D vitamini reseptörü ve toll-like reseptör 2 genlerindekipolimorfizmlerin kırım kongo kanamalı ateşi hastalığının prognozu ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship between polymorphisms in vitamin D receptor and toll-like receptor 2 genes the prognosis of crimean-congo hemorrhagic fever
- Tez No: 1024982
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞEYDA BERK, ÖĞR. GÖR. AYŞE NUR PEKTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi, Prognoz, Vitamin D Reseptörü, Toll-like Reseptör 2, Gen Polimorfizmi, Moleküler genetik, Polimorfizm-genetik, Crimean–Congo Hemorrhagic Fever, Prognosis, Vitamin D Receptor, Toll-like Receptor 2, Gene Polymorphism, Molecular genetic, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Türkiye'de endemik olarak görülen ve yüksek mortalite riski taşıyan Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA) hastalığının klinik seyri ile konakçının genetik yatkınlığı arasındaki ilişkiyi incelemektedir. Çalışmanın temel amacı, doğuştan gelen bağışıklık sisteminin kritik bileşenlerinden olan Toll-Benzeri Reseptör 2 (TLR-2) ve immünomodülatör rolleriyle bilinen Vitamin D Reseptörü (VDR) genlerindeki tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP), hastalığın şiddeti ve seyri üzerinde belirleyici bir etkisinin olup olmadığını ortaya koymaktır. Araştırma kapsamında, KKKA tanısı almış hastalar klinik bulgularına göre“hafif”,“orta”ve“şiddetli”olmak üzere üç ana gruba ayrılmıştır. Genetik analizler için hastaların genomik DNA örnekleri kullanılmış; TLR-2 (rs3804099) ve VDR (rs731236) bölgeleri polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ve restriksiyon fragman uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemleriyle incelenmiştir. TLR-2 geni için 2258 G/A genotipleri, VDR geni için ise TaqI enzim kesim bölgeleri üzerinden genotipik dağılımlar belirlenmiştir. Benzer şekilde VDR gen bölgesindeki TaqI polimorfizmi analizlerinde de genotipler ile klinik şiddet skorları arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunamamıştır. Her iki gen bölgesi için de polimorfik varyantların dağılımı, hastalığın hafif seyretmesi veya şiddetli kliniğe ilerlemesi noktasında ayırt edici bir risk faktörü olarak öne çıkmamıştır. Sonuçlar KKKA patogenezinin oldukça karmaşık ve çok katmanlı olduğunu göstermektedir. TLR-2 ve VDR gibi bağışıklık yanıtında önemli roller üstlenen genlerin tekil polimorfizmlerinin, virüsün agresif immün kaçış mekanizmaları karşısında klinik sonucu değiştirmede yetersiz kaldığı değerlendirilmektedir. Özellikle KKKA virüsünün interferon sinyal yollarını güçlü bir şekilde inhibe etmesi ve sitokin fırtınasını tetiklemesi, bu tür tekil genetik varyasyonların etkisini maskeliyor olabilir. Bu çalışma, literatürde daha önce bildirilen bazı“genetik yatkınlık”varsayımlarının KKKA özelinde her popülasyon ve her gen bölgesi için geçerli olmayabileceğini kanıtlaması açısından önemlidir. TLR-2 ve VDR polimorfizmlerinin KKKA için bağımsız birer prognostik biyobelirteç olmadığını ortaya koymuş; hastalığın seyrini anlamak için tek gen odaklı yaklaşımlar yerine, epigenetik modifikasyonların ve çoklu gen etkileşimlerinin (poligenik risk skorları) incelendiği daha kapsamlı genomik çalışmaların gerekliliğini vurgulamıştır. Elde edilen bu sonuçlar, gelecekteki tanı ve tedavi stratejilerinde hangi genetik bölgelerin önceliklendirilmemesi gerektiğine dair literatüre değerli bir veri sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
This study investigates the relationship between the clinical course of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF), an endemic disease in Turkey with a high mortality risk, and the genetic predisposition of the host. The main objective of the study is to determine whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the Toll-Like Receptor 2 (TLR-2) gene, a critical component of the innate immune system, and the Vitamin D Receptor (VDR) gene, known for its immunomodulatory roles, have a decisive effect on the severity and course of the disease. In this study, patients diagnosed with CCHF were divided into three main groups based on their clinical findings:“mild,”“moderate,”and“severe.”Genomic DNA samples from the patients were used for genetic analysis; the TLR-2 (rs3804099) and VDR (rs731236) regions were examined using polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) methods. Genotypic distributions were determined for the TLR-2 gene via 2258 G/A genotypes and for the VDR gene via TaqI enzyme cleavage sites. Similarly, no statistically significant relationship was found between genotypes and clinical severity scores in TaqI polymorphism analyses in the VDR gene region. For both gene regions, the distribution of polymorphic variants did not emerge as a distinguishing risk factor in terms of mild or severe clinical progression of the disease. The results demonstrate that the pathogenesis of CCHF is quite complex and multifaceted. It is considered that individual polymorphisms of genes such as TLR-2 and VDR, which play important roles in the immune response, are insufficient to alter the clinical outcome in the face of the virus's aggressive immune evasion mechanisms. In particular, the fact that the CCHF virus strongly inhibits interferon signaling pathways and triggers a cytokine storm may mask the effect of such individual genetic variations. This study is important because it proves that some“genetic predisposition”assumptions previously reported in the literature may not be valid for every population and every gene region specific to CCHF. This study revealed that TLR-2 and VDR polymorphisms are not independent prognostic biomarkers for CCHF; it emphasized the need for more comprehensive genomic studies examining epigenetic modifications and multiple gene interactions (polygenic risk scores) instead of single-gene focused approaches to understand the course of the disease. These results provide valuable data to the literature regarding which genetic regions should not be prioritized in future diagnostic and treatment strategies.
Benzer Tezler
- Akne vulgaris patogenezinde D vitamini ve IL-17'nin rolünün değerlendirilmesi
Assessment of the role of vitamin D and IL-17 in the pathogenesis of acne vulgaris
AHMET ERDAL TOPAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
DermatolojiAdnan Menderes ÜniversitesiDeri ve Zührevi Hastalıklar Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EKİN BOZKURT ŞAVK
- Otistik bozukluklu çocuk hastalarda VDR gen polimorfizmi, VDR gen ekspresyonu ve VDR geni promotor metilasyonunun araştırılması
Investigation of VDR gene polymorphisms, VDR gene expression and VDR gene promoter methylation in children with autistic disorder
BURHAN BALTA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
GenetikErciyes ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUNİS DÜNDAR
- D vitamini reseptörü ve D vitamini bağlayıcı protein gen polimorfizmlerinin (rs2228570,rs1544410,rs7041 ve rs4588)'in ağız ve diş sağlığı üzerine etkisi
The effect of vitamin d receptor and vitamin d binding protein gene polymorphisms (rs2228570, rs1544410, rs7041 and rs4588) on oral and dental health
BAŞAK FUNDA EKEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Tıbbi BiyolojiMarmara ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KORKUT ULUCAN
- Kanser hastalarında D vitamini, kalsiyum ve fosfor düzeyleri ile d vitamini reseptörü polimorfizminin araştırılması
The investigation of vitamin D, calcium, phosphorus levels and vitamin D receptor polymorphism in cancer patients
NESLİ GÜLEKEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyokimyaGaziantep ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HÜLYA KANBUR ÇİÇEK
- Kolon kanserli hastalarda d vitamini reseptörü (VDR) ve östrojen reseptörü (ER) genlerine ait kritik polimorfizmlerin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
MÜCTEBA GÜNDÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Genel Cerrahiİstanbul ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAMAN TEKANT