Geri Dön

Yatay akış sistemlerinde sayısal veri analizi

Digital data analysis in lateral flow assays

PDF İndir

  1. Tez No: 976776
  2. Yazar: BEGÜM KÜBRA TOKYAY
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE GÜL GÜREK, DOÇ. DR. SELMA ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Biyoloji, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kimyasal, Biyolojik, Radyolojik, Nükleer (KBRN) yapılı pek çok madde, toprak, hava ve su gibi çevresel ortamlara yayılarak dolaylı etkileşimlerle veya direkt olarak insan ve diğer canlılar üzerinde olumsuz etkiler sağlayarak hayati tehlike oluşturabilmektedir. KBRN ajanlarının ve sebep olduğu etkilerin tanısında, hastane veya donanımlı laboratuvarlar güvenle kullanılsa da, basit ve hızlı sistemler tercih edilmektedir. Yerinde tespitte var/yok şeklinde sonuç sağlanan sistemler ile tehdit miktarı belirlenememekte, bu durum ajanların risk değerlerinin belirlenmesinde ve uygulanacak tedavi şeklinde sorun oluşturabilmektedir. 2020 yılında dünyada yaşanan pandemi ile hızlı ve erken teşhisin önemi bir kez daha ortaya koyulmuş, buna paralel olarak hızlı test sistemlerinden ölçülebilir sonuçlar sağlanmasının önemi de artmıştır. Yatay Akış Testleri (YAT), yerinde tespit özelliği, kullanım kolaylığı, yüksek hassasiyetine ilaveten elde edilen görüntünün şiddetinden bir okuyucu yardımıyla miktar analizi yapılması bu sistemlerin tercih edilebilirliğini arttırmıştır. Tez çalışması kapsamında; özellikle içme sularında tehdit oluşturabilecek E. coli O157:H7 patojenine karşı, aynı projede geliştirilen YAT'tan elde edilen görsel verinin değerlendirilmesine yönelik sayısal veri analiz yöntemleri geliştirildi. YAT görüntüleri, yine aynı proje kapsamında geliştirilmiş olan Suda Mobil Biyolojik Ajan Tespit cihazı (SUMBAT) ve Bio-Rad ChemiDoc XRS+ ile analiz edildi. YAT bantlarında değişen optik özellikler, ImageJ programında SUMBAT cihazından elde edilen görüntülerin piksel analizleri ve ImageLab programında ChemiDoc cihazından alınan görüntülerin bant yoğunlukları analiz edildi. Her iki yöntemde Minimum Tespit Limitinin (LOD) sağlanması amacıyla ilerletilen çalışmada, göz ile tespit edilemeyen pozitif bantların şiddeti belirlendi. İlerleyen çalışmalarda SUMBAT cihazının sahada kullanımına yönelik algoritmanın tamamlanması ve yerinde kantitatif YAT sistemlerinin oluşturulması için bir altyapı oluşturuldu.

Özet (Çeviri)

Chemical, Biological, Radiological, Nuclear (CBRN) substances or material can be life-threatening by spreading to environmental surroundings such as soil, air and water, by indirect interactions or by directly providing adverse effects on humans, and other living things. Although hospitals or equipped laboratories are used safely in the diagnosis of CBRN agents and their effects, simple and fast systems are generally preferred. With the systems providing Yes / No results in on-site detection, the amount of threat cannot be determined, and this may cause problems in determining the risk values of the agents and the treatment to be applied. With the pandemic in the world in 2020, the importance of rapid and early diagnosis has once again been demonstrated, and in parallel, the importance of providing measurable results from rapid test systems has increased. Lateral Flow Tests (LFA) are preferred systems because of their on-site detection feature, ease of use, high sensitivity and the amount of the obtained image with the help of a reader. Within the scope of thesis work: Numerical data analysis methods were developed for evaluating the visual data obtained from the LFA developed in the same project against E. coli O157: H7 pathogen, which may pose a threat especially in drinking water. Within the scope of the Project, developed against E. coli O157: H7, the LFA was created that detects and identifies this bacterium, and images varying according to the amount of E. coli O157: H7 in different concentrations were analyzed with Bio-Rad ChemiDoc XRS+ and SUMBAT, which was also developed within the scope of the same project. Changing optical properties in LFA bands, pixel analysis of images obtained from SUMBAT device in ImageJ program and band intensities of images taken from ChemiDoc device in ImageLab program were analyzed. In the study, which was carried out in order to achieve the minimum detection limit in both methods, positive bands that could not be detected by eye were determined. With this thesis, an infrastructure was created to complete the algorithm for the use of SUMBAT device in the field and to create quantitative LFA systems on site.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    1010323

    Detection and evaluation of sudden stratospheric warming : A case study of water vapor transport

    Stratosferik ani ısınmaların tespiti ve değerlendirilmesi: Su buharı taşınımı örnek olay incelemesi

    SİMLA DURMUŞ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2026

    Meteorolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Meteoroloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DENİZ DEMİRHAN

  2. Tez No

    1020271

    Development of a modular modeling tool for gas turbine steady state performance predictions

    Gaz türbinleri durağan hal performans tahminleri için modüler modelleme aracının geliştirilmesi

    MEHMET YAŞAR TEKİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2026

    Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERTAÇ ÇADIRCI

  3. Tez No

    921997

    Estimation of position and orientation with visual odometry for ground vehicles

    Kara araçları için görsel odometri yöntemi ile pozisyon ve duruş tahmini

    BURAK ALİ ARSLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kontrol ve Otomasyon Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRET ÇALIŞKAN

  4. Tez No

    142705

    Computational analysis of external store carriage in transonic speed regime

    Harici yük taşımanın transonik sürat bölgesinde hesaplamalı analizi

    İ. CENKER ASLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Havacılık ve Uzay Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Uçak Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYDIN MISIRLIOĞLU

    PROF. DR. OKTAY BAYSAL

  5. Tez No

    545908

    Mekansal-zamansal hasta hareketlilik verileriyle mekansal etkileşim örüntülerinin analizi ve akış haritaları aracı tasarımı ve geliştirilmesi

    Analysis of spatial interaction patterns using spatio temporal patient mobility data, and designing and developing a flow mapping tool

    SELMAN DELİL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Coğrafyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Bilişim Uygulamaları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RAHMİ NURHAN ÇELİK

Geri Dön