Investigating the significance of α-interface hot spots on K-Ras homodimer formation
Α- arayüzdeki kritik noktaların K-Ras homodımer oluşumundaki önemin incelenmesi
- Tez No: 959425
- Danışmanlar: PROF. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON, DR. ÖĞR. ÜYESİ ORKUN CEVHEROĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 141
Özet
Küçük GTP bağlayan protein ailesinde bulunan K-Ras proteini, hücre büyümesi ve farklılaşmasında rol alan önemli moleküllerden biridir. K-Ras proteini dış ortamdan alınan sinyallerin hücre çekirdeğine iletilmesinde rol oynar. KRAS geni, insan kanser türlerinde en sık mutyasyona uğrayan genlerden (onkogen) biridir. Mutasyona uğraması durumunda hücre agresif bir büyüme gerçekleştirir. Son yıllarda K-Ras proteininin kendisiyle ve diğer proteinlerle etkileşimde bulunabildiği gösterilmiştir. Yapılan çalışmalar, K-Ras proteininin homodimer (K-Ras - K-Ras) oluşturabildiğini ve bu dimer yapısının K-Ras aktivasyonu ve sinyal yolağı üzerinde etkili olabildiğini göstermiştir. K-Ras proteininin homodimer oluşturabilmesi için özellikle alfa-arayüzünün etkili olduğu ve bu arayüzde belirli pozisyonlarda bulunan amino asitlerin tuz köprüsü oluşturarak K-Ras homodimer yapısına katkı sağlayabileceği söylenmiştir. Ancak, K-Ras homodimerleşmesinde kritik bir rolü olduğu düşünülen bu amino asitlerin K-Ras homodimer oluşumundaki etkisi henüz gösterilmemiştir. Bu çalışmada, K-Ras alfa-arayüzünde bulunan bu amino asitlerin, K-Ras homodimer yapısındaki etkisi canlı hücrelerde FRET yöntemi kullanılarak gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
K-Ras protein, found in the GTPase-binding protein family, is one of the key molecules involved in cell growth and differentiation. It plays a role in transmitting signals from the external environment to the cell nucleus. The KRAS gene is one of the most frequently mutated genes (oncogenes) in human cancers. When mutated, cell undergoes aggressive growth. In recent years, it has been shown that the K-Ras protein can interact with itself and other proteins. Studies have demonstrated that the K-Ras protein can form homo-dimers(K-Ras - K-Ras) and that this dimer structure can affect K-Ras activation and signalling pathways. It has been suggested that alpha-interface of K-Ras protein is particularly important for the formation of homodimers, and specific amino acids at certain positions (hot spots) in this interface can contribute to K-Ras homodimer formation by forming salt bridges. However, the effect of these amino acids which are thought to play a critical role in K-Ras homodimerization has not yet been demonstrated. In this study, the effect of these specific amino acids, located in the K-Ras alpha-interface, on K-Ras homodimer structure was shown using FRET method in live cells.
Benzer Tezler
- Investigation of structural and functional properties of the betaine transporter BetP from Corynebacterium glutamicum by using infrared spectroscopy
Başlık çevirisi yok
GÜNNUR GÜLER
Doktora
İngilizce
2013
Fizik ve Fizik MühendisliğiJohann-Wolfgang-Goethe-UniversitätPROF. DR. WERNER MANTELE
- AISI D2 soğuk iş takım çeliklerinin darbeli kayma aşınma davranışına mikroyapının etkisi
The effect of microstructure on impact sliding wear behavior of AISI D2 cold work tool steels
HALİL İBRAHİM FİLİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT BAYDOĞAN
- Katodik ark fbb yöntemi kullanılarak çelik yüzeylerin alüminyumlanması
Aluminising of steel surfaces by using cathodic arc pvdmethod
TUĞBA ÇELİKEL
Doktora
Türkçe
2020
Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA KAMİL ÜRGEN
- Grafen oksit katkılı polimer nanokompozitlerin çeşitliözelliklerinin incelenmesi
Investigating various properties of graphene oxide doped polymer nanocomposites
OĞUZKAN ŞENTÜRK
Doktora
Türkçe
2024
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İBRAHİM MEHMET PALABIYIK
- Gaz atomizasyon yöntemi ile AZ91 tozu üretimi ve karakterizasyonu
AZ91 powder production and characterization by gas atomization method
MEHMET AKKAŞ
Doktora
Türkçe
2017
Metalurji MühendisliğiKarabük Üniversitesiİmalat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA BOZ