Meme kanseri hücre hatlarında uzun kodlanmayan RNA (lncrna) cytor'un metastaz ve hippo sinyal yolaklarının moleküler mekanizmalarına olası etkilerinin araştırılması
Investigation of the possible effects of long non-coding RNA (lncrna) cytor on the molecular mechanisms of metastasis and hippo signal pathways in breast cancer cell lines
- Tez No: 983446
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMEL ERGENE, DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMA YILDIZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Biology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Kodlamayan RNA, Non-coding RNA
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Meme kanseri dünya çapında kadınlar arasında en yüksek insidansa sahip olan kanserlerden biridir. Metastaz oluşumu meme kanseri hastalarında en önemli mortalite nedenlerindendir. Bu çalışmada, kadınlar arasında en yaygın malignite olan ve moleküler alt tipi heterojenliği gösteren meme meme kanseri hücre hatlarında "Uzun Kodlanmayan RNA'lardan (LncRNA) CYTOR ifadesinin siRNA'larla baskılanmasının ardından hücre canlılığı, apoptoz ve metastaz süreçlerindeki moleküler mekanizmalar üzerine olan etkileri araştırıldı. CYTOR'un MDA-MB-231 ve HCC1428 (sisplatin dirençli insan meme bezi epitelyum IV. evre adenokarsinoma) hücreleri üzerindeki farklı dozlarının 24 ve 48 saat süre sonundaki hücre çoğalması üzerindeki baskılayıcı etkileri 3-(4,5- Dimetiltriazol-2-il)-2,5 difeniltetrazolium bromid (MTT) yöntemi ile belirlendi. Ayrıca apoptotik (Bax, Bcl-2) ve metastatik süreçteki genler (YAP1, MST1, LATS1, CTGF, ECAD, NCAD) üzerine olan etkisi RT-PCR yöntemi kullanılarak belirlendi. Çalışma sonucun da MDA-MB-231 ve HCC1428 hücre hatlarında CYTOR geninin ifade düzeyleri tespit edildi. Ardından negatif kontrol siRNA içeren grup ile karşılaştırıldığında MDA-MB-231 hücreleri için 5 nM siCYTOR-323 ile %69, siCYTOR-779 ile %80; HCC1428 hücreleri için 5 nM siCYTOR-572 %88, siCYTOR-779 %76 oranında CYTOR ifadesi baskılandı. CYTOR'un 48 saatte hücre canlılığı üzerindeki baskılayıcı etkisi her iki hücre hattında görüldü. siRNA aracılı CYTOR susturulmasının hücrelerin migrasyon ve invazyon yeteneğini zayıflattığı gözlemlendi. Ayrıca qRT-PCR deneyi ile CYTOR'un baskılanmasının HİPPO yolu ana efektörlerinden olan YAP1 geni ve onun hedef genlerinden olan CTGF gen ifadesinde azalmaya neden olduğu bulundu.
Özet (Çeviri)
Breast cancer is one of the cancers with the highest incidence among women worldwide. Metastasis formation is one of the most important causes of mortality in breast cancer patients. In this study, the effects of CYTOR expression, which is the most common malignancy among women and shows molecular subtype heterogeneity, on cell viability, apoptosis and molecular mechanisms in metastasis processes after suppression of siRNA expression in breast breast cancer cell lines were investigated. The suppressive effects of different doses of CYTOR on MDA-MB-231 and HCC1428 (cisplatin-resistant human mammary gland epithelium stage IV adenocarcinoma) cells on cell proliferation after 24 and 48 hours were determined by 3-(4.5-Dimethyltriazol-2-yl)-2.5 diphenyltetrazolium bromide (MTT) method. In addition, its effect on apoptotic (Bax, Bcl-2) and metastatic process genes (YAP1, MST1, LATS1, CTGF, ECAD, NCAD) was determined using the RT-PCR method. As a result of the study, the expression levels of the CYTOR gene were determined in MDA-MB-231 and HCC1428 cell lines. Then, when compared with the negative control siRNA containing group, gene expression was suppressed by 60% with 5 nM siCYTOR-323 and 80% with siCYTOR-779 for MDA-MB-231 cells. CYTOR expression was suppressed by 88% with 5 nM siCYTOR-572 and 76% with siCYTOR-779 in HCC1428 cells. The suppressive effect of CYTOR on cell viability was observed in both cell lines at 48 hours. It was observed that siRNA-mediated CYTOR silencing weakened the migration and invasion ability of the cells. In addition, it was found with qRT-PCR experiment that suppression of CYTOR caused a decrease in the expression of the YAP1 gene, one of the main effectors of the HIPPO pathway, and the CTGF gene, one of its target genes.
Benzer Tezler
- Polidatinin meme kanseri üzerindeki anti-proliferatif ve apoptotik etkisinin uzun kodlanmayan RNA'lar üzerinden incelenmesi
Polidatinin meme kanseri üzerindeki anti-proliferatif ve apoptotik etkisinin uzun kodlanmayan RNA'lar üzerinden incelenmesi
CANAN YILMAZ KAPANCIK
- Uzun kodlamayan RNA ZEB2NAT‟ın MCF7 ve MDA-MB-231 meme kanseri hücre hatlarında EMT, metastaz ve apoptoz üzerinden etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of long noncoding RNA ZEB2NAT via EMT, metastasis and apoptosis in MCF7 and MDA-MB-231 breast cancer cell lines
CANAN EROĞLU
Doktora
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERCAN KURAR
- Malat1 ve B-MYB genlerin farklı kanser hücre hatlarında gen ekspresyonların ve apoptozisin araştırılması
Investigation of gene expressi̇on and apoptosis in different cancer cell lines of malat1 and B-MYB genes
HASAN DAĞLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN KILINÇ
- Hepatosellüler kanserde önemli bir LncRNA olan MIR100HG'nin transkripsiyonel regülasyonu
Transcriptional regulation of MIR100HG, an important LncRNA, in hepatocellular cancer
AYLİN TÜRKOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Moleküler TıpBalıkesir ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERAY KÖÇKAR
- Let-7C ifadesinin çeşitli meme kanser hücre hatlarında otofaji ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the effect of LET-7C expression on autophagy in breast cancer cell lines
SEÇİL DEMİRAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI