DDIT4 gen ekspresyonunun kolorektal kanserde prognostik ve terapötik öneminin aydınlatılması
Elucidating the prognostic and therapeutic significance of DDIT4 gene expression in colorectal cancer
- Tez No: 942111
- Danışmanlar: PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ SEVGİLİ, ÖĞR. GÖR. NEVİN BELDER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 138
Özet
DNA damage-inducible transcript 4 (DDIT4), kanserlerin patogenezinde kritik süreçlerde rol oynayan önemli bir biyobelirteç adayı moleküdür. Ancak, DDIT4'ün kolorektal kanser (KRK) patogenezindeki rolü ve klinik potansiyeli yeterli incelenmemiştir. Bu doğrultuda tez çalışmasında, DDIT4'ün KRK'deki ifade düzeyleri ve klinik-moleküler parametrelerle ilişkisi değerlendirilerek, genin diyagnostik, prognostik ve terapötik potansiyelinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, biyoinformatik analizlerle TCGA ve GEO KRK veri setlerinde DDIT4 ifadesi tümör ve kontrol dokularında karşılaştırılmış; klinikopatolojik özellikler ve sağkalım sonuçlarıyla ilişkisi incelenmiş ve ayrca polip-adenokarsinommetastaz aksisinde ifade paterni analiz edilmiştir. Potansiyel mekanizmalar koekspresyon, GSEA ve gen-protein etkileşim analizleriyle değerlendirilmiştir. DDIT4 ifadesi toplanan tümör ve eşli normal dokularda (n=60) ve KRK hücre hatlarında qRT-PCR ve western blot ile doğrulanmış; lokalizasyon ilişkisi bağımsız bir KRK kohortu FFPE örneklerinde (n=126) retrospektif olarak analiz edilmiştir. Bulgularımız, on beş farklı KRK transkriptom analizinde DDIT4 ifadesinin yüksek olduğunu (p
Özet (Çeviri)
DNA damage-inducible transcript 4 (DDIT4) is an important biomarker involved in critical processes in cancer pathogenesis. However, its role and clinical potential in colorectal cancer (CRC) pathogenesis remain insufficiently explored. This study aims to investigate the expression levels of DDIT4 in CRC and its association with clinical-molecular parameters, evaluating its diagnostic, prognostic, and therapeutic potential. Bioinformatics analyses were performed on TCGA and GEO CRC datasets, comparing DDIT4 expression in tumor and control tissues, and examining its correlation with clinicopathological features and survival outcomes. Additionally, expression patterns were analyzed along the polyp-adenocarcinoma-metastasis axis. Potential mechanisms were assessed using co-expression, GSEA, and gene-protein interaction analyses. DDIT4 expression was validated in collected tumor and matched normal tissues (n=60) and CRC cell lines using qRT-PCR and western blot, with its localization relationship analyzed retrospectively in an independent CRC cohort of FFPE samples (n=126). Our findings revealed that DDIT4 expression was significantly higher in 15 different CRC transcriptome analyses (p
Benzer Tezler
- Rektum kanserinde memeli rapamisin hedefi protein yolağı gen profilinin çıkarılması
Removal of mammalian rapamycin target protein pathway gene profile in rectum cancer
PELİN YONAR KAPLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyofizikMarmara ÜniversitesiBiyofizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PINAR MEGA TİBER
- Linagliptinin insülin ile kombine tedavisinin tip 1 diyabetik fare ovaryumundaki katlanmamış protein cevabına olan etkisinin değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
ASLI OKAN OFLAMAZ
Doktora
Türkçe
2021
Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NECDET DEMİR
- Gaziantep Mevlevihanesi Vakıf Müzesi'nde bulunan halıların tahlilleri
The analysis of rugs in The Gazi̇antep Mevlevi̇hane foundation Museum
MİTHAT İZCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
El SanatlarıAtatürk ÜniversitesiGeleneksel Türk El Sanatları Ana Sanat Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ASLİHAN EROĞLU
- Performans metni olarak Sevgi Soysal'ın Tutkulu Perçem öyküleri
Sevgi Soysal's short stories in Passionate Fringe as texts of performance
DUYGU KANKAYTSIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Sahne ve Görüntü SanatlarıDokuz Eylül ÜniversitesiSahne Sanatları Ana Sanat Dalı
PROF. DR. SEMİH ÇELENK
- Соvid-19 pаndеmi sürесinin turizm sеktörünе еtkisi: BİST sеktörlеri ilе kаrşılаştırmаlı bir inсеlеmе
Thе еffесt оf thе Cоvid-19 pаndеmiс prосеss оn thе tоurism sесtоr: A соmpаrаtivе rеviеw with BIST sесtоrs
JEYHUN YUSIF
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
İşletmeİstanbul Aydın Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE DEMİRKALE