
  2. Yazar: GÖZDE KILINÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TİMUR GÜLHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 44

Özet

Antibiyotik dirençliliği, gram pozitif ve gram negatif bakteriler tarafından sebep olunan bakteriyel hastalıkların tedavi edilmesini zorlaştıran küresel bir problem haline gelmiştir. Fırsatçı patojenler olarak bilinen Enterokokların son zamanlarda artan bir düzeyde çoklu antibiyotik direnci gösterdiği gözlenmektedir. Çiftlik hayvanlarında antibiyotiklerin yoğun bir şekilde kullanılması sebebiyle direnç genleri ve paternlerinin düzenli bir şekilde izlenmesi gerektirmektedir. Bu tez çalışmasında, Anadolu Mandalarından (Bubalus bubalis) izole edilmiş ve fenotipik olarak karakterize edilmiş olan Enterococcus faecium izolatlarının PCR ile moleküler karakterizasyonu yapıldı. Bu amaçla, OMÜ Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı kültür koleksiyonunda bulunan 48 E. faecium izolatının ampisilin, eritromisin, gentamisin, kanamisin, kloramfenikol, streptomisin, tetrasiklin ve vankomisin olmak üzere 8 antibiyotiğe karşı fenotipik olarak in vitro dirençlilikleri, bu antibiyotiklere ait bazı direnç genleri [bla(z), ermB, aac(6')-aph(2'), aphA-3, catpIP, ant(6)la, vanA, vanB, tetM ve tetL], bazı virulens genleri (esp, gelE, cylA, cylB, agg, hyl ve asa1), biyofilm oluşturma yetenekleri araştırıldı. Ayrıca izolatların antibiyotiplendirme ve genotiplendirme işlemleri gerçekleştirildi. İzolatların virulens genleri bakımından sadece gelE (8'inde) ve hyl (1'inde) genlerinde pozitiflik görüldü. Antibiyotik direnç genleri bakımından aphA-3 (11'inde), tetL (1'inde), tetM (3'ünde) geni ve ermB (3'ünde) genlerinde pozitiflik oldu. Bir izolatın bu 4 genin tamamına sahip olduğu tespit edildi. Elde edilen bulgulara göre, 48 adet izolatın 47 (%97.92), 46 (%95.83), 45 (%93.75), 43 (%89.58), 40 (%83.33), 39 (%81.25), 35 (%72.92) ve 24'ü (%50) sırasıyla kanamisin, streptomisin, ampisilin, gentamisin, kloramfenikol, tetrasiklin, eritromisin ve vankomisin'e dirençli oldu. Araştırılan 48 adet izolatın 47'si (%97.92) biyofilm oluşturma özelliği açısından pozitif olarak değerlendirildi. İzolatların fenotipik yakınlıklarının kantitatif olarak değerlendirildiği filogenetik analiz sonucuna göre %54-100 arasında benzerlik belirlendi. Antibiyotiplendirme amacıyla %75 benzerlik eşik değeri dikkate alındığında 5 çoklu fenotip tespit edildi. Dendrogram değerlendirmesine göre E. faecium izolatlarının %23-100 arasında benzerlik gösterdiği belirlendi. Genotiplendirmede, 16 adet tekli ve 9 adet çoklu genotip belirlendi. Sonuç olarak, mandaların çeşitli antibiyotiklere dirençli E. faecium izolatlarını taşıdıkları ve dışkılarıyla kontaminasyonlara sebep olarak risk oluşturabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Antibiotic resistance has become a global problem that complicates the treatment of bacterial diseases caused by gram-positive and gram-negative bacteria. Enterococci, known as opportunistic pathogens, have recently exhibited increased levels of multiple antibiotic resistance. Due to the intensive use of antibiotics in farm animals, resistance genes and patterns require regular monitoring. In this thesis study, molecular characterization of Enterococcus faecium isolates isolated from Anatolian Buffaloes (Bubalus bubalis) and phenotypically characterized was performed by PCR. For this purpose, the phenotypic in vitro resistance of 48 E. faecium isolates found in the culture collection of the Department of Microbiology of the Faculty of Veterinary Medicine of OMU to 8 antibiotics, namely ampicillin, erythromycin, gentamicin, kanamycin, chloramphenicol, streptomycin, tetracycline and vancomycin, some resistance genes of these antibiotics [bla(z), ermB, aac(6')-aph(2'), aphA-3, catpIP, ant(6)la, vanA, vanB, tetM, and tetL], some virulence genes (esp, gelE, cylA, cylB, agg, hyl, and asa1), biofilm formation, antibiotic, and genotyping were evaluated. In terms of virulence genes of the isolates, only gelE (8) and hyl (1) genes were positive. In terms of antibiotic resistance genes, aphA-3 (11), tetL (1), tetM (3) genes, and ermB (3) genes were positive. It was determined that one isolate had all of these 4 genes. According to the findings, 47 (97.92%), 46 (95.83%), 45 (93.75%), 43 (89.58%), 40 (83.33%), 39 (81.25%), 35 (72.92%) and 24 (50%) of the 48 isolates were resistant to kanamycin, streptomycin, ampicillin, gentamicin, chloramphenicol, tetracycline, erythromycin, and vancomycin, respectively. 47 (97.92%) of the 48 isolates investigated were evaluated as positive in terms of biofilm formation ability. According to the result of phylogenetic analysis, in which the phenotypic closeness of the isolates was evaluated quantitatively, a similarity between 54-100% was determined. Considering the threshold value of 70% similarity for antibiotic typing, 5 multiple phenotypes were identified. According to the dendrogram evaluation, it was determined that E. faecium isolates showed 23-100% similarity. In genotyping, 16 single and 9 multiple genotypes were identified. As a result, it is thought that buffalos carry E. faecium isolates that are resistant to various antibiotics and may pose a risk by causing contamination with their feces.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    744066

    Manda süt ve süt ürünlerinde vankomisine dirençli enterococcus faecalis ve enterococcus faecium türleri ile izolatlarda direnç profilinin genotipik olarak belirlenmesi

    Vancomycin-resistant enterococcus faecalis and enterococcus faecium species in buffalo milk and dairy products and genotypical determination of resistance profile in isolates

    SERAY DÜZTAŞLAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Veteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı

    DOÇ. DR. ALİ GÜCÜKOĞLU

  2. Tez No

    848097

    Mastitisli anadolu mandaları ve süt ineklerinden Candida türlerinin izolasyonu, moleküler tiplendirilmesi, virülens faktörleri ve antifungal dirençliliklerinin araştırılması

    Isolation, molecular typing, detection of virulence factors and antifungal resistance of Candida species from anatolian buffaloes and dairy cows with mastitis

    OĞUZ KAĞAN TÜREDİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Veteriner HekimliğiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESRA ŞEKER

  3. Tez No

    463558

    Immunomodulatory activities of RNA species derived from commensal and pathogenic bacteria

    Kommensal ve patojen bakterilerden elde edilen RNA türlerinin immünomodülatör aktiviteleri

    BAŞAK KAYAOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Allerji ve İmmünolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAYDA GÜRSEL

  4. Tez No

    183569

    Türkiye'de yetişen arpa çeşitlerinde genetik çeşitliliğin ISSR basit dizilim tekrarları moleküler markör tekniği ile saptanması

    Determining of genetic diversity of barley varieties grown in Turkey using ISSR (inter simple sequence repeat) marker technique

    DENİZ YALIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAKAN ÖZKAN

  5. Tez No

    327584

    Azerbaycan Dilinin Sinonimler Lügati adlı sözlüğün Kiril harflerinden Latin harflerine aktarılarak Türkiye Türkçesine çevirisinin yapılması

    To translate Turkey Turkish of Azerbaijan Language Synonym Dictionary named dictionary, by transfering from Cyrilli'c letters to Latin alphabet

    ESRA ÇAKIROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Türk Dili ve EdebiyatıNevşehir Üniversitesi

    Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İBRAHİM ETHEM ÖZKAN

Geri Dön