Sığırlarda GH ve PİT-1 Genlerinde CpG Metilasyon Düzeylerinin Belirlenmesi ve Bazı Süt Verim Özellikleri İle İlişkilendirilmesi
Determination Of Cpg Methylation Levels in GH and PİT-1 Genes and Their Associations with Some Milk Yield Traits in Cattle
- Tez No: 1022060
- Danışmanlar: PROF. DR. SİNAN KOPUZLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Zootekni Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Epigenetik terimi Conrad Waddington tarafından 1940'larda“Fenotipi meydana getiren genler ve bu genler aracılığıyla üretilen proteinler arasındaki nedensel etkileşimleri inceleyen bir biyoloji dalı”olarak tanımlandı. Epigenetik, bir genotipin belirli bir fenotipe ifadesini kontrol eden tüm moleküler yolu ifade etmekteydi. İlerleyen yıllarda genetik biliminin hızlı bir şekilde gelişmesiyle genel olarak "Mitotik ve/veya Mayotik olarak kalıtsal olan ve DNA dizisinde bir değişiklik olmaksızın gen fonksiyonundaki değişiklikler olarak kabul edilmektedir. Heterokromatin yapının ortaya çıkmasında rol aldığı düşünülen DNA Metilasyonu omurgalılarda CpG (C;sitozin-P;fosfat-G;Guanin) bölgelerine DNA metiltransferaz enzimi ile bir metil grubunun bağlanmasıyla gerçekleşir. Omurgalı genomunda CpG bölgeleri olarak adlandırdığımız yerler özellikle gen promotör bölgelerinde, yani genin başlangıcında normalden daha fazla bulunurlar. Genin başlangıcı CpG adacıkları tarafından işaretlenerek buraya bağlanacak moleküller için tanınma bölgesi oluşturur. Bu projenin ilk aşamasında yüz adet Esmer İsviçre ırkı sığırdan alınan kan örneklerinden DNA izole edilerek, süt protein genlerinden olan Growth ve Pit1 genlerinin ekzon bölgeleri için primer tasarlanacak ve bu genlerin RT-PCR ile % oranı hesaplayabileceğimiz Metilasyon Spesifik PCR (MSP) yöntemiyle metilasyon düzeylerinin araştırılması sağlanacaktır. Diğer aşamad belirlenen genlerin PCR-RFLP yöntemiyle polimorfizmleri belirlenecektir. Sonuçta elde edilen metilasyon ve polimorfizm değerleri verim ile ilişkilendirilerek yorumlanacaktır. Bu proje ile çiftlik hayvanlarında daha önce çalışılmamış genlerin metilasyon düzeyleri ve epigenetik mekanizmaları hakkında yeni bilgiler elde edilmiş olacaktır. Proje sonucunda ekonomik öneme sahip olan sığırlarda büyüme gelişimi ve süt veriminde etkili olan genlerin metilasyon düzeylerinin farklı yaş ve verim seviyesindeki hayvanlarda farklılık gösterdiği bu nedenle metilasyon seviyesi ile verim arasında ilişki olması, aynı sürü içerisinde metilasyon seviyelerinin ise aynı düzeyde çıkması beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
The term epigenetics was defined by Conrad Waddington in the 1940s as“a branch of biology that studies the causal interactions between the genes that make up the phenotype and the proteins produced by these genes”. Epigenetics refers to the entire molecular pathway that controls the expression of a genotype to a particular phenotype. In the following years, with the rapid development of genetics, it is generally accepted as "changes in gene function that are inherited as mitotic and/or meiotic and without a change in DNA sequence. DNA Methylation, which is thought to play a role in the emergence of heterochromatin structure, occurs by binding of a methyl group with DNA methyltransferase enzyme to the CpG (C; cytosine-P; phosphate-G; Guanine) regions in vertebrates. In the vertebrate genome, the places we call CpG regions are found more than normal especially in the gene promoter regions, that is, at the beginning of the gene. The beginning of the gene is marked by CpG islets, creating a recognition site for molecules to be bound there. In the first stage of this project, DNA will be isolated from blood samples taken from one hundred Brown Swiss cattle, and primers will be designed for the exon regions of Growth and Pit1 genes, which are milk protein genes, and the methylation levels of these genes will be investigated by Methylation Specific PCR (MSP) method, which we can calculate the % ratio of these genes by RT-PCR. will be provided. Polymorphisms of the genes determined in the other step will be determined by PCR-RFLP method. The resulting methylation and polymorphism values will be interpreted by associating them with the yield. With this project, new information will be obtained about the methylation levels and epigenetic mechanisms of genes that have not been studied before in farm animals. As a result of the project, it is expected that the methylation levels of the genes that are effective in growth and milk yield in cattle, which have economic importance, differ in animals of different ages and yield levels.
Benzer Tezler
- Orta anadolu bölgesinde yetiştirilen simental ırkı sığırlarda büyüme hormonu ve PIT-I gen polimorfizmlerine göre süt verimlerinin araştırılması
Investigation of milk yields according to growth hormone and pit-I gene polymorphisms in simmental cattle breed reared in middle anatolian region
MUSTAFA KORKMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLAL AKYÜZ
- Gebe diyabetlilere uygulanan beslenme ve insülin tedavisinin anne ve çocuk sağlığı üzerine etkilerinin incelenmesi
The effects of medical nutrition and insulin therapy on diabetic pregnant women and their children's health
HÜLYA GÖKMEN ÖZEL
Doktora
Türkçe
2004
Beslenme ve DiyetetikHacettepe ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. PERİHAN ARSLAN
- Yurt dışı yaşantısı geçiren ve geçirmeyen lise öğrencilerinin problemleri
Başlık çevirisi yok
SÜLEYMAN DOĞAN
Doktora
Türkçe
1988
PsikolojiHacettepe ÜniversitesiPsikolojik Danışma ve Rehberlik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YADİGAR KILIÇÇI
- Hareketli sulama makinalarında kullanılan sulama elamanlarının su dağılım yeknesaklığı üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
HÜSEYİN YÜRDEM
- Bazı Türk ve yabancı kaynaklı sigaralarda PAH'ların tanımlanması
Detection of PAH in Turkish and foreign cigarettes
IŞIK ÇEPNİ