SOCS1 gene methylation and relative expression analysis in patients with Bechet syndrome
Behçet Sendromu'na sahip hastalarda SOCS1 gen metilasyonu ve ilgili ekspresyon analizi
- Tez No: 935990
- Danışmanlar: PROF. DR. ZOHREH BABALOO
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Allerji ve İmmünoloji, Moleküler Tıp, Genetics, Allergy and Immunology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: DNA metilasyonu, Behçet hastalığı, SOCS1 geni, qMS-PCR, DNA methylation, Behest's disease, SOCS1 gene, qMS-PCR
- Yıl: 2018
- Dil: Farsça
- Üniversite: Tabrız Unıversıty Of Medıcal Scıences
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: İmmünoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: İmmünoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Giriş: Epigenetik, orijinal DNA dizisinden bağımsız olarak mitoz ve mayozda miras alınan gen ifadesi desenindeki değişikliklere atıfta bulunur. SOCS1 hiper-metilasyonu, JAK / STAT sinyal yolunu aktive edebilir ve bu yolun aktivasyonu, farklı sitokinlerin hücre fonksiyonu üzerindeki etkisini doğrudan etkileyebilir ve ardından hastalıkların patofizyolojisine yol açabilir. Özellikle sitokin miktarıyla doğrudan etkileşime giren otoimmün hastalıklar gibi dışsal sitokinlerin neden ve patolojisi tam olarak belirlenmemiş olan Behçet sendromu (beh-CHETS) hastalığıyla ilgili olarak; bu çalışmanın amacı Behçet hastalığı olan hastalarda SOCS1 geni metilasyon desenini belirlemek ve bunları kontrol grubuyla karşılaştırmaktır. Metodoloji: Bu çalışma, Behçet hastalığı olan 50 hasta ve kontrol grubu olarak 60 bireyin katıldığı bir vaka-kontrol çalışmasıydı. Tüm katılımcılardan kan örnekleri alındı. Ardından, DNA'nın Saltaion out yöntemiyle ekstraksiyonu ve Nano-drop ile analizi yapıldıktan sonra Ficoll yöntemiyle PBMC hücreleri (Tek Hücre RNA Dizileme için Periferik Kan Mononükleer Hücreler) izole edildi ve düşünülen bölgelerin metilasyonu qMS-PCR tekniği kullanılarak araştırıldı. Sonuçlar: Metilasyon miktarı ve gen ekspresyonuyla ilgili bulgular, hasta grubunda metilasyon düzeyinin sağlıklı bireylerle (kontrol grubu) karşılaştırıldığında arttığını gösterdi ve bu artış istatistiksel olarak anlamlıydı (p değeri <0.05). Ayrıca, gen ekspresyonuyla ilgili sonuçlar, hasta grubundaki ortalama gen ekspresyonunun sağlıklı bireylerle (kontrol grubu) karşılaştırıldığında azaldığını ve bu azalışın istatistiksel olarak anlamlı olduğunu gösterdi (p değeri <0.05). Tartışma ve sonuç: Bu hastalığın sonuçlarına göre, DNA metilasyonunun bu hastalığın belirli durumlarında rol oynaması ve hastalığın patogenezine dahil olan genlerin ekspresyonunun düzenlenmesine neden olabileceği düşünülebilir.
Özet (Çeviri)
Abstract: Introduction: Epigenetics refers to inherited changes in mitosis and meiosis in the gene expression pattern which is independent of the original DNA sequence. Since SOCS1 hyper-methylation can activate JAK / STAT signaling pathway and activation of this pathway can directly affect the impact of different cytokines on cell function and subsequently lead to pathophysiology of diseases, in particular autoimmune diseases that interact directly with the amount of cytokines due to the fact that the cause and pathology of Behcet's disease (beh-CHETS) have not ever been completely determined; the purpose of the present study was to determine the methylation pattern of SOCS1 gene in patients with Behcet's disease and compare them with control group. Methodology:This study was a case-control study in which 50 patients with Behcet's disease and 60 individuals as control group participated.Blood samples were collected from all participants. ThenPBMC cells (Peripheral Blood Mononuclear Cells for Single Cell RNA Sequencing)were isolated through Ficoll method andmethylation of considered sites was investigated using qMS-PCR technique after extraction of DNA by Saltaion out method and its analysis with Nano-drop. Results: Findings about the amount of methylation and gene expression showed that the methylation level in the patient group was increased in comparison with healthy subjects (control group) which the increase was statistically significant (p-value<0.05). Also, the results related to gene expression revealed that the mean gene expression in the patient group was decreased in comparison with healthy subjects (control group) which the decrease was statistically significant (p-value<0.05). Discussion and conclusion: According to the results of this disease, it can be guessed that DNA methylation may be involved in certain conditions of this disease and lead to the regulation of expression of genes involved in pathogenesis of the disease.
Benzer Tezler
- Lise öğrencilerinin stres yaşantılarında kullandıkları başaçıkma stratejilerinin bazı değişkenler açısından incelenmesi
Başlık çevirisi yok
FERDA AYSAN
Doktora
Türkçe
1988
PsikolojiHacettepe ÜniversitesiPsikolojik Danışma ve Rehberlik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İ. ETHEM ÖZGÜVEN
- Hepatosit büyüme faktörü ile stimule edilen motilite, ivazyon ve anjiogeneze yol açan sinyal iletimi molekülleri ve genlerin faj sunum yöntemi ile araştırılması
Başlık çevirisi yok
GÜLAY BULUT
Doktora
Türkçe
2005
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE ATABEY
- Hepatosit büyüme faktörü ile stimule edilen motilite, infazyon ve anjiogeneze yol açan sinyal iletimi molekülleri ve genlerinin faj sunum yöntemi ile araştırılması
Identification of signaling molecules and genes leading to HGF stimulated motility, invasion and angiogenesis by phage display
GÜLAY BULUT
Doktora
Türkçe
2005
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NEŞE ATABEY
- Kronik myeloid lösemi (KML) hastalarında, SOCS-1 gen metillenmesinin araştırılması
Detection of SOCS-1 gene methylation in chronic myeloid leukemia (CML) patients
ÖZDEN HATIRNAZ