VAN İLİNDE KOYUNLARDAN ELDE EDİLEN CYSTICERCUS TENUICOLLIS İZOLATLARININ MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU
Molecular Characterization of Cysticercus tenuicollis İsolates Obtained from Sheep in Van
- Tez No: 1023031
- Danışmanlar: PROF. DR. NALAN ÖZDAL
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Cysticercus tenuicollis, Taenia hydatigena, Cox1, Filogenetik Analiz, Koyun, Cysticercus tenuicollis, Taenia hydatigena, Cox1, Phylogenetic Analysis, Sheep
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bahçıvanoğlu İ, Van İlinde Koyunlardan Elde Edilen Cysticercus tenuicollis İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu, Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Parazitoloji Anabilim Dalı, Veteriner Programı, Yüksek Lisans Tezi, Van 2026. Taenia hydatigena'nın metasestod formu olan C. tenuicollis, ara konaklarda karaciğer migrasyonu sırasında oluşturduğu doku hasarı, organ imhaları ve verim kayıpları nedeniyle hayvancılıkta önemli ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bu çalışma, Van yöresinde koyunlardan elde edilen Cysticercus tenuicollis izolatlarının moleküler karakterizasyonunu ve enfeksiyonun prevalansını ortaya koymak amacıyla gerçekleştirilmiştir. Bu kapsamda, tür düzeyinde yüksek ayırt edicilik sağlaması ve maternal kalıtım özelliği nedeniyle mitokondriyal sitokrom c oksidaz alt birim 1 (mt-CO1/cox1) geni moleküler belirteç olarak tercih edilmiştir. Çalışmada, kist örneklerinden izole edilen genomik DNA'lar üzerinde PCR amplifikasyonu gerçekleştirilmiş, yaklaşık 400 bp uzunluğundaki amplikonlar çift yönlü Sanger dizileme yöntemiyle analiz edilmiştir. Elde edilen dizilerin biyoinformatik değerlendirilmesi sonucunda, tüm izolatların veri tabanındaki (NCBI) referans sekanslarla karşılaştırıldığında (BLAST) ortalama %98.96 benzerlik gösterdiği belirlenmiş ve tüm örnekler tür düzeyinde T. hydatigena olarak doğrulanmıştır. Nükleotit dizilerinin karşılaştırmalı analizinde yalnızca sınırlı sayıda polimorfik bölge tespit edilmiş olup, bu varyasyonların büyük çoğunluğunun A/G ve C/T geçiş (transition) mutasyonlarından oluştuğu görülmüştür. Maksimum olabilirlik (Maximum Likelihood) yöntemiyle oluşturulan filogenetik analizde ise Van izolatlarının Türkiye, İran, Çin, Hindistan, İtalya ve Irak kökenli referans izolatlarla aynı ana klad içerisinde kümelendiği ve yüksek genetik benzerlik sergilediği belirlenmiştir. Elde edilen bulgular, Van yöresindeki T. hydatigena popülasyonunun küresel popülasyonlarla uyumlu, genetik olarak büyük ölçüde korunmuş ve düşük varyasyon gösteren bir yapıya sahip olduğunu ortaya koymaktadır. Çalışmada 1935 koyunun 463'ü (%23.92) Cysticercus tenuicollis ile enfekte bulunmuştur. Enfeksiyon oranı dişi koyunlarda %34.70, erkek koyunlarda %18.38 idi. Koyunlardaki C. tenuicollis'lerin %68.4'ü mezenteriyum, %27.8'i omentum, %3.8'i karaciğer üzerinde bulunmuştur. Bu çalışma, bölgede T. hydatigena'nın moleküler epidemiyolojisine ilişkin temel veriler sunmakta, gelecekte yürütülecek popülasyon genetiği, epidemiyolojik araştırmalar ve parazit kontrol programları için önemli bir referans oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
Bahçıvanoğlu İ, Molecular Characterization of Cysticercus tenuicollis İsolates Obtained from Sheep in Van, University of Van Yuzuncu Yil, Institute of Health Sciences, Department of Parasitology, Master's Thesis Van, 2026. Cysticercus tenuicollis, the metacestode stage of Taenia hydatigena, is responsible for considerable economic losses in livestock production due to liver migration-associated tissue damage, organ condemnation, and reduced productivity in intermediate hosts. This study was conducted to molecularly characterize C. tenuicollis isolates obtained from sheep in the Van region of Türkiye and the prevalence of the infection. Owing to its maternal inheritance and high discriminatory power at the species level, the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (mt-CO1/cox1) gene was selected as the molecular marker. Genomic DNA extracted from cyst samples was subjected to PCR amplification, and approximately 400-bp amplicons were analyzed by bidirectional Sanger sequencing. Bioinformatic analysis of the obtained sequences revealed that all isolates exhibited an average similarity of 98.96% when compared to (BLAST) reference sequences in the database (NCBI), confirming all samples as T. hydatigena at the species level. Comparative nucleotide sequence analysis identified only a limited number of polymorphic sites, with most nucleotide substitutions consisting of A/G and C/T transition mutations. Phylogenetic analysis based on the Maximum Likelihood method demonstrated that the Van isolates clustered within the same major clade as reference isolates from Türkiye, Iran, China, India, Italy, and Iraq, indicating a high degree of genetic similarity. These findings suggest that the T. hydatigena population circulating in the Van region is genetically well conserved and exhibits low sequence variability consistent with global populations. In the study, 463 (23.92%) of 1935 sheep were found to be infected with Cysticercus tenuicollis. The infection rate was 34.70% in female sheep and 18.38% in male sheep. Of the C. tenuicollis cysts in sheep, 68.4% were found in the mesentery, 27.8% in the omentum and 3.8% in the liver. This study provides baseline data on the molecular epidemiology of T. hydatigena in the region and constitutes an important reference for future population genetic studies, epidemiological investigations, and parasite control strategies.
Benzer Tezler
- Van ilinde hidatidozlu koyunlarda echinococcus granulosus'un genetik yapılarının PCR yöntemi ile belirlenmesi
Definition of genetic structure with method PCR on sheeps with hidatidozis in the province Van
AYŞE SONA
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
ParazitolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. SERDAR DEĞER
- Koyumlardan izole edilen campylobacter türlerinin poliakrilamid Jel'de protein bantlarının analizi ile ayırımı
Differentitation of campylobacter species isolated from sheep by analysis of protein bandings profiles on polyacrylamide gels
AHMET ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. KEMAL GÜRTÜRK
- Florozisli koyunlarda antioksidan maddelerin incelenmesi
Invesatigation of antioxidant compounds of fluorotic sheep
İNCİ DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAT MERT
- Norduz koyunlarında mandibula'nın morfometrik ve anatomik olarak incelenmesi
Morphometric and anatomical investigation of the mandible in norduz sheep
MEHMET KARTAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiVeterinerlik Anatomisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN YILMAZ
- Norduz koyunlarında orbita'nın morfometrik incelenmesi
Morphometric examination of the orbit in norduz sheep
CİHAT ERGENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
AnatomiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiVeterinerlik Anatomisi Ana Bilim Dalı
PROF. HÜSEYİN KARADAĞ