Per-Arnt-Sim Kinaz'ın kanser moleküler patogenezindeki rolünün meme kanseri hücre hatlarında aydınlatılması
Elucidation of the role of Per-Arnt-Sim Kinase in the molecular pathogenesis of cancer in breast cancer cell lines
- Tez No: 1023090
- Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM TEKEDERELİ, PROF. DR. BÜLENT ÖZPOLAT
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Oncology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Apoptoz, EMG, Meme Kanseri, Onkojenik Sinyalizasyon, PASK, siRNA, Apoptosis, Breast Cancer, EMT, Oncogenic Signaling, PASK, siRNA
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İnönü Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Giriş: Meme kanseri, özellikle Üçlü Negatif Meme Kanseri (ÜNMK) alt tipinde görülen yüksek heterojenite, metastaz ve tedavi direnci nedeniyle önemli bir halk sağlığı sorunudur. Hücresel enerji sensörü olarak görev yapan Per-Arnt-Sim Kinaz'ın (PASK), proliferasyon, metabolik yeniden programlanma ve metastatik progresyon süreçlerinde rol oynadığı düşünülmektedir. Bu çalışmada PASK'ın meme kanseri patogenezindeki onkojenik etkileri ve terapötik hedef potansiyeli araştırılmıştır. Materyal ve Metot: Çalışmada MDA-MB-231, MDA-MB-436, BT474, MCF-7 ve normal meme epitel hücre hattı MCF10A kullanılmıştır. PASK ekspresyonu siRNA aracılı gen susturma ve seçici PASK inhibitörleri ile baskılanmıştır. Hücre canlılığı, proliferasyon, koloni oluşumu, apoptoz, mitokondriyal membran potansiyeli ve hücre döngüsü değişimleri MTS, koloni oluşum testi, Anneksin V/PI, Kaspaz-3/7, JC-1 akış sitometrisi ve Western blot yöntemleri ile değerlendirilmiştir. Ayrıca biyoinformatik analizlerle PASK ekspresyonunun prognostik önemi incelenmiştir. Bulgular: PASK siRNA uygulaması sonrası canlılık MDA-MB 231 hücrelerinde %42,67 ± 1,53, MCF7 hücrelerinde %49,00 ± 1,00'e gerilerken (p < 0,0001), koloni oluşturma kapasitesi %14,67 ± 2,52'ye düşmüş ve apoptotik hücre oranı %26,00 ± 1,00 seviyesine yükselmiştir. PASK inhibisyonu, mitokondriyal disfonksiyonu tetikleyerek MDA-MB 231 hücrelerinde düşük membran potansiyeline sahip popülasyonu %30,67 ± 0,58'e çıkarmıştır (p < 0,0001). Moleküler düzeyde Siklin D1 ekspresyonu %10,33 ± 3,51'e düşmüş, Bcl-2 seviyeleri %21,00 ± 1,00'e gerilemiştir. Doza bağımlı analizlerde 25 nmol PASK 10 siRNA dozu, SRC ve P-SRC ekspresyonlarını sırasıyla %30,67 ± 3,06 ve %25,67 ± 6,03'e çekerek en etkili inhibitör stratejisi olarak öne çıkmıştır. Bulgular, PASK'ın meme kanserinde proliferasyon, apoptoz direnci ve metastaz süreçlerinde rol oynayan merkezi bir onkojenik düzenleyici olabileceğine işaret etmektedir. Sonuç: Bulgular, PASK'ın meme kanserinde proliferasyon, apoptozdan kaçış ve metastatik progresyon süreçlerinde merkezi bir düzenleyici olabileceğini göstermektedir. PASK'ın özellikle agresif meme kanseri alt tiplerinde prognostik biyobelirteç ve hedefe yönelik tedaviler için güçlü bir terapötik hedef olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Introduction: Breast cancer remains a major public health challenge due to its high molecular heterogeneity, metastatic potential, and therapy resistance, particularly in Triple-Negative Breast Cancer (TNBC). Per-Arnt-Sim Kinase (PASK), a cellular energy-sensing kinase, has been implicated in proliferation, metabolic reprogramming, and metastatic progression. This study aimed to investigate the oncogenic role and therapeutic target potential of PASK in breast cancer pathogenesis. Materials and Methods: MDA-MB-231, MDA-MB-436, BT474, MCF-7, and MCF10A cells were used in this study. PASK expression was suppressed using siRNA-mediated gene silencing and selective PASK inhibitors. Cell viability, proliferation, colony formation, apoptosis, mitochondrial membrane potential, and cell cycle alterations were evaluated using MTT assay, colony formation assay, Annexin V/PI, Caspase-3/7, JC-1 flow cytometry, and Western blot analyses. In addition, bioinformatic analyses were performed to determine the prognostic significance of PASK expression. Results: Following PASK siRNA application, cell viability decreased to 42.67% ± 1.53% in MDA-MB 231 cells and 49.00% ± 1.00% in MCF7 cells (p < 0.0001), while colony formation capacity dropped to 14.67% ± 2.52% and the apoptotic cell rate increased to 26.00% ± 1.00% (p < 0.001). PASK inhibition triggered mitochondrial dysfunction, increasing the population with low mitochondrial membrane potential to 30.67% ± 0.58% in MDA-MB 231 cells (p < 0.0001). At the molecular level, Cyclin D1 expression decreased to 10.33% ± 3.51%, Bcl-2 levels declined to 21.00% ± 1.00% . In dose-dependent analyses, the 25 nmol PASK 10 siRNA dose emerged as the most effective inhibitory strategy, reducing SRC and P-SRC expression to 30.67% ± 3.06% and 25.67% ± 6.03%, respectively. These findings confirm that PASK acts as a central oncogenic regulator managing proliferation, apoptosis resistance, and metastasis in breast cancer. Conclusion: These findings indicate that PASK functions as a central regulator of proliferation, apoptosis evasion, and metastatic progression in breast cancer. PASK may serve as both a prognostic biomarker and a promising therapeutic target for the development of novel targeted therapies, particularly in aggressive breast cancer subtypes.
Benzer Tezler
- Structure based analysis of the interactions between PER-ARNT-SIM (PAS) domain containing proteins in circadian rhythm
Yapısal bilgiyi kullanarak PER-ARNT-SIM (PAS) bölgeleri içeren biyolojik saat proteinlerinin etkileşimlerinin analizi
SERAP BELDAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
BiyoistatistikKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM KESKİN
- Investigation of adenosine pathway under hypoxia in the context of NLRP11 and inflammation
Hipoksik koşullar altında adenozin yolağının NLRP11 ve enflamasyon çerçevesinde incelenmesi
MERİÇ TAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. CEREN ÇIRACI
- Investigation of the interaction between mouse cryptochrome-1 and leptin receptor overlapping Transcript Like-1
Fare leptin receptor overlapping transcript Like-1 (Leprotl1) ve Cryptochrome 1 (Cry1) proteinleri arasındaki etkileşimin incelenmesi
DERYA KABACAOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyokimyaKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HALİL KAVAKLI
- İstanbul Bizans mimarisinde kullanılan tuğlanın fiziksel ve mekanik özellikleri
Characteristics of brick used in Byzantine architecture in İstanbul
YEGAN KAHYA
- Pediyatrik hastalarda supraglottik hava yolu gerecinin yerleşiminin doğrulanmasında ultrasonografinin yeri
The role of ultrasonography in confirming supraglottic airway device placement in pediatric patients
BÜŞRA YAKA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Anestezi ve ReanimasyonKocaeli ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CAN AKSU